More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2211 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_2211  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  100 
 
 
378 aa  781    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0038  putative acyl-CoA dehydrogenase  54.87 
 
 
360 aa  393  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0970  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  52.72 
 
 
379 aa  378  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0305  putative acyl-CoA dehydrogenase  45.43 
 
 
376 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.1367 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4852  acyl-CoA dehydrogenase-like  44.53 
 
 
395 aa  310  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.150232 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2837  putative acyl-CoA dehydrogenase  42.9 
 
 
375 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.926618 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2613  putative acyl-CoA dehydrogenase family protein  46.75 
 
 
373 aa  306  5.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.346291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5417  putative acyl-CoA dehydrogenase family protein  47.13 
 
 
373 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2174  putative acyl-CoA dehydrogenase  44.23 
 
 
382 aa  301  1e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1309  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.88 
 
 
397 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1150  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  41.41 
 
 
397 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.428628 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1706  putative acyl-CoA dehydrogenase  40.79 
 
 
375 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.087432  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4667  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  40.8 
 
 
396 aa  254  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0171462  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4820  putative acyl-CoA dehydrogenase  38.63 
 
 
375 aa  243  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3484  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.43 
 
 
358 aa  225  9e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3792  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  38.57 
 
 
358 aa  220  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.267616 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0622  acyl-CoA dehydrogenase  37.03 
 
 
354 aa  206  4e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00205931  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3866  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  39.32 
 
 
362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0222771 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0160  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  28.85 
 
 
344 aa  155  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0165  hypothetical protein  28.85 
 
 
344 aa  155  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2627  hypothetical protein  28.01 
 
 
353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0414836  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0700  acyl-CoA dehydrogenase family protein  29.37 
 
 
354 aa  119  6e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.564675  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2274  acyl-CoA dehydrogenase  27.41 
 
 
354 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.921595  normal  0.572718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2929  hypothetical protein  30.23 
 
 
355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34490  hypothetical protein  30.87 
 
 
355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000897326  normal  0.153318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2095  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  27.09 
 
 
354 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.528653 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3638  acyl-CoA dehydrogenase, putative  27.09 
 
 
354 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0587866  normal  0.442088 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0459  hypothetical protein  27.22 
 
 
367 aa  106  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3928  acyl-CoA dehydrogenase, putative  27.65 
 
 
366 aa  104  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.438549  normal  0.0461862 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1452  acyl-CoA dehydrogenase  26.27 
 
 
350 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00428618  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1538  putative acyl-CoA dehydrogenase  24.93 
 
 
367 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0102  putative acyl-CoA dehydrogenase  26.95 
 
 
367 aa  94.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988493  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3313  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.82 
 
 
384 aa  94.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06620  butyryl-CoA dehydrogenase  24.93 
 
 
380 aa  93.6  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6511  hypothetical protein  24.56 
 
 
371 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6745  hypothetical protein  24.56 
 
 
371 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.839762  normal  0.367272 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6334  putative acyl-CoA dehydrogenase  24.2 
 
 
371 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02412  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.8 
 
 
389 aa  91.7  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.719746  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4413  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.03 
 
 
384 aa  89.7  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6366  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  21.37 
 
 
387 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.27 
 
 
380 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28760  acyl-CoA dehydrogenase  22.53 
 
 
382 aa  89.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12851  normal  0.0971486 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4214  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.13 
 
 
386 aa  88.6  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.234142  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3301  acyl-CoA dehydrogenase-like  23.66 
 
 
381 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.168826 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.2 
 
 
380 aa  87.4  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1029  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.55 
 
 
387 aa  86.7  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239684  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1647  acyl-CoA dehydrogenase  22.13 
 
 
385 aa  86.7  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.658516  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5825  putative acyl-CoA dehydrogenase  25.35 
 
 
365 aa  86.7  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.803301 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001547  branched-chain acyl-CoA dehydrogenase  23.06 
 
 
384 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2558  acyl-CoA dehydrogenase-like  24.33 
 
 
381 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.35 
 
 
389 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1941  butyryl-CoA dehydrogenase  22.34 
 
 
385 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2570  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.61 
 
 
389 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1787  hypothetical protein  25.27 
 
 
389 aa  84.3  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1788  hypothetical protein  25.27 
 
 
389 aa  84.7  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1471  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.73 
 
 
401 aa  84.3  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.129109  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3656  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.88 
 
 
387 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.179163  normal  0.0293073 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4700  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.54 
 
 
384 aa  83.6  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.201387  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.93 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2120  Acyl-CoA dehydrogenase-like  23.48 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.270517  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2188  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  21.31 
 
 
387 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2121  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.49 
 
 
388 aa  82  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.274166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0949  acyl-CoA dehydrogenase-like  23.16 
 
 
385 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0416018  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4686  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.44 
 
 
393 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162224  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3281  acyl-CoA dehydrogenase-like  23.72 
 
 
395 aa  82.8  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1232  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  21.04 
 
 
381 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1812  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.06 
 
 
387 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0871457  normal  0.415388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3662  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.06 
 
 
387 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000131881 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0837  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.55 
 
 
390 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0135  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.74 
 
 
393 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.9 
 
 
380 aa  80.9  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4064  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25 
 
 
424 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322511  hitchhiker  0.0046695 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4588  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.5 
 
 
393 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1466  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.54 
 
 
393 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429983  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1777  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.06 
 
 
387 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0186488 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2589  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.97 
 
 
390 aa  79.7  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000683478  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4115  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.97 
 
 
390 aa  79.7  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0103  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.47 
 
 
393 aa  79.7  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2727  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.71 
 
 
389 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0137  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.07 
 
 
393 aa  79.7  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0129  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.07 
 
 
393 aa  79.3  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0423  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.16 
 
 
414 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.733872  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3937  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.66 
 
 
385 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.818683  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.72 
 
 
379 aa  79  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3466  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.5 
 
 
393 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360992  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05484  acyl-CoA dehydrogenase  22.78 
 
 
384 aa  79  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.64 
 
 
378 aa  79  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.295515  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0279  acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  25.07 
 
 
393 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.236676  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1719  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  21.05 
 
 
389 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2739  acyl-CoA dehydrogenase, putative  24.3 
 
 
447 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6291  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.93 
 
 
379 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2470  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.36 
 
 
387 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0293728  normal  0.0125727 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0471  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.27 
 
 
393 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3579  acyl-CoA dehydrogenase  23.68 
 
 
381 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.740274 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3093  acyl-CoA dehydrogenase-like  23.81 
 
 
382 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.224598 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0960  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.98 
 
 
393 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.433991  normal  0.388602 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2322  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.58 
 
 
389 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2394  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.58 
 
 
389 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.869835 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1340  butyryl-CoA dehydrogenase  22.07 
 
 
385 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.92296  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54630  acyl-CoA dehydrogenase  22.74 
 
 
387 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169112 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>