More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2828 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1530  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  99.74 
 
 		 389 aa  798    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.295941  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4064  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  77.66 
 
 		 424 aa  640    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322511  hitchhiker  0.0046695 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1458  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  94.09 
 
 		 389 aa  759    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.499178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3662  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  77.66 
 
 		 387 aa  642    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000131881 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1897  isovaleryl-CoA dehydrogenase  96.92 
 
 		 389 aa  775    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2739  acyl-CoA dehydrogenase, putative  77.92 
 
 		 447 aa  650    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05480  acyl-CoA dehydrogenase  77.89 
 
 		 389 aa  637    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1812  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  78.18 
 
 		 387 aa  647    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0871457  normal  0.415388 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3223  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  94.34 
 
 		 389 aa  757    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0153994 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2470  isovaleryl-CoA dehydrogenase  77.66 
 
 		 387 aa  645    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0293728  normal  0.0125727 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2121  isovaleryl-CoA dehydrogenase  79.48 
 
 		 388 aa  645    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.274166  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2797  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  93.83 
 
 		 389 aa  752    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3656  isovaleryl-CoA dehydrogenase  79.48 
 
 		 387 aa  652    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.179163  normal  0.0293073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3274  citronelloyl-CoA dehydrogenase, GnyD  79.74 
 
 		 387 aa  659    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2973  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  98.97 
 
 		 389 aa  791    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.698816  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1719  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  97.17 
 
 		 389 aa  747    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2245  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  93.06 
 
 		 389 aa  749    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2828  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 		 389 aa  800    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2570  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  93.32 
 
 		 389 aa  746    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02412  isovaleryl-CoA dehydrogenase  80.72 
 
 		 389 aa  664    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.719746  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2925  isovaleryl-CoA dehydrogenase  80.15 
 
 		 389 aa  656    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1777  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  77.66 
 
 		 387 aa  640    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186488 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2033  isovaleryl-CoA dehydrogenase  79.48 
 
 		 387 aa  647    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0666462  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2322  isovaleryl-CoA dehydrogenase  96.66 
 
 		 389 aa  773    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2394  isovaleryl-CoA dehydrogenase  96.66 
 
 		 389 aa  775    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.869835 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2727  isovaleryl-CoA dehydrogenase  93.83 
 
 		 389 aa  753    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2846  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  98.71 
 
 		 389 aa  789    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38440  citronelloyl-CoA dehydrogenase, GnyD  79.74 
 
 		 387 aa  657    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1672  isovaleryl-CoA dehydrogenase  96.92 
 
 		 389 aa  776    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1362  isovaleryl-CoA dehydrogenase  91 
 
 		 389 aa  730    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.431847 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000377  isovaleryl-CoA dehydrogenase  79.64 
 
 		 389 aa  629  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.749145  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1603  isovaleryl-CoA dehydrogenase  76.29 
 
 		 389 aa  622  1e-177  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1787  hypothetical protein  72.68 
 
 		 389 aa  609  1e-173  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1788  hypothetical protein  72.68 
 
 		 389 aa  609  1e-173  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3289  isovaleryl-CoA dehydrogenase  74.22 
 
 		 390 aa  609  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0037  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  74.48 
 
 		 387 aa  608  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119681  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2780  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  73.7 
 
 		 390 aa  605  9.999999999999999e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0393743 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1804  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  72.94 
 
 		 390 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392184  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4272  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  74.02 
 
 		 390 aa  602  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0196507 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3933  Acyl-CoA dehydrogenase-like  73.23 
 
 		 390 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4263  acyl-CoA dehydrogenase-like  73.49 
 
 		 390 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.662141  normal  0.561312 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3693  isovaleryl-CoA dehydrogenase  73.49 
 
 		 390 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3387  isovaleryl-CoA dehydrogenase  71.73 
 
 		 391 aa  594  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197098  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0020  isovaleryl-CoA dehydrogenase  74.61 
 
 		 382 aa  590  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3466  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  74.61 
 
 		 393 aa  587  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1739  isovaleryl-CoA dehydrogenase  71.61 
 
 		 390 aa  588  1e-167  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6658  isovaleryl-CoA dehydrogenase  74.8 
 
 		 390 aa  590  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0100  isovaleryl-CoA dehydrogenase  72.99 
 
 		 390 aa  585  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3018  Acyl-CoA dehydrogenase  71.24 
 
