More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6410 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6410  acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain protein  100 
 
 
385 aa  783    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603602 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2151  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  83.16 
 
 
383 aa  654    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3266  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  77.37 
 
 
385 aa  607  1e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  0.605117 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30500  butyryl-CoA dehydrogenase  78.48 
 
 
385 aa  609  1e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.262375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1974  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  82.15 
 
 
382 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00328212  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2187  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  75.79 
 
 
385 aa  598  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0034  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  76.44 
 
 
384 aa  596  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.211865  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0028  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  76.7 
 
 
384 aa  596  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6228  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  77.11 
 
 
383 aa  590  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0946  butyryl-CoA dehydrogenase  78.42 
 
 
384 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0982418  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1474  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  74.74 
 
 
384 aa  579  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6416  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  72.11 
 
 
384 aa  549  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1359  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  67.98 
 
 
381 aa  538  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0903405  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2247  butyryl-CoA dehydrogenase  69.27 
 
 
383 aa  533  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.176219  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4050  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  70.57 
 
 
383 aa  532  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.795074  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3629  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  72.56 
 
 
386 aa  531  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3634  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  72.56 
 
 
386 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0647428  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3702  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  72.56 
 
 
386 aa  531  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.646071  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12522  acyl-CoA dehydrogenase fadE19  71.2 
 
 
394 aa  522  1e-147  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1405  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  68.56 
 
 
391 aa  518  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000121185 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3319  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  70.08 
 
 
382 aa  520  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0405  butyryl-CoA dehydrogenase  70.45 
 
 
388 aa  518  1e-146  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2554  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  70.45 
 
 
386 aa  519  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1387  butyryl-CoA dehydrogenase  68.23 
 
 
387 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4089  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  72.03 
 
 
386 aa  512  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0445399  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06870  butyryl-CoA dehydrogenase  66.07 
 
 
395 aa  508  1e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3850  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  60.26 
 
 
388 aa  449  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.428744 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3506  butyryl-CoA dehydrogenase  58.46 
 
 
399 aa  449  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.428352  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1730  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  57.11 
 
 
396 aa  437  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.0345333 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0232  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  56.35 
 
 
382 aa  425  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08210  butyryl-CoA dehydrogenase  55.73 
 
 
394 aa  424  1e-117  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.249284 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2102  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  58.14 
 
 
394 aa  415  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.563951  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00480  butyryl-CoA dehydrogenase  52.99 
 
 
418 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0732  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.54 
 
 
379 aa  384  1e-105  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1707  butyryl-CoA dehydrogenase  53.78 
 
 
388 aa  383  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000836039  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.79 
 
 
380 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.87 
 
 
380 aa  364  1e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  50 
 
 
379 aa  359  4e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  50 
 
 
379 aa  359  4e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000286159 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  50 
 
 
379 aa  358  7e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  50 
 
 
379 aa  358  7e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  49.74 
 
 
379 aa  358  7e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6425  butyryl-CoA dehydrogenase  47.37 
 
 
380 aa  358  8e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766323  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  49.74 
 
 
379 aa  358  9e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  48.94 
 
 
379 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  49.47 
 
 
379 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  48.94 
 
 
379 aa  355  5e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.94 
 
 
381 aa  354  1e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.94 
 
 
379 aa  352  5e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.68 
 
 
381 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  48.15 
 
 
381 aa  350  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.34 
 
 
379 aa  350  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  48.15 
 
 
381 aa  350  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  48.41 
 
 
381 aa  349  4e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  48.41 
 
 
381 aa  349  4e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  48.15 
 
 
381 aa  349  6e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  48.15 
 
 
381 aa  349  6e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  48.15 
 
 
381 aa  349  6e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  48.15 
 
 
381 aa  348  7e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  47.88 
 
 
381 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3862  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.94 
 
 
379 aa  346  4e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2056  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.94 
 
 
377 aa  342  5e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.232194  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.88 
 
 
380 aa  341  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.23 
 
 
381 aa  340  2e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0081  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.33 
 
 
642 aa  330  2e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.56 
 
 
380 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.3 
 
 
382 aa  328  1.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  45.77 
 
 
379 aa  327  3e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1782  butyryl-CoA dehydrogenase  48.41 
 
 
379 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.257154  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.97 
 
 
376 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.83 
 
 
379 aa  326  5e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2163  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.01 
 
 
389 aa  325  9e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820192  normal  0.287496 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1150  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.93 
 
 
380 aa  325  1e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3108  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.53 
 
 
380 aa  325  1e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0585  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.01 
 
 
379 aa  322  8e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0202  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.56 
 
 
382 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221874  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2369  acyl-CoA dehydrogenase-like  45.24 
 
 
380 aa  319  5e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.77 
 
 
389 aa  318  1e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2584  butyryl-CoA dehydrogenase  43.73 
 
 
379 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2286  butyryl-CoA dehydrogenase  43.73 
 
 
379 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0319  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.44 
 
 
383 aa  316  5e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.339666  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  44.18 
 
 
376 aa  315  7e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  44.18 
 
 
376 aa  315  7e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  44.18 
 
 
381 aa  315  7e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1697  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.07 
 
 
386 aa  315  8e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0868604  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  44.18 
 
 
381 aa  315  9e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  44.18 
 
 
376 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  44.18 
 
 
376 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  44.18 
 
 
376 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  44.18 
 
 
376 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  43.92 
 
 
381 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0837  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.3 
 
 
390 aa  312  4.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3527  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.77 
 
 
386 aa  312  4.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.496474  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1932  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.15 
 
 
380 aa  311  7.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1076  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  44.81 
 
 
379 aa  311  9e-84  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.228764 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.62 
 
 
379 aa  311  9e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3002  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.68 
 
 
388 aa  310  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0249  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.91 
 
 
383 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.538468  normal  0.417839 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0140  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  43.92 
 
 
376 aa  308  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0132  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.83 
 
 
376 aa  308  9e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>