252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1706 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1706  putative acyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
375 aa  742    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.087432  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4820  putative acyl-CoA dehydrogenase  78.67 
 
 
375 aa  557  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0305  putative acyl-CoA dehydrogenase  52.91 
 
 
376 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.1367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5417  putative acyl-CoA dehydrogenase family protein  46.97 
 
 
373 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2613  putative acyl-CoA dehydrogenase family protein  46.46 
 
 
373 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.346291 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2837  putative acyl-CoA dehydrogenase  46.8 
 
 
375 aa  300  3e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.926618 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0970  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.55 
 
 
379 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2211  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.79 
 
 
378 aa  278  1e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3484  acyl-CoA dehydrogenase type 2  47.43 
 
 
358 aa  258  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3792  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  46.99 
 
 
358 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.267616 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4852  acyl-CoA dehydrogenase-like  39.62 
 
 
395 aa  246  6e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.150232 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0038  putative acyl-CoA dehydrogenase  34.93 
 
 
360 aa  245  9.999999999999999e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2174  putative acyl-CoA dehydrogenase  35.58 
 
 
382 aa  238  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3866  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  45.54 
 
 
362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0222771 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1150  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  37.57 
 
 
397 aa  207  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.428628 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1309  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.84 
 
 
397 aa  202  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0622  acyl-CoA dehydrogenase  34.2 
 
 
354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00205931  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4667  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  36.77 
 
 
396 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0171462  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0165  hypothetical protein  24.65 
 
 
344 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0160  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  24.65 
 
 
344 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2627  hypothetical protein  29.15 
 
 
353 aa  126  6e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0414836  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3928  acyl-CoA dehydrogenase, putative  32.29 
 
 
366 aa  110  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.438549  normal  0.0461862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2929  hypothetical protein  33.33 
 
 
355 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34490  hypothetical protein  33.45 
 
 
355 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000897326  normal  0.153318 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2274  acyl-CoA dehydrogenase  31.55 
 
 
354 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.921595  normal  0.572718 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2095  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  31.58 
 
 
354 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.528653 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0459  hypothetical protein  28.62 
 
 
367 aa  97.4  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3638  acyl-CoA dehydrogenase, putative  31.58 
 
 
354 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0587866  normal  0.442088 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1538  putative acyl-CoA dehydrogenase  30.97 
 
 
367 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0700  acyl-CoA dehydrogenase family protein  25.88 
 
 
354 aa  88.2  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.564675  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6511  hypothetical protein  28.01 
 
 
371 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6745  hypothetical protein  28.01 
 
 
371 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.839762  normal  0.367272 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6334  putative acyl-CoA dehydrogenase  27.73 
 
 
371 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0102  putative acyl-CoA dehydrogenase  28.52 
 
 
367 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988493  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1452  acyl-CoA dehydrogenase  28.67 
 
 
350 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00428618  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0481  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.69 
 
 
363 aa  66.2  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5825  putative acyl-CoA dehydrogenase  27.92 
 
 
365 aa  66.2  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.803301 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4987  acyl-CoA dehydrogenase family protein-like  22.22 
 
 
367 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.432457  normal  0.841072 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0319  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.95 
 
 
383 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.339666  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.35 
 
 
382 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2187  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.71 
 
 
385 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3778  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.74 
 
 
382 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  0.271407 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4353  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.2 
 
 
385 aa  61.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4413  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.01 
 
 
384 aa  60.5  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0946  butyryl-CoA dehydrogenase  26.91 
 
 
384 aa  58.9  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0982418  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.71 
 
 
379 aa  59.3  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4214  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.47 
 
 
386 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.234142  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28760  acyl-CoA dehydrogenase  21.9 
 
 
382 aa  57.4  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12851  normal  0.0971486 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0249  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.38 
 
 
383 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.538468  normal  0.417839 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1897  isovaleryl-CoA dehydrogenase  21.67 
 
 
389 aa  55.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4115  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.16 
 
 
390 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6366  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.25 
 
 
387 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2589  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.16 
 
 
390 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000683478  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2322  isovaleryl-CoA dehydrogenase  21.67 
 
 
389 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2188  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.03 
 
 
387 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3274  citronelloyl-CoA dehydrogenase, GnyD  24.54 
 
 
387 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0656  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.52 
 
 
380 aa  55.5  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1647  acyl-CoA dehydrogenase  22.59 
 
 
385 aa  54.7  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.658516  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6410  acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain protein  23.59 
 
 
385 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603602 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2394  isovaleryl-CoA dehydrogenase  21.67 
 
 
389 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.869835 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1672  isovaleryl-CoA dehydrogenase  21.67 
 
 
389 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2151  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.1 
 
 
383 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4228  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.64 
 
 
385 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.950044  normal  0.66405 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3656  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.58 
 
 
387 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.179163  normal  0.0293073 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0585  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  20.6 
 
 
379 aa  54.7  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  24.11 
 
 
379 aa  54.7  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08210  butyryl-CoA dehydrogenase  23.79 
 
 
394 aa  54.3  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.249284 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  21.86 
 
 
379 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08440  acyl-CoA dehydrogenase  21.89 
 
 
389 aa  53.9  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.231358  normal  0.194083 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  21.01 
 
 
389 aa  54.3  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  22.28 
 
 
379 aa  53.5  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3827  bytyryl-CoA dehydrogenase (short-chain-acyl-CoA dehydrogenase)  22.84 
 
 
379 aa  53.9  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0167  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.4 
 
 
376 aa  53.5  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  22.38 
 
 
381 aa  53.1  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  22.38 
 
 
381 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1812  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.08 
 
 
387 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0871457  normal  0.415388 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0405  butyryl-CoA dehydrogenase  25.37 
 
 
388 aa  53.1  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00824  acyl-CoA dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14850)  22.56 
 
 
439 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.04 
 
 
381 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  22.31 
 
 
381 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0264  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.14 
 
 
394 aa  52.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0644181  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0171  butyryl-CoA dehydrogenase  22.78 
 
 
385 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.260341 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0732  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.87 
 
 
379 aa  52  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3662  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.08 
 
 
387 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000131881 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0182  butyryl-CoA dehydrogenase  22.5 
 
 
385 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30500  butyryl-CoA dehydrogenase  23.9 
 
 
385 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.262375 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38440  citronelloyl-CoA dehydrogenase, GnyD  23.45 
 
 
387 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0191  butyryl-CoA dehydrogenase  22.5 
 
 
385 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297032  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2739  acyl-CoA dehydrogenase, putative  22.64 
 
 
447 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  22.31 
 
 
381 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3005  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.28 
 
 
364 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3114  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.28 
 
 
364 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2846  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  21.11 
 
 
389 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0155  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.05 
 
 
388 aa  51.2  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000954759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  22.04 
 
 
381 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  22.04 
 
 
381 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  22.04 
 
 
381 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2638  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.58 
 
 
387 aa  50.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6291  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  21.04 
 
 
379 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  21.96 
 
 
381 aa  50.8  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>