 		 407 aa  585  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0017  isovaleryl-CoA dehydrogenase  74.35 
 
 		 382 aa  587  1e-166  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4588  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  74.35 
 
 		 393 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5032  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  73.58 
 
 		 393 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0423  isovaleryl-CoA dehydrogenase  73.83 
 
 		 414 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.733872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5121  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  74.09 
 
 		 393 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.975401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3127  acyl-CoA dehydrogenase-like  73.58 
 
 		 393 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.105998  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5240  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  73.58 
 
 		 393 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3562  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  71.76 
 
 		 393 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.364762 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03805  acyl-CoA dehydrogenase  70.68 
 
 		 387 aa  575  1.0000000000000001e-163  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0289  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  72.18 
 
 		 391 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0226098  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1466  isovaleryl-CoA dehydrogenase  71.76 
 
 		 393 aa  574  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429983  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0654  isovaleryl-CoA dehydrogenase  71.76 
 
 		 393 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.548122  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2318  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  72.7 
 
 		 390 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.759089  normal  0.0223321 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0802  isovaleryl-CoA dehydrogenase  71.76 
 
 		 393 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0542  isovaleryl-CoA dehydrogenase  71.76 
 
 		 393 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470015  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0135  isovaleryl-CoA dehydrogenase  72.02 
 
 		 393 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0471  isovaleryl-CoA dehydrogenase  71.76 
 
 		 393 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1959  putative isovaleryl-CoA dehydrogenase  70.99 
 
 		 393 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0947  isovaleryl-CoA dehydrogenase  72.28 
 
 		 393 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818935  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1608  isovaleryl-CoA dehydrogenase  71.76 
 
 		 393 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2056  putative isovaleryl-CoA dehydrogenase  71.76 
 
 		 393 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108299  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2119  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  70.98 
 
 		 390 aa  568  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148025 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0748  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  70.95 
 
 		 393 aa  568  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.239157  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0103  isovaleryl-CoA dehydrogenase  71.24 
 
 		 393 aa  570  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4686  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  71.24 
 
 		 393 aa  568  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001543  putative acyl-CoA dehydrogenase  80.9 
 
 		 335 aa  568  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0129  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  70.98 
 
 		 393 aa  566  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5991  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  70.98 
 
 		 395 aa  565  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000302563 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1948  isovaleryl-CoA dehydrogenase  70.05 
 
 		 387 aa  565  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113187  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0198  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  71.99 
 
 		 387 aa  565  1e-160  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140883  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0137  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  70.73 
 
 		 393 aa  565  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0931  isovaleryl-CoA dehydrogenase  72.8 
 
 		 386 aa  566  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49560  Acyl-CoA dehydrogenase  69.25 
 
 		 393 aa  563  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.531636  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0960  isovaleryl-CoA dehydrogenase  70.73 
 
 		 393 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.433991  normal  0.388602 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3779  isovaleryl-CoA dehydrogenase  69.43 
 
 		 396 aa  559  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3057  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  69.43 
 
 		 396 aa  558  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3360  isovaleryl-CoA dehydrogenase  69.41 
 
 		 410 aa  560  1e-158  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0279  acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  69.43 
 
 		 393 aa  555  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.236676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2188  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  73.18 
 
 		 390 aa  557  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4724  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  71.35 
 
 		 390 aa  557  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4532  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  73.04 
 
 		 387 aa  553  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.181691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4190  isovaleryl-CoA dehydrogenase  69.43 
 
 		 393 aa  552  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4371  isovaleryl-CoA dehydrogenase  69.43 
 
 		 395 aa  551  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  68.45 
 
 		 393 aa  553  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3842  acyl-CoA dehydrogenase-like  67.62 
 
 		 392 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.990363  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0344  acyl-CoA dehydrogenase-like  67.69 
 
 		 395 aa  539  9.999999999999999e-153  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2062  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  67.18 
 
 		 395 aa  536  1e-151  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0313  isovaleryl-CoA dehydrogenase  66.15 
 
 		 395 aa  531  1e-150  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.740089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0966  acyl-CoA dehydrogenase  66.67 
 
 		 387 aa  533  1e-150  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1074  isovaleryl-CoA dehydrogenase  66.4 
 
 		 387 aa  528  1e-149  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.490532  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0356  isovaleryl-CoA dehydrogenase  64.77 
 
 		 392 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.969667  decreased coverage  0.00000934354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>