104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1150 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1150  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  100 
 
 		 397 aa  796    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.428628 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4667  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  88.92 
 
 		 396 aa  679    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0171462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1309  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  96.98 
 
 		 397 aa  757    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4852  acyl-CoA dehydrogenase-like  61.39 
 
 		 395 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.150232 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2174  putative acyl-CoA dehydrogenase  51.92 
 
 		 382 aa  377  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0970  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.2 
 
 		 379 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2211  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.41 
 
 		 378 aa  273  5.000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2613  putative acyl-CoA dehydrogenase family protein  41.95 
 
 		 373 aa  269  5e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.346291 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0038  putative acyl-CoA dehydrogenase  39.14 
 
 		 360 aa  263  4.999999999999999e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5417  putative acyl-CoA dehydrogenase family protein  43.1 
 
 		 373 aa  256  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2837  putative acyl-CoA dehydrogenase  42.34 
 
 		 375 aa  251  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.926618 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0305  putative acyl-CoA dehydrogenase  39.66 
 
 		 376 aa  235  8e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.1367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3484  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.54 
 
 		 358 aa  228  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3792  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  42.64 
 
 		 358 aa  222  7e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.267616 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3866  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  43.54 
 
 		 362 aa  210  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0222771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1706  putative acyl-CoA dehydrogenase  37.57 
 
 		 375 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.087432  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4820  putative acyl-CoA dehydrogenase  38.44 
 
 		 375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0622  acyl-CoA dehydrogenase  34.71 
 
 		 354 aa  179  7e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00205931  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0160  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  28.01 
 
 		 344 aa  143  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0165  hypothetical protein  28.01 
 
 		 344 aa  143  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2627  hypothetical protein  29.68 
 
 		 353 aa  137  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0414836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2929  hypothetical protein  33.6 
 
 		 355 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0459  hypothetical protein  29.9 
 
 		 367 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34490  hypothetical protein  32 
 
 		 355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000897326  normal  0.153318 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2274  acyl-CoA dehydrogenase  29.66 
 
 		 354 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.921595  normal  0.572718 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3928  acyl-CoA dehydrogenase, putative  29.63 
 
 		 366 aa  103  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.438549  normal  0.0461862 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2095  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  29.1 
 
 		 354 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.528653 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3638  acyl-CoA dehydrogenase, putative  29.1 
 
 		 354 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0587866  normal  0.442088 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1538  putative acyl-CoA dehydrogenase  28.57 
 
 		 367 aa  93.6  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6334  putative acyl-CoA dehydrogenase  29.69 
 
 		 371 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6511  hypothetical protein  28.85 
 
 		 371 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6745  hypothetical protein  28.85 
 
 		 371 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.839762  normal  0.367272 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0102  putative acyl-CoA dehydrogenase  28.66 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1452  acyl-CoA dehydrogenase  26.24 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00428618  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0700  acyl-CoA dehydrogenase family protein  24.22 
 
 		 354 aa  72  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.564675  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5825  putative acyl-CoA dehydrogenase  27.56 
 
 		 365 aa  70.1  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.803301 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1359  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  24.7 
 
 		 426 aa  62  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4257  butyryl-CoA dehydrogenase  26.22 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.725306  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1645  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.23 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0481  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.45 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4987  acyl-CoA dehydrogenase family protein-like  23.15 
 
 		 367 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.432457  normal  0.841072 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3778  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25 
 
 		 382 aa  53.9  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  0.271407 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0067  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.42 
 
 		 394 aa  53.9  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6366  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.16 
 
 		 387 aa  50.4  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1498  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.96 
 
 		 382 aa  50.1  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4358  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.51 
 
 		 381 aa  49.7  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0892384  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1281  butyryl-CoA dehydrogenase  23.31 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.33384  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4085  putative acyl-CoA dehydrogenase  22.96 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0833  putative acyl-CoA dehydrogenase  23.28 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815342 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1390  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  21.89 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4062  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  21.89 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3973  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.6 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.78306  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0615  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.26 
 
 		 387 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.210833  normal  0.0397055 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4086  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.6 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303595  normal  0.349393 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04688  Isovaleryl-coenzyme A dehydrogenase (EC 1.3.99.10) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6T5L6]  23.34 
 
 		 431 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38440  citronelloyl-CoA dehydrogenase, GnyD  22.65 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0241  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.87 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1126  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.94 
 
 		 373 aa  48.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1084  butyryl-CoA dehydrogenase  25.33 
 
 		 377 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0155468 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0167  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.14 
 
 		 376 aa  47.4  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5650  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.26 
 
 		 377 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3274  citronelloyl-CoA dehydrogenase, GnyD  22.65 
 
 		 387 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0714  butyryl-CoA dehydrogenase  28.16 
 
 		 384 aa  47  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1897  isovaleryl-CoA dehydrogenase  21.69 
 
 		 389 aa  46.6  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3779  isovaleryl-CoA dehydrogenase  26.62 
 
 		 396 aa  46.2  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2846  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  21.1 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1458  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.48 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.499178 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3057  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.62 
 
 		 396 aa  46.2  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1381  Butyryl-CoA dehydrogenase  21.49 
 
 		 379 aa  46.2  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.56 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4214  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  21.99 
 
 		 386 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.234142  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2589  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.83 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000683478  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4115  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.83 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1362  isovaleryl-CoA dehydrogenase  27.59 
 
 		 389 aa  45.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.431847 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2828  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  21.1 
 
 		 389 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4743  butyryl-CoA dehydrogenase  21.69 
 
 		 417 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0407  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.11 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1530  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  21.1 
 
 		 389 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.295941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1288  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.25 
 
 		 379 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.751821 
 
 
-
 
NC_002950  PG1076  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  19.58 
 
 		 379 aa  44.7  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.228764 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2739  acyl-CoA dehydrogenase, putative  24.02 
 
 		 447 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2322  isovaleryl-CoA dehydrogenase  21.68 
 
 		 389 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2394  isovaleryl-CoA dehydrogenase  22.16 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.869835 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1672  isovaleryl-CoA dehydrogenase  22.16 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1335  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.17 
 
 		 379 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.254429  normal  0.854455 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1608  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.83 
 
 		 388 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0385936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2973  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  21.1 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.698816  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2909  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.99 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05570  acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  25.71 
 
 		 377 aa  44.3  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.213032 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0666  acyl-CoA dehydrogenase  22.1 
 
 		 386 aa  44.3  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2727  isovaleryl-CoA dehydrogenase  21.97 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  21.19 
 
 		 379 aa  44.3  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0232  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.46 
 
 		 382 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0100  isovaleryl-CoA dehydrogenase  22.64 
 
 		 390 aa  43.9  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1750  acyl-CoA dehydrogenase  23.71 
 
 		 381 aa  43.5  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.317107 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3223  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  21.79 
 
 		 389 aa  43.5  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0153994 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0684  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.14 
 
 		 379 aa  43.5  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456474  normal  0.877291 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3360  isovaleryl-CoA dehydrogenase  27.89 
 
 		 410 aa  43.1  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2062  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  21.7 
 
 		 395 aa  43.1  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4530  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  21.75 
 
 		 389 aa  43.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.335652  normal  0.412983 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>