More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3656 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2570  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  78.96 
 
 		 389 aa  652    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4064  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  93.28 
 
 		 424 aa  755    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322511  hitchhiker  0.0046695 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1603  isovaleryl-CoA dehydrogenase  78.65 
 
 		 389 aa  642    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1897  isovaleryl-CoA dehydrogenase  78.7 
 
 		 389 aa  648    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2739  acyl-CoA dehydrogenase, putative  92.25 
 
 		 447 aa  752    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2973  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  79.22 
 
 		 389 aa  650    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.698816  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3223  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  79.22 
 
 		 389 aa  650    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0153994 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1812  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  93.8 
 
 		 387 aa  763    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0871457  normal  0.415388 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2470  isovaleryl-CoA dehydrogenase  92.51 
 
 		 387 aa  752    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0293728  normal  0.0125727 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1530  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  79.22 
 
 		 389 aa  651    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.295941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3656  isovaleryl-CoA dehydrogenase  100 
 
 		 387 aa  801    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.179163  normal  0.0293073 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1458  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  78.7 
 
 		 389 aa  647    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.499178 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2846  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  79.74 
 
 		 389 aa  654    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2797  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  79.22 
 
 		 389 aa  650    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2245  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  78.96 
 
 		 389 aa  647    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1777  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  93.28 
 
 		 387 aa  757    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186488 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3274  citronelloyl-CoA dehydrogenase, GnyD  86.82 
 
 		 387 aa  709    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2322  isovaleryl-CoA dehydrogenase  79.22 
 
 		 389 aa  652    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2394  isovaleryl-CoA dehydrogenase  79.74 
 
 		 389 aa  655    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.869835 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2727  isovaleryl-CoA dehydrogenase  78.96 
 
 		 389 aa  646    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3662  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  93.28 
 
 		 387 aa  759    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000131881 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2033  isovaleryl-CoA dehydrogenase  80.36 
 
 		 387 aa  663    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0666462  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38440  citronelloyl-CoA dehydrogenase, GnyD  87.08 
 
 		 387 aa  711    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1672  isovaleryl-CoA dehydrogenase  79.48 
 
 		 389 aa  654    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2828  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  79.48 
 
 		 389 aa  652    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1362  isovaleryl-CoA dehydrogenase  78.7 
 
 		 389 aa  645    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.431847 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02412  isovaleryl-CoA dehydrogenase  76.17 
 
 		 389 aa  633  1e-180  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.719746  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1719  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  78.96 
 
 		 389 aa  624  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2925  isovaleryl-CoA dehydrogenase  76.04 
 
 		 389 aa  619  1e-176  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3466  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  76.29 
 
 		 393 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05480  acyl-CoA dehydrogenase  74.61 
 
 		 389 aa  612  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3289  isovaleryl-CoA dehydrogenase  74.55 
 
 		 390 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2121  isovaleryl-CoA dehydrogenase  75.33 
 
 		 388 aa  613  9.999999999999999e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.274166  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3127  acyl-CoA dehydrogenase-like  75.45 
 
 		 393 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.105998  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5240  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  75.45 
 
 		 393 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3562  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  76.29 
 
 		 393 aa  608  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.364762 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5032  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  75.19 
 
 		 393 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4588  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  75.45 
 
 		 393 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0037  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  74.87 
 
 		 387 aa  606  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119681  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1787  hypothetical protein  73.32 
 
 		 389 aa  604  9.999999999999999e-173  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1788  hypothetical protein  73.32 
 
 		 389 aa  604  9.999999999999999e-173  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0423  isovaleryl-CoA dehydrogenase  75.19 
 
 		 414 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.733872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5121  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  75.19 
 
 		 393 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.975401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4272  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  73.77 
 
 		 390 aa  604  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0196507 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0947  isovaleryl-CoA dehydrogenase  75.26 
 
 		 393 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818935  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2780  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  73.7 
 
 		 390 aa  601  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0393743 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1739  isovaleryl-CoA dehydrogenase  73.96 
 
 		 390 aa  602  1.0000000000000001e-171  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4686  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  75.77 
 
 		 393 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1804  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  74.28 
 
 		 390 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392184  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000377  isovaleryl-CoA dehydrogenase  75.58 
 
 		 389 aa  600  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.749145  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0471  isovaleryl-CoA dehydrogenase  75 
 
 		 393 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0960  isovaleryl-CoA dehydrogenase  75.26 
 
 		 393 aa  596  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.433991  normal  0.388602 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2056  putative isovaleryl-CoA dehydrogenase  75 
 
 		 393 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108299  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0802  isovaleryl-CoA dehydrogenase  74.74 
 
 		 393 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0654  isovaleryl-CoA dehydrogenase  74.74 
 
 		 393 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.548122  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1608  isovaleryl-CoA dehydrogenase  74.74 
 
 		 393 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0748  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  73.54 
 
 		 393 aa  593  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.239157  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1959  putative isovaleryl-CoA dehydrogenase  75.13 
 
 		 393 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0542  isovaleryl-CoA dehydrogenase  74.74 
 
 		 393 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470015  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0020  isovaleryl-CoA dehydrogenase  74.61 
 
 		 382 aa  589  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0100  isovaleryl-CoA dehydrogenase  72.75 
 
 		 390 aa  590  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0017  isovaleryl-CoA dehydrogenase  74.61 
 
 		 382 aa  590  1e-167  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3387  isovaleryl-CoA dehydrogenase  72.25 
 
 		 391 aa  589  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197098  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6658  isovaleryl-CoA dehydrogenase  75.85 
 
 		 390 aa  590  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3360  isovaleryl-CoA dehydrogenase  72.16 
 
 		 410 aa  585  1e-166  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3933  Acyl-CoA dehydrogenase-like  72.44 
 
 		 390 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3693  isovaleryl-CoA dehydrogenase  73.23 
 
 		 390 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4263  acyl-CoA dehydrogenase-like  73.49 
 
 		 390 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.662141  normal  0.561312 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0103  isovaleryl-CoA dehydrogenase  72.68 
 
 		 393 aa  581  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1466  isovaleryl-CoA dehydrogenase  72.16 
 
 		 393 aa  578  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429983  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3018  Acyl-CoA dehydrogenase  71.2 
 
 		 407 aa  579  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2119  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  71.98 
 
 		 390 aa  576  1.0000000000000001e-163  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148025 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0135  isovaleryl-CoA dehydrogenase  72.42 
 
 		 393 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49560  Acyl-CoA dehydrogenase  71.21 
 
 		 393 aa  575  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.531636  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0129  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  72.94 
 
 		 393 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0279  acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  71.91 
 
 		 393 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.236676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0137  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  72.68 
 
 		 393 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4724  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  71.72 
 
 		 390 aa  571  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5991  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  71.91 
 
 		 395 aa  572  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000302563 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03805  acyl-CoA dehydrogenase  69.69 
 
 		 387 aa  570  1e-161  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3057  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  71.13 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1948  isovaleryl-CoA dehydrogenase  70.21 
 
 		 387 aa  568  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113187  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3779  isovaleryl-CoA dehydrogenase  71.39 
 
 		 396 aa  570  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2318  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  72.7 
 
 		 390 aa  567  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.759089  normal  0.0223321 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4371  isovaleryl-CoA dehydrogenase  70.26 
 
 		 395 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0289  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  71.39 
 
 		 391 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0226098  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0313  isovaleryl-CoA dehydrogenase  69.37 
 
 		 395 aa  560  1e-158  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.740089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2062  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.62 
 
 		 395 aa  558  1e-158  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3842  acyl-CoA dehydrogenase-like  70.08 
 
 		 392 aa  560  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.990363  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0344  acyl-CoA dehydrogenase-like  69.87 
 
 		 395 aa  560  1e-158  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0931  isovaleryl-CoA dehydrogenase  73.25 
 
 		 386 aa  558  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  70.36 
 
 		 393 aa  558  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4532  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  74.08 
 
 		 387 aa  555  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.181691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0198  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  70.47 
 
 		 387 aa  556  1e-157  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140883  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4190  isovaleryl-CoA dehydrogenase  70.1 
 
 		 393 aa  556  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0356  isovaleryl-CoA dehydrogenase  68.91 
 
 		 392 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.969667  decreased coverage  0.00000934354 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001543  putative acyl-CoA dehydrogenase  76.42 
 
 		 335 aa  546  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2188  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  72.73 
 
 		 390 aa  546  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0966  acyl-CoA dehydrogenase  67.72 
 
 		 387 aa  536  1e-151  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1074  isovaleryl-CoA dehydrogenase  67.71 
 
 		 387 aa  536  1e-151  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.490532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>