More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3064 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0310  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  65.6 
 
 		 563 aa  687    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0589554  normal  0.08283 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2186  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  63.93 
 
 		 562 aa  681    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0552217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4575  isovaleryl-CoA dehydrogenase  65.09 
 
 		 560 aa  671    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138907  hitchhiker  0.00955586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1059  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  60.71 
 
 		 569 aa  640    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.773265 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.07 
 
 		 555 aa  682    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1679  acyl-CoA dehydrogenase  63.14 
 
 		 548 aa  675    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0534807  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3064  isovaleryl-CoA dehydrogenase  100 
 
 		 563 aa  1149    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326905  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1613  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  67.23 
 
 		 568 aa  706    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2504  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  63.51 
 
 		 562 aa  670    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0530  Acyl-CoA dehydrogenase  60.75 
 
 		 560 aa  679    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0312  isovaleryl-CoA dehydrogenase  63.14 
 
 		 555 aa  678    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0204  acyl-CoA dehydrogenase  62.68 
 
 		 564 aa  685    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0731517  normal  0.952971 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4351  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  62.52 
 
 		 560 aa  682    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2444  isovaleryl-CoA dehydrogenase  61.82 
 
 		 567 aa  675    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.590306  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4511  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  64.3 
 
 		 560 aa  681    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.547594  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2228  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.51 
 
 		 562 aa  669    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489531  normal  0.489903 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2840  Acyl-CoA dehydrogenase  65.58 
 
 		 551 aa  669    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3795  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  61.43 
 
 		 528 aa  590  1e-167  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2897  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  59.36 
 
 		 527 aa  580  1e-164  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4224  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.78 
 
 		 400 aa  300  3e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0700017  normal  0.0824066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4180  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.48 
 
 		 383 aa  286  7e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2430  acyl-CoA dehydrogenase-like  43.86 
 
 		 385 aa  286  7e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000440313  normal  0.478447 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1583  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.43 
 
 		 412 aa  282  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266068  hitchhiker  0.00354782 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4427  Butyryl-CoA dehydrogenase  40.57 
 
 		 388 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000160956  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3825  butyryl-CoA dehydrogenase  40.05 
 
 		 400 aa  280  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4228  isovaleryl-CoA dehydrogenase  42.4 
 
 		 385 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.950044  normal  0.66405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0446  butyryl-CoA dehydrogenase  41.79 
 
 		 385 aa  278  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4635  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.94 
 
 		 386 aa  277  4e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0833  putative acyl-CoA dehydrogenase  41.25 
 
 		 385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815342 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4150  butyryl-CoA dehydrogenase  39.28 
 
 		 388 aa  274  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3108  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40 
 
 		 383 aa  273  4.0000000000000004e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4054  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.99 
 
 		 384 aa  273  7e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0673  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.36 
 
 		 400 aa  271  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4169  butyryl-CoA dehydrogenase  39.14 
 
 		 383 aa  269  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0614852  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4181  butyryl-CoA dehydrogenase  39.14 
 
 		 383 aa  269  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0181503  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0182  butyryl-CoA dehydrogenase  41.39 
 
 		 385 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0191  butyryl-CoA dehydrogenase  41.39 
 
 		 385 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0919  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.16 
 
 		 383 aa  268  2e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7768  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.72 
 
 		 397 aa  268  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2510  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.13 
 
 		 397 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0195405  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0171  butyryl-CoA dehydrogenase  41.13 
 
 		 385 aa  266  7e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.260341 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1139  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.56 
 
 		 399 aa  266  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.89 
 
 		 379 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4367  butyryl-CoA dehydrogenase  39.12 
 
 		 397 aa  266  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0727  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.64 
 
 		 398 aa  265  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2093  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.64 
 
 		 398 aa  265  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0300334  normal  0.0497691 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43420  putative acyl-CoA dehydrogenase  40 
 
 		 384 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0779209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3683  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.05 
 
 		 384 aa  264  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.685138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4085  putative acyl-CoA dehydrogenase  37.37 
 
 		 387 aa  264  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3642  putative acyl-CoA dehydrogenase  39.74 
 
 		 384 aa  263  6e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1740  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.96 
 
 		 397 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0177648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1759  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  38.96 
 
 		 397 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218239  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1806  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.96 
 
 		 397 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0221  butyryl-CoA dehydrogenase  41.18 
 
 		 385 aa  262  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1977  butyryl-CoA dehydrogenase  39.89 
 
 		 397 aa  261  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0220  acyl-CoA dehydrogenase  38.28 
 
 		 384 aa  260  4e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0793985  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2068  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.58 
 
 		 385 aa  259  7e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6335  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.27 
 
 		 386 aa  259  8e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0615  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.11 
 
 		 387 aa  259  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.210833  normal  0.0397055 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0148  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.34 
 
 		 385 aa  258  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7329  Acyl-CoA dehydrogenase  38.86 
 
 		 383 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0130  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.34 
 
 		 385 aa  257  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2167  butyryl-CoA dehydrogenase  38.36 
 
 		 399 aa  258  3e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.592182  normal  0.710802 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.41 
 
 		 386 aa  256  8e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0244674  normal  0.176746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0397  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.16 
 
 		 379 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1172  acyl-CoA dehydrogenase  36.79 
 
 		 384 aa  253  5.000000000000001e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.336122 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1233  acyl-CoA dehydrogenase-like  36.79 
 
 		 384 aa  253  5.000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.831269  normal  0.440096 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.5 
 
 		 376 aa  252  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1456  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.43 
 
 		 398 aa  251  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3451  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.43 
 
 		 377 aa  250  6e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1523  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.67 
 
 		 397 aa  249  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0413288  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0176  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.14 
 
 		 385 aa  249  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0274  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.89 
 
 		 382 aa  248  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.630772  normal  0.481537 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10217  acyl-CoA dehydrogenase fadE3  40.82 
 
 		 373 aa  248  3e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.36 
 
 		 380 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4073  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.05 
 
 		 386 aa  246  8e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.21 
 
 		 379 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  37.11 
 
 		 381 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  37.11 
 
 		 376 aa  244  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  37.11 
 
 		 376 aa  244  3e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  37.11 
 
 		 376 aa  244  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  37.11 
 
 		 376 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  37.11 
 
 		 381 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1932  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.82 
 
 		 380 aa  244  3.9999999999999997e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  36.86 
 
 		 381 aa  243  9e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  36.86 
 
 		 376 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  36.86 
 
 		 376 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4031  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.68 
 
 		 399 aa  241  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.328111  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1052  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.37 
 
 		 386 aa  242  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1318  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.95 
 
 		 384 aa  242  2e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0793911 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.57 
 
 		 380 aa  242  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0459  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.02 
 
 		 376 aa  242  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.672922 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0909  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.5 
 
 		 388 aa  240  5.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1078  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.53 
 
 		 383 aa  240  5.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1770  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.35 
 
 		 512 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4146  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.09 
 
 		 394 aa  239  8e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.954368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0364  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.46 
 
 		 386 aa  239  8e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2715  acyl-CoA dehydrogenase-like  35.4 
 
 		 391 aa  239  8e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.785448  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1804  butyryl-CoA dehydrogenase  38.78 
 
 		 386 aa  238  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2318  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.3 
 
 		 390 aa  238  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.759089  normal  0.0223321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>