188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0102 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0102  putative acyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
367 aa  719    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988493  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1538  putative acyl-CoA dehydrogenase  78.47 
 
 
367 aa  566  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6511  hypothetical protein  56.51 
 
 
371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6745  hypothetical protein  56.51 
 
 
371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.839762  normal  0.367272 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6334  putative acyl-CoA dehydrogenase  56.23 
 
 
371 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2274  acyl-CoA dehydrogenase  53.54 
 
 
354 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.921595  normal  0.572718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2929  hypothetical protein  52.65 
 
 
355 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2095  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  53.43 
 
 
354 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.528653 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3638  acyl-CoA dehydrogenase, putative  53.43 
 
 
354 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0587866  normal  0.442088 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34490  hypothetical protein  51.53 
 
 
355 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000897326  normal  0.153318 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0459  hypothetical protein  47.19 
 
 
367 aa  286  5.999999999999999e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5825  putative acyl-CoA dehydrogenase  51.45 
 
 
365 aa  285  5.999999999999999e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.803301 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0700  acyl-CoA dehydrogenase family protein  40.95 
 
 
354 aa  268  1e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.564675  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3928  acyl-CoA dehydrogenase, putative  48.72 
 
 
366 aa  264  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.438549  normal  0.0461862 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2627  hypothetical protein  42.02 
 
 
353 aa  228  9e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0414836  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0038  putative acyl-CoA dehydrogenase  29.86 
 
 
360 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0305  putative acyl-CoA dehydrogenase  29.8 
 
 
376 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.1367 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2174  putative acyl-CoA dehydrogenase  28.34 
 
 
382 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0970  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.68 
 
 
379 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0622  acyl-CoA dehydrogenase  28.41 
 
 
354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00205931  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4852  acyl-CoA dehydrogenase-like  30.06 
 
 
395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.150232 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3792  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  35.06 
 
 
358 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.267616 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3484  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.38 
 
 
358 aa  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2211  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.17 
 
 
378 aa  104  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2837  putative acyl-CoA dehydrogenase  31.18 
 
 
375 aa  103  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.926618 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2613  putative acyl-CoA dehydrogenase family protein  29.1 
 
 
373 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.346291 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1309  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.9 
 
 
397 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5417  putative acyl-CoA dehydrogenase family protein  28.98 
 
 
373 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1150  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  28.57 
 
 
397 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.428628 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0160  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  24.41 
 
 
344 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0165  hypothetical protein  24.41 
 
 
344 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1452  acyl-CoA dehydrogenase  29.44 
 
 
350 aa  89.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00428618  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3866  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  33.43 
 
 
362 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0222771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1706  putative acyl-CoA dehydrogenase  29.18 
 
 
375 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.087432  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4667  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  28.71 
 
 
396 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0171462  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4820  putative acyl-CoA dehydrogenase  29.18 
 
 
375 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0727  hypothetical protein  36.29 
 
 
224 aa  61.6  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0730349 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2576  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.61 
 
 
378 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3114  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.71 
 
 
364 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3005  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.71 
 
 
364 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02412  isovaleryl-CoA dehydrogenase  28.28 
 
 
389 aa  56.6  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.719746  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0407  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.96 
 
 
378 aa  56.2  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1665  butyryl-CoA dehydrogenase  26.72 
 
 
380 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1371  butyryl-CoA dehydrogenase  26.61 
 
 
389 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.183303  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1603  isovaleryl-CoA dehydrogenase  26.94 
 
 
389 aa  53.9  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04330  Isovaleryl-CoA dehydrogenase 2, mitochondrial precursor, putative  28.43 
 
 
417 aa  53.9  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2082  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.87 
 
 
376 aa  53.9  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4372  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.62 
 
 
374 aa  53.9  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.367452  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1529  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  27.37 
 
 
389 aa  53.9  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.845789  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2121  isovaleryl-CoA dehydrogenase  26.5 
 
 
388 aa  52.8  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.274166  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4257  butyryl-CoA dehydrogenase  29 
 
 
377 aa  52.8  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.725306  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0666  acyl-CoA dehydrogenase  22.76 
 
 
386 aa  52.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1288  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.03 
 
 
379 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.751821 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2925  isovaleryl-CoA dehydrogenase  26.42 
 
 
389 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2192  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.32 
 
 
380 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.516178  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2692  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.36 
 
 
386 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0824192  normal  0.331355 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2188  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26 
 
 
390 aa  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2265  putative acyl-CoA dehydrogenase  25.96 
 
 
386 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2137  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.8 
 
 
382 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.545271  normal  0.220827 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6843  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.87 
 
 
393 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1645  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25.76 
 
 
387 aa  51.2  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2062  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.08 
 
 
395 aa  51.2  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04688  Isovaleryl-coenzyme A dehydrogenase (EC 1.3.99.10) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6T5L6]  26.98 
 
 
431 aa  50.4  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480161  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1777  putative acyl-CoA dehydrogenase  28.77 
 
 
383 aa  50.8  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0345355  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3656  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25.51 
 
 
387 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.179163  normal  0.0293073 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1570  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.44 
 
 
383 aa  50.1  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0356  isovaleryl-CoA dehydrogenase  27.27 
 
 
392 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.969667  decreased coverage  0.00000934354 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4263  acyl-CoA dehydrogenase-like  27.23 
 
 
390 aa  49.7  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.662141  normal  0.561312 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26700  putative acyl-CoA dehydrogenase  25.36 
 
 
386 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.472617  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1777  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.38 
 
 
387 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0186488 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4064  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.38 
 
 
424 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322511  hitchhiker  0.0046695 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2281  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.91 
 
 
380 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2805  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.46 
 
 
386 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7011  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.98 
 
 
382 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655237 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2780  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.12 
 
 
390 aa  48.9  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0393743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4452  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.21 
 
 
384 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4118  Acyl-CoA dehydrogenase  29.68 
 
 
580 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.846783  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4014  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.5 
 
 
386 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0818  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.48 
 
 
381 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.372759  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.57 
 
 
380 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4249  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.22 
 
 
580 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.808927  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1857  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.52 
 
 
401 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6658  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25.13 
 
 
390 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01762  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  27.15 
 
 
385 aa  47.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.272038 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3662  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25 
 
 
387 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000131881 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3835  acyl-CoA dehydrogenase-like  34.13 
 
 
406 aa  47.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.951896 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2193  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.8 
 
 
382 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.918821  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23170  acyl-CoA dehydrogenase  26.43 
 
 
408 aa  47.8  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4272  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.22 
 
 
580 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0815  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.63 
 
 
377 aa  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0634302  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1804  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.29 
 
 
390 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392184  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0505  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.56 
 
 
561 aa  47.4  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3948  Acyl-CoA dehydrogenase-like  31.46 
 
 
385 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54725  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0616  acyl-CoA dehydrogenase-like  29.41 
 
 
358 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4671  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.22 
 
 
396 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.525963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1812  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25 
 
 
387 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0871457  normal  0.415388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4696  Acyl-CoA dehydrogenase-like  26.33 
 
 
378 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0700778  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4378  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.42 
 
 
381 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3367  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.99 
 
 
385 aa  47  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1874  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.77 
 
 
387 aa  46.6  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.33835  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>