171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3792 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3484  acyl-CoA dehydrogenase type 2  98.04 
 
 
358 aa  689    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3792  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  100 
 
 
358 aa  700    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.267616 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3866  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  90.06 
 
 
362 aa  607  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0222771 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2837  putative acyl-CoA dehydrogenase  50.42 
 
 
375 aa  299  5e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.926618 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0305  putative acyl-CoA dehydrogenase  45.51 
 
 
376 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.1367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2613  putative acyl-CoA dehydrogenase family protein  43.5 
 
 
373 aa  245  9e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.346291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5417  putative acyl-CoA dehydrogenase family protein  43.43 
 
 
373 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1706  putative acyl-CoA dehydrogenase  44.67 
 
 
375 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.087432  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1150  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  42.64 
 
 
397 aa  226  6e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.428628 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1309  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.34 
 
 
397 aa  224  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2211  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.57 
 
 
378 aa  223  4e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2174  putative acyl-CoA dehydