145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0305 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0305  putative acyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 		 376 aa  769    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.1367 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1706  putative acyl-CoA dehydrogenase  52.91 
 
 		 375 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.087432  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2613  putative acyl-CoA dehydrogenase family protein  52.92 
 
 		 373 aa  365  1e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.346291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5417  putative acyl-CoA dehydrogenase family protein  52.3 
 
 		 373 aa  357  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4820  putative acyl-CoA dehydrogenase  50 
 
 		 375 aa  343  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0970  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.43 
 
 		 379 aa  329  4e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2837  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.46 
 
 		 375 aa  322  6e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.926618 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2211  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.43 
 
 		 378 aa  322  7e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0038  putative acyl-CoA dehydrogenase  40.28 
 
 		 360 aa  283  5.000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2174  putative acyl-CoA dehydrogenase  40.06 
 
 		 382 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4852  acyl-CoA dehydrogenase-like  40.11 
 
 		 395 aa  266  4e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.150232 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3792  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  45.51 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.267616 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3484  acyl-CoA dehydrogenase type 2  45.02 
 
 		 358 aa  257  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3866  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  45.32 
 
 		 362 aa  247  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0222771 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1150  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  39.66 
 
 		 397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.428628 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1309  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.14 
 
 		 397 aa  239  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4667  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  41.06 
 
 		 396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0171462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0622  acyl-CoA dehydrogenase  36.29 
 
 		 354 aa  213  4.9999999999999996e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00205931  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0160  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  28.86 
 
 		 344 aa  162  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0165  hypothetical protein  28.86 
 
 		 344 aa  162  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2627  hypothetical protein  30.94 
 
 		 353 aa  156  5.0000000000000005e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0414836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2274  acyl-CoA dehydrogenase  30.82 
 
 		 354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.921595  normal  0.572718 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0700  acyl-CoA dehydrogenase family protein  28.71 
 
 		 354 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.564675  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2095  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  30.82 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.528653 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2929  hypothetical protein  29.8 
 
 		 355 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3638  acyl-CoA dehydrogenase, putative  30.32 
 
 		 354 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0587866  normal  0.442088 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1538  putative acyl-CoA dehydrogenase  28.57 
 
 		 367 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34490  hypothetical protein  31 
 
 		 355 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000897326  normal  0.153318 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0459  hypothetical protein  27 
 
 		 367 aa  109  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0102  putative acyl-CoA dehydrogenase  30.99 
 
 		 367 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3928  acyl-CoA dehydrogenase, putative  29.61 
 
 		 366 aa  106  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.438549  normal  0.0461862 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6511  hypothetical protein  28.66 
 
 		 371 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6745  hypothetical protein  28.66 
 
 		 371 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.839762  normal  0.367272 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6334  putative acyl-CoA dehydrogenase  28.66 
 
 		 371 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5825  putative acyl-CoA dehydrogenase  28.95 
 
 		 365 aa  90.5  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.803301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1452  acyl-CoA dehydrogenase  29.01 
 
 		 350 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00428618  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2245  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  21.47 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4413  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.22 
 
 		 384 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2727  isovaleryl-CoA dehydrogenase  21.83 
 
 		 389 aa  55.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1362  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.32 
 
 		 389 aa  55.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.431847 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1029  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  20 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239684  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2780  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  21.49 
 
 		 371 aa  54.3  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0227253  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3656  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.06 
 
 		 387 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.179163  normal  0.0293073 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2082  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  21.83 
 
 		 376 aa  53.5  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2570  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  21.47 
 
 		 389 aa  53.1  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4700  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.07 
 
 		 384 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.201387  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1345  acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain protein  23.04 
 
 		 387 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3662  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  21.9 
 
 		 387 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000131881 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1812  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  21.9 
 
 		 387 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0871457  normal  0.415388 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.21 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3274  citronelloyl-CoA dehydrogenase, GnyD  22.58 
 
 		 387 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1275  acyl-CoA dehydrogenase  23.96 
 
 		 385 aa  51.2  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0481  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.34 
 
 		 363 aa  50.8  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2638  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.39 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2132  butyryl-CoA dehydrogenase  22.8 
 
 		 388 aa  50.4  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.627987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.01 
 
 		 381 aa  50.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  21.25 
 
 		 381 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  21.25 
 
 		 381 aa  50.4  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38440  citronelloyl-CoA dehydrogenase, GnyD  22.58 
 
 		 387 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  19.95 
 
 		 379 aa  50.1  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.95 
 
 		 379 aa  49.7  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3289  isovaleryl-CoA dehydrogenase  22.31 
 
 		 390 aa  49.7  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4064  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  21.64 
 
 		 424 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322511  hitchhiker  0.0046695 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0947  isovaleryl-CoA dehydrogenase  22.02 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818935  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4987  acyl-CoA dehydrogenase family protein-like  20.62 
 
 		 367 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.432457  normal  0.841072 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28760  acyl-CoA dehydrogenase  21.62 
 
 		 382 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12851  normal  0.0971486 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1777  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  21.64 
 
 		 387 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186488 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0585  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  19.06 
 
 		 379 aa  49.3  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4372  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.48 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.367452  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  21.62 
 
 		 381 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0589  acyl-CoA dehydrogenase-like  25.94 
 
 		 380 aa  48.9  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371996  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3057  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.36 
 
 		 396 aa  48.1  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0264  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  21.6 
 
 		 394 aa  48.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0644181  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001547  branched-chain acyl-CoA dehydrogenase  21.13 
 
 		 384 aa  48.9  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  20.92 
 
 		 381 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  21.62 
 
 		 381 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2188  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.73 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  21.35 
 
 		 381 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  21.35 
 
 		 381 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3779  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25.36 
 
 		 396 aa  47.8  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0656  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  19.56 
 
 		 380 aa  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  21.35 
 
 		 381 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3778  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.95 
 
 		 382 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  0.271407 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  21.08 
 
 		 381 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3040  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  20.11 
 
 		 402 aa  47  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0629704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6410  acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain protein  22 
 
 		 385 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603602 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6366  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  20.71 
 
 		 387 aa  47  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3108  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.79 
 
 		 380 aa  47  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0232  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  20.65 
 
 		 382 aa  46.6  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2136  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  21.98 
 
 		 380 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.281355 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  21.18 
 
 		 381 aa  46.2  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2739  acyl-CoA dehydrogenase, putative  21.98 
 
 		 447 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0732  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.57 
 
 		 379 aa  46.2  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1340  butyryl-CoA dehydrogenase  19.84 
 
 		 385 aa  46.2  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.92296  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0241  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.27 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1377  butyryl-CoA dehydrogenase  20.32 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0267981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5641  Butyryl-CoA dehydrogenase  23.78 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0459  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.1 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4353  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  20.87 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4214  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  20.64 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.234142  normal  0.067843 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>