149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3484 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3792  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  98.04 
 
 
358 aa  689    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.267616 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3484  acyl-CoA dehydrogenase type 2  100 
 
 
358 aa  702    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3866  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  89.5 
 
 
362 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0222771 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2837  putative acyl-CoA dehydrogenase  49.86 
 
 
375 aa  296  3e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.926618 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0305  putative acyl-CoA dehydrogenase  45.02 
 
 
376 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.1367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2613  putative acyl-CoA dehydrogenase family protein  43.77 
 
 
373 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.346291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5417  putative acyl-CoA dehydrogenase family protein  44.29 
 
 
373 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1706  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.43 
 
 
375 aa  236  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.087432  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1150  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  43.54 
 
 
397 aa  230  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.428628 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1309  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.24 
 
 
397 aa  228  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2211  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.43 
 
 
378 aa  228  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2174  putative acyl-CoA dehydrogenase  37.01 
 
 
382 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4820  putative acyl-CoA dehydrogenase  45.18 
 
 
375 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0970  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.34 
 
 
379 aa  216  5e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4852  acyl-CoA dehydrogenase-like  39.88 
 
 
395 aa  215  8e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.150232 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0038  putative acyl-CoA dehydrogenase  34.37 
 
 
360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4667  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  43.84 
 
 
396 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0171462  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0622  acyl-CoA dehydrogenase  35.22 
 
 
354 aa  199  3.9999999999999996e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00205931  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0160  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  29.45 
 
 
344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0165  hypothetical protein  29.45 
 
 
344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2627  hypothetical protein  31.17 
 
 
353 aa  129  7.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0414836  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0459  hypothetical protein  32.42 
 
 
367 aa  123  6e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0700  acyl-CoA dehydrogenase family protein  28.48 
 
 
354 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.564675  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1538  putative acyl-CoA dehydrogenase  32.87 
 
 
367 aa  116  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2274  acyl-CoA dehydrogenase  31.21 
 
 
354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.921595  normal  0.572718 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3638  acyl-CoA dehydrogenase, putative  31.97 
 
 
354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0587866  normal  0.442088 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2095  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  31.13 
 
 
354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.528653 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6334  putative acyl-CoA dehydrogenase  32.77 
 
 
371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5825  putative acyl-CoA dehydrogenase  33.71 
 
 
365 aa  109  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.803301 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34490  hypothetical protein  33.77 
 
 
355 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000897326  normal  0.153318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2929  hypothetical protein  31.56 
 
 
355 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3928  acyl-CoA dehydrogenase, putative  31.77 
 
 
366 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.438549  normal  0.0461862 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6511  hypothetical protein  33.24 
 
 
371 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6745  hypothetical protein  33.24 
 
 
371 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.839762  normal  0.367272 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0102  putative acyl-CoA dehydrogenase  33.24 
 
 
367 aa  93.6  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988493  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1452  acyl-CoA dehydrogenase  28.88 
 
 
350 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00428618  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6291  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.64 
 
 
379 aa  63.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3827  bytyryl-CoA dehydrogenase (short-chain-acyl-CoA dehydrogenase)  22.94 
 
 
379 aa  60.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0100  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25.88 
 
 
390 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0748  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.63 
 
 
393 aa  57.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.239157  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0502  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.57 
 
 
387 aa  57  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2780  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.79 
 
 
390 aa  57  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0393743 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06620  butyryl-CoA dehydrogenase  21.89 
 
 
380 aa  56.2  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.44 
 
 
389 aa  56.2  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4263  acyl-CoA dehydrogenase-like  26.24 
 
 
390 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.662141  normal  0.561312 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3360  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25.56 
 
 
410 aa  55.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.7 
 
 
379 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1371  butyryl-CoA dehydrogenase  25.88 
 
 
389 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.183303  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0714  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.24 
 
 
388 aa  54.3  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.0860013 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3693  isovaleryl-CoA dehydrogenase  26.24 
 
 
390 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6658  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.53 
 
 
390 aa  53.9  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38440  citronelloyl-CoA dehydrogenase, GnyD  25 
 
 
387 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4115  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.87 
 
 
390 aa  52.8  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2589  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.87 
 
 
390 aa  52.8  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000683478  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2033  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25 
 
 
387 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0666462  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3289  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.18 
 
 
390 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4987  acyl-CoA dehydrogenase family protein-like  22.07 
 
 
367 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.432457  normal  0.841072 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1739  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25.33 
 
 
390 aa  52  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4686  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.06 
 
 
393 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162224  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1603  isovaleryl-CoA dehydrogenase  27.81 
 
 
389 aa  51.2  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2119  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.12 
 
 
390 aa  50.4  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148025 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  21.97 
 
 
380 aa  50.1  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3933  Acyl-CoA dehydrogenase-like  25.34 
 
 
390 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1804  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.34 
 
 
390 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392184  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2727  isovaleryl-CoA dehydrogenase  22.65 
 
 
389 aa  49.7  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3274  citronelloyl-CoA dehydrogenase, GnyD  29.05 
 
 
387 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0289  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25 
 
 
391 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0226098  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0407  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25 
 
 
378 aa  49.7  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0136  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.58 
 
 
379 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5641  Butyryl-CoA dehydrogenase  22.09 
 
 
379 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1466  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25.94 
 
 
393 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429983  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2905  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.1 
 
 
387 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3127  acyl-CoA dehydrogenase-like  23.11 
 
 
393 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.105998  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5240  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.11 
 
 
393 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288959  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.19 
 
 
380 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0919  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.59 
 
 
383 aa  47.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2739  acyl-CoA dehydrogenase, putative  24.02 
 
 
447 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000377  isovaleryl-CoA dehydrogenase  28.26 
 
 
389 aa  47  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.749145  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.09 
 
 
379 aa  47  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6030  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.56 
 
 
391 aa  47  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5121  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.64 
 
 
393 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.975401  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4413  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25 
 
 
384 aa  47  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1345  acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain protein  24.88 
 
 
387 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.21 
 
 
380 aa  46.6  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2470  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.02 
 
 
387 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0293728  normal  0.0125727 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2584  butyryl-CoA dehydrogenase  22.25 
 
 
379 aa  46.6  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2286  butyryl-CoA dehydrogenase  22.25 
 
 
379 aa  46.6  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3387  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.18 
 
 
391 aa  46.2  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197098  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2068  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.25 
 
 
385 aa  46.2  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1264  acyl-CoA dehydrogenase-like  36.99 
 
 
404 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.51833  normal  0.675418 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3778  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.96 
 
 
382 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  0.271407 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4588  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.64 
 
 
393 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2121  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.27 
 
 
388 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.274166  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0167  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.2 
 
 
376 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1284  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.99 
 
 
404 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05480  acyl-CoA dehydrogenase  23.32 
 
 
389 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1359  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  24.19 
 
 
426 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1812  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.81 
 
 
387 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0871457  normal  0.415388 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5032  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.11 
 
 
393 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1329  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.77 
 
 
389 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.066051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>