188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3866 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3866  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  100 
 
 
362 aa  708    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0222771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3792  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  90.06 
 
 
358 aa  620  1e-177  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.267616 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3484  acyl-CoA dehydrogenase type 2  89.5 
 
 
358 aa  620  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2837  putative acyl-CoA dehydrogenase  50.29 
 
 
375 aa  288  7e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.926618 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0305  putative acyl-CoA dehydrogenase  46.22 
 
 
376 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.1367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2613  putative acyl-CoA dehydrogenase family protein  44.68 
 
 
373 aa  249  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.346291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5417  putative acyl-CoA dehydrogenase family protein  44.94 
 
 
373 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1706  putative acyl-CoA dehydrogenase  46.22 
 
 
375 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.087432  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0970  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.76 
 
 
379 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1150  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  43.54 
 
 
397 aa  227  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.428628 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1309  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.24 
 
 
397 aa  224  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2174  putative acyl-CoA dehydrogenase  37.88 
 
 
382 aa  224  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2211  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.32 
 
 
378 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4852  acyl-CoA dehydrogenase-like  39.88 
 
 
395 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.150232 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4820  putative acyl-CoA dehydrogenase  44.41 
 
 
375 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0038  putative acyl-CoA dehydrogenase  35.36 
 
 
360 aa  211  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4667  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  44.44 
 
 
396 aa  210  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0171462  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0622  acyl-CoA dehydrogenase  36.12 
 
 
354 aa  203  5e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00205931  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0160  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  29.5 
 
 
344 aa  159  8e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0165  hypothetical protein  29.5 
 
 
344 aa  159  8e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2627  hypothetical protein  29.43 
 
 
353 aa  125  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0414836  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0459  hypothetical protein  31.79 
 
 
367 aa  114  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0700  acyl-CoA dehydrogenase family protein  28.74 
 
 
354 aa  111  3e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.564675  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2274  acyl-CoA dehydrogenase  31.48 
 
 
354 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.921595  normal  0.572718 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3638  acyl-CoA dehydrogenase, putative  30.52 
 
 
354 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0587866  normal  0.442088 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1538  putative acyl-CoA dehydrogenase  32.19 
 
 
367 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2095  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  30.72 
 
 
354 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.528653 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34490  hypothetical protein  33.11 
 
 
355 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000897326  normal  0.153318 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5825  putative acyl-CoA dehydrogenase  31.37 
 
 
365 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.803301 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2929  hypothetical protein  31.15 
 
 
355 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6334  putative acyl-CoA dehydrogenase  32.76 
 
 
371 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3928  acyl-CoA dehydrogenase, putative  32.14 
 
 
366 aa  99.8  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.438549  normal  0.0461862 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6511  hypothetical protein  32.19 
 
 
371 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6745  hypothetical protein  32.19 
 
 
371 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.839762  normal  0.367272 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0102  putative acyl-CoA dehydrogenase  32.8 
 
 
367 aa  86.3  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988493  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1452  acyl-CoA dehydrogenase  26.92 
 
 
350 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00428618  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6291  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25 
 
 
379 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38440  citronelloyl-CoA dehydrogenase, GnyD  27.83 
 
 
387 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3360  isovaleryl-CoA dehydrogenase  26.54 
 
 
410 aa  60.5  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0502  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.71 
 
 
387 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3693  isovaleryl-CoA dehydrogenase  28.38 
 
 
390 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5641  Butyryl-CoA dehydrogenase  23.93 
 
 
379 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6658  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25.93 
 
 
390 aa  57.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3274  citronelloyl-CoA dehydrogenase, GnyD  31.58 
 
 
387 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06620  butyryl-CoA dehydrogenase  21.73 
 
 
380 aa  57  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3827  bytyryl-CoA dehydrogenase (short-chain-acyl-CoA dehydrogenase)  23.17 
 
 
379 aa  57  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4686  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.42 
 
 
393 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162224  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0100  isovaleryl-CoA dehydrogenase  26.37 
 
 
390 aa  56.2  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.12 
 
 
379 aa  56.2  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0714  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.73 
 
 
388 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.0860013 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0289  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.42 
 
 
391 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0226098  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.29 
 
 
379 aa  55.8  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2589  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.24 
 
 
390 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000683478  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1804  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.27 
 
 
390 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392184  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3933  Acyl-CoA dehydrogenase-like  27.03 
 
 
390 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4263  acyl-CoA dehydrogenase-like  26.85 
 
 
390 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.662141  normal  0.561312 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4115  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.24 
 
 
390 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2033  isovaleryl-CoA dehydrogenase  26.96 
 
 
387 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0666462  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1345  acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain protein  26.96 
 
 
387 aa  53.5  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4413  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.02 
 
 
384 aa  53.1  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.71 
 
 
380 aa  53.1  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1371  butyryl-CoA dehydrogenase  22.51 
 
 
389 aa  53.1  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.183303  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.32 
 
 
380 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3127  acyl-CoA dehydrogenase-like  25.47 
 
 
393 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.105998  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5240  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.47 
 
 
393 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288959  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2905  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.76 
 
 
387 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0356  isovaleryl-CoA dehydrogenase  31.54 
 
 
392 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.969667  decreased coverage  0.00000934354 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2119  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.58 
 
 
390 aa  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148025 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2584  butyryl-CoA dehydrogenase  23.38 
 
 
379 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2286  butyryl-CoA dehydrogenase  23.38 
 
 
379 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4700  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.76 
 
 
384 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.201387  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3289  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.16 
 
 
390 aa  50.4  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5121  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25 
 
 
393 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.975401  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2318  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25 
 
 
390 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.759089  normal  0.0223321 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1329  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.19 
 
 
389 aa  50.1  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.066051  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1466  isovaleryl-CoA dehydrogenase  26.83 
 
 
393 aa  50.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429983  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2245  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  22.75 
 
 
389 aa  50.1  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5032  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.47 
 
 
393 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4588  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25 
 
 
393 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1603  isovaleryl-CoA dehydrogenase  27.7 
 
 
389 aa  49.7  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0822  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.65 
 
 
394 aa  49.7  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2727  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.68 
 
 
389 aa  49.3  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3157  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.5 
 
 
388 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.535585 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3562  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.47 
 
 
393 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.364762 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1948  isovaleryl-CoA dehydrogenase  26.27 
 
 
387 aa  49.3  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113187  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4987  acyl-CoA dehydrogenase family protein-like  20.79 
 
 
367 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.432457  normal  0.841072 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1120  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.72 
 
 
408 aa  49.3  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1739  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.32 
 
 
390 aa  49.3  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6030  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.98 
 
 
391 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2739  acyl-CoA dehydrogenase, putative  30.34 
 
 
447 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0423  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.53 
 
 
414 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.733872  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3387  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.89 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197098  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3822  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.71 
 
 
379 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.962066  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2470  isovaleryl-CoA dehydrogenase  31.03 
 
 
387 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0293728  normal  0.0125727 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3018  Acyl-CoA dehydrogenase  26.09 
 
 
407 aa  47.8  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0136  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.86 
 
 
379 aa  47.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4371  isovaleryl-CoA dehydrogenase  31.88 
 
 
395 aa  47.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3466  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25 
 
 
393 aa  47.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360992  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00824  acyl-CoA dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14850)  23.2 
 
 
439 aa  47.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1549  butyryl-CoA dehydrogenase  23.58 
 
 
387 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.431805  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>