More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0268 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0268  butyryl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
379 aa  782    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3931  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  65.44 
 
 
400 aa  532  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.543045 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0488  butyryl-CoA dehydrogenase  60.95 
 
 
379 aa  484  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00678793  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2584  butyryl-CoA dehydrogenase  55.67 
 
 
379 aa  450  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2286  butyryl-CoA dehydrogenase  55.67 
 
 
379 aa  450  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  54.35 
 
 
379 aa  443  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  54.88 
 
 
379 aa  435  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  54.62 
 
 
379 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  54.62 
 
 
379 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  54.35 
 
 
379 aa  432  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1782  butyryl-CoA dehydrogenase  56.73 
 
 
379 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.257154  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  54.62 
 
 
379 aa  429  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  54.62 
 
 
379 aa  430  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  54.62 
 
 
379 aa  430  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  54.62 
 
 
379 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000286159 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  54.62 
 
 
379 aa  430  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.83 
 
 
379 aa  427  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  54.35 
 
 
379 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3862  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.24 
 
 
379 aa  418  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0585  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.3 
 
 
379 aa  417  9.999999999999999e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.3 
 
 
380 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1076  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  51.45 
 
 
379 aa  408  1e-113  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.228764 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0656  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.13 
 
 
380 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.44 
 
 
381 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.99 
 
 
379 aa  403  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1697  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.45 
 
 
386 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0868604  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  52.24 
 
 
380 aa  397  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3778  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.13 
 
 
382 aa  396  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  0.271407 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0081  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.47 
 
 
642 aa  396  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.47 
 
 
380 aa  388  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2026  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.4 
 
 
641 aa  387  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000211003  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3040  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.74 
 
 
402 aa  388  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0629704  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.74 
 
 
380 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.54 
 
 
376 aa  382  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.41 
 
 
379 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.74 
 
 
379 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.6 
 
 
381 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1381  Butyryl-CoA dehydrogenase  48.68 
 
 
379 aa  381  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  48.41 
 
 
379 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2136  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.4 
 
 
380 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.281355 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  48.94 
 
 
381 aa  375  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0402  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.42 
 
 
380 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  48.94 
 
 
381 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  48.94 
 
 
381 aa  375  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.95 
 
 
381 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2056  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.87 
 
 
377 aa  377  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.232194  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  48.94 
 
 
381 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  48.94 
 
 
381 aa  375  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  48.94 
 
 
381 aa  375  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  47.75 
 
 
376 aa  374  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  47.75 
 
 
381 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  47.48 
 
 
376 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  48.68 
 
 
381 aa  372  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  47.48 
 
 
376 aa  372  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  47.48 
 
 
376 aa  371  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  48.68 
 
 
381 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  47.48 
 
 
376 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.81 
 
 
389 aa  373  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  47.48 
 
 
376 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  48.68 
 
 
381 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  47.75 
 
 
381 aa  373  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  48.01 
 
 
381 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5650  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.93 
 
 
377 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2192  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.6 
 
 
380 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.516178  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2281  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.6 
 
 
380 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2369  acyl-CoA dehydrogenase-like  47.49 
 
 
380 aa  368  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1665  butyryl-CoA dehydrogenase  49.34 
 
 
380 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0202  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.94 
 
 
382 aa  368  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221874  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1084  butyryl-CoA dehydrogenase  48.4 
 
 
377 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0155468 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1490  butyryl-CoA dehydrogenase  49.08 
 
 
378 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.21 
 
 
376 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0247  Acyl-CoA dehydrogenase  48.28 
 
 
378 aa  365  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3973  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.4 
 
 
377 aa  364  1e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.78306  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4086  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.4 
 
 
377 aa  364  1e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303595  normal  0.349393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0397  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.55 
 
 
379 aa  363  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0733  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.34 
 
 
377 aa  363  3e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5126  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.86 
 
 
377 aa  362  4e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.393324 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4146  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.28 
 
 
394 aa  362  4e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.954368  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3827  bytyryl-CoA dehydrogenase (short-chain-acyl-CoA dehydrogenase)  48.28 
 
 
379 aa  362  7.0000000000000005e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0583  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.02 
 
 
379 aa  358  9e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.394739 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4904  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.07 
 
 
377 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316996  normal  0.149852 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0364  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.81 
 
 
386 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3574  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.21 
 
 
377 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4385  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.81 
 
 
377 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351154  normal  0.113053 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0714  Acyl-CoA dehydrogenase  48.01 
 
 
377 aa  356  5e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0092  butyryl-CoA dehydrogenase  44.85 
 
 
378 aa  356  5e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0505  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.83 
 
 
561 aa  356  5e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3656  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.28 
 
 
377 aa  356  5e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4358  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.34 
 
 
381 aa  355  5.999999999999999e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0892384  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5323  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.01 
 
 
377 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00118834  normal  0.0149252 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4257  butyryl-CoA dehydrogenase  48.01 
 
 
377 aa  354  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.725306  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3404  acyl-CoA dehydrogenase-like  48.01 
 
 
377 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4963  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.01 
 
 
377 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0096  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  47.15 
 
 
378 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0160842  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2436  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.28 
 
 
383 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3492  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.01 
 
 
383 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3451  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.21 
 
 
377 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2307  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.76 
 
 
381 aa  350  2e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1803  acyl-CoA dehydrogenase  48.01 
 
 
377 aa  350  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545777  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0136  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.02 
 
 
379 aa  350  3e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>