252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4820 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4820  putative acyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
375 aa  731    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1706  putative acyl-CoA dehydrogenase  78.67 
 
 
375 aa  546  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.087432  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0305  putative acyl-CoA dehydrogenase  50 
 
 
376 aa  349  5e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.1367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2613  putative acyl-CoA dehydrogenase family protein  44.35 
 
 
373 aa  277  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.346291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5417  putative acyl-CoA dehydrogenase family protein  43.49 
 
 
373 aa  273  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2837  putative acyl-CoA dehydrogenase  44.48 
 
 
375 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.926618 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0970  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.36 
 
 
379 aa  262  6e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2211  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.63 
 
 
378 aa  256  5e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2174  putative acyl-CoA dehydrogenase  36.66 
 
 
382 aa  241  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4852  acyl-CoA dehydrogenase-like  40.33 
 
 
395 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.150232 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0038  putative acyl-CoA dehydrogenase  33.98 
 
 
360 aa  233  3e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3484  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.81 
 
 
358 aa  232  9e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3792  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  44.38 
 
 
358 aa  226  4e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.267616 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3866  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  44.05 
 
 
362 aa  211  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0222771 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1150  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  38.44 
 
 
397 aa  202  7e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.428628 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1309  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.23 
 
 
397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4667  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  37.3 
 
 
396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0171462  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0622  acyl-CoA dehydrogenase  32.08 
 
 
354 aa  177  2e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00205931  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0165  hypothetical protein  23.94 
 
 
344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0160  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  23.94 
 
 
344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2627  hypothetical protein  29.49 
 
 
353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0414836  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34490  hypothetical protein  34.92 
 
 
355 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000897326  normal  0.153318 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3928  acyl-CoA dehydrogenase, putative  32.92 
 
 
366 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.438549  normal  0.0461862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2929  hypothetical protein  35.33 
 
 
355 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2274  acyl-CoA dehydrogenase  31.01 
 
 
354 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.921595  normal  0.572718 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0459  hypothetical protein  28.9 
 
 
367 aa  89  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2095  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  31.65 
 
 
354 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.528653 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3638  acyl-CoA dehydrogenase, putative  31.65 
 
 
354 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0587866  normal  0.442088 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6511  hypothetical protein  29.43 
 
 
371 aa  86.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6745  hypothetical protein  29.43 
 
 
371 aa  86.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.839762  normal  0.367272 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6334  putative acyl-CoA dehydrogenase  29.43 
 
 
371 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0700  acyl-CoA dehydrogenase family protein  25.08 
 
 
354 aa  83.2  0.000000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.564675  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1538  putative acyl-CoA dehydrogenase  29.41 
 
 
367 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1452  acyl-CoA dehydrogenase  28.77 
 
 
350 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00428618  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0102  putative acyl-CoA dehydrogenase  28.2 
 
 
367 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988493  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5825  putative acyl-CoA dehydrogenase  30.53 
 
 
365 aa  68.9  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.803301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2187  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.8 
 
 
385 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6410  acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain protein  25.34 
 
 
385 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603602 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.99 
 
 
379 aa  59.7  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2638  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.2 
 
 
387 aa  59.7  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  21.05 
 
 
389 aa  59.7  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001547  branched-chain acyl-CoA dehydrogenase  27.27 
 
 
384 aa  58.9  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0946  butyryl-CoA dehydrogenase  26.18 
 
 
384 aa  58.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0982418  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0585  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.33 
 
 
379 aa  58.5  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0264  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.71 
 
 
394 aa  57.4  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0644181  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.93 
 
 
382 aa  57.4  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1026  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.66 
 
 
402 aa  57  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0319  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.92 
 
 
383 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.339666  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08440  acyl-CoA dehydrogenase  24.14 
 
 
389 aa  56.6  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.231358  normal  0.194083 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05484  acyl-CoA dehydrogenase  25.34 
 
 
384 aa  56.2  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4987  acyl-CoA dehydrogenase family protein-like  19.1 
 
 
367 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.432457  normal  0.841072 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2151  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.62 
 
 
383 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2188  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.56 
 
 
387 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4413  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.02 
 
 
384 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28760  acyl-CoA dehydrogenase  23.87 
 
 
382 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12851  normal  0.0971486 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0155  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.27 
 
 
388 aa  55.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000954759  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.06 
 
 
381 aa  55.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  23.16 
 
 
379 aa  54.7  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2589  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.55 
 
 
390 aa  54.7  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000683478  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2369  acyl-CoA dehydrogenase-like  22.91 
 
 
380 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0405  butyryl-CoA dehydrogenase  25.18 
 
 
388 aa  54.3  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4115  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.55 
 
 
390 aa  54.7  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4214  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  21.82 
 
 
386 aa  53.5  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.234142  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2353  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  27.07 
 
 
378 aa  53.5  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663187  normal  0.71414 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  25 
 
 
381 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  25 
 
 
376 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0656  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.56 
 
 
380 aa  53.1  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0232  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.62 
 
 
382 aa  53.5  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3266  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.64 
 
 
385 aa  53.1  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  0.605117 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2632  hypothetical protein  23.96 
 
 
385 aa  53.1  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2502  hypothetical protein  23.96 
 
 
385 aa  53.1  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1076  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  23.2 
 
 
379 aa  52.4  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.228764 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  24.62 
 
 
376 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0034  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.67 
 
 
384 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.211865  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  24.62 
 
 
376 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4353  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.67 
 
 
385 aa  52.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  24.62 
 
 
376 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6366  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.81 
 
 
387 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  24.62 
 
 
376 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4530  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.66 
 
 
389 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.335652  normal  0.412983 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.1 
 
 
376 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1647  acyl-CoA dehydrogenase  23.32 
 
 
385 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.658516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  24.62 
 
 
376 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  24.24 
 
 
381 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06870  butyryl-CoA dehydrogenase  23.47 
 
 
395 aa  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  25 
 
 
381 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1598  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.84 
 
 
383 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1719  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  21.89 
 
 
389 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.86 
 
 
376 aa  50.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04655  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  25 
 
 
392 aa  50.8  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0505  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  21.24 
 
 
561 aa  50.8  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0203  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.48 
 
 
503 aa  50.8  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0481  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.75 
 
 
363 aa  50.8  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1679  acyl-CoA dehydrogenase family protein  24.2 
 
 
385 aa  50.4  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  21.64 
 
 
380 aa  50.4  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1232  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  20.4 
 
 
381 aa  50.4  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  23.58 
 
 
379 aa  50.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1974  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.81 
 
 
382 aa  50.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00328212  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3451  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.11 
 
 
377 aa  50.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0300  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.23 
 
 
388 aa  50.1  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>