More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0407 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0407  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
378 aa  781    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0167  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  59.04 
 
 
376 aa  473  1e-132  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1964  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.53 
 
 
380 aa  430  1e-119  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0994062  hitchhiker  0.0000000000216258 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1918  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.52 
 
 
379 aa  416  9.999999999999999e-116  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2780  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.98 
 
 
371 aa  276  3e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0227253  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1179  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  40.98 
 
 
392 aa  265  7e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  38.67 
 
 
379 aa  264  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1381  Butyryl-CoA dehydrogenase  37.84 
 
 
379 aa  260  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3040  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.6 
 
 
402 aa  259  6e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0629704  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.52 
 
 
379 aa  258  8e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.63 
 
 
379 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.08 
 
 
376 aa  255  9e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3778  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.79 
 
 
382 aa  252  6e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  0.271407 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06620  butyryl-CoA dehydrogenase  38.52 
 
 
380 aa  252  6e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  37.53 
 
 
381 aa  252  7e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  37.53 
 
 
376 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  37.53 
 
 
376 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  37.53 
 
 
376 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  37.26 
 
 
376 aa  251  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1175  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.61 
 
 
381 aa  250  2e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  37.26 
 
 
376 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  37.26 
 
 
381 aa  250  3e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  37.26 
 
 
376 aa  249  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2307  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.8 
 
 
381 aa  249  4e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4358  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.07 
 
 
381 aa  248  9e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0892384  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.89 
 
 
381 aa  248  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  36.99 
 
 
381 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0539  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.27 
 
 
405 aa  246  3e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00283131 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0585  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.06 
 
 
379 aa  246  4e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0656  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.67 
 
 
380 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  36.61 
 
 
381 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  36.61 
 
 
381 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  36.61 
 
 
381 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  36.61 
 
 
381 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1131  butyryl-CoA dehydrogenase  37.4 
 
 
392 aa  246  6e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00519609  hitchhiker  0.000110962 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  36.61 
 
 
381 aa  245  8e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  36.61 
 
 
381 aa  245  8e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  36.61 
 
 
381 aa  245  8e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  36.61 
 
 
381 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.61 
 
 
381 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  36.61 
 
 
381 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.44 
 
 
376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1232  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.43 
 
 
381 aa  243  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  37.84 
 
 
379 aa  243  3.9999999999999997e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2163  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.98 
 
 
389 aa  243  5e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820192  normal  0.287496 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2909  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.27 
 
 
389 aa  242  9e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214496  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2068  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.9 
 
 
385 aa  242  1e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2382  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.03 
 
 
389 aa  241  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.93 
 
 
379 aa  241  1e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.73 
 
 
381 aa  241  1e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0136  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.25 
 
 
379 aa  241  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0364  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.89 
 
 
386 aa  241  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1076  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  35.52 
 
 
379 aa  239  4e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.228764 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0232  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.23 
 
 
382 aa  239  4e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2136  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.7 
 
 
380 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.281355 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4391  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.7 
 
 
386 aa  239  5.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1804  butyryl-CoA dehydrogenase  37.5 
 
 
386 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.47 
 
 
379 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1318  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.36 
 
 
384 aa  239  8e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0793911 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.47 
 
 
380 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2584  butyryl-CoA dehydrogenase  35.68 
 
 
379 aa  238  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2286  butyryl-CoA dehydrogenase  35.68 
 
 
379 aa  238  2e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0488  butyryl-CoA dehydrogenase  36.34 
 
 
379 aa  237  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00678793  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.62 
 
 
389 aa  237  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4023  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.41 
 
 
379 aa  237  3e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3451  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.03 
 
 
377 aa  237  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2901  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.07 
 
 
379 aa  236  5.0000000000000005e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4146  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.25 
 
 
394 aa  236  7e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.954368  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1085  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.87 
 
 
373 aa  235  8e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.863384  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1436  butyryl-CoA dehydrogenase  35.13 
 
 
410 aa  235  8e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.170652  hitchhiker  0.00553945 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6291  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.89 
 
 
379 aa  235  9e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.34 
 
 
380 aa  235  9e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3931  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.33 
 
 
400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.543045 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0733  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.78 
 
 
377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2281  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.25 
 
 
380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0583  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.25 
 
 
379 aa  233  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.394739 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.89 
 
 
380 aa  233  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1665  butyryl-CoA dehydrogenase  38.52 
 
 
380 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2192  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.25 
 
 
380 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.516178  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0503  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.2 
 
 
379 aa  232  6e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.97 
 
 
380 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1697  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.42 
 
 
386 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0868604  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2056  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.07 
 
 
377 aa  231  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.232194  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3775  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.22 
 
 
386 aa  230  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0730  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.07 
 
 
381 aa  229  4e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3822  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.96 
 
 
379 aa  229  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.962066  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3002  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.07 
 
 
388 aa  229  5e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1390  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.61 
 
 
390 aa  229  5e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2695  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.25 
 
 
382 aa  229  7e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5641  Butyryl-CoA dehydrogenase  35.52 
 
 
379 aa  229  8e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1126  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.69 
 
 
373 aa  229  9e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0714  Acyl-CoA dehydrogenase  35.69 
 
 
377 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3527  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.77 
 
 
386 aa  228  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.496474  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3827  bytyryl-CoA dehydrogenase (short-chain-acyl-CoA dehydrogenase)  35.58 
 
 
379 aa  228  1e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3108  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.7 
 
 
383 aa  228  1e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1777  putative acyl-CoA dehydrogenase  36.89 
 
 
383 aa  228  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0345355  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0456  butyryl-CoA dehydrogenase  34.49 
 
 
410 aa  227  2e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.820933  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4904  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.97 
 
 
377 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316996  normal  0.149852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4385  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.97 
 
 
377 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351154  normal  0.113053 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2609  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.13 
 
 
382 aa  227  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0826134 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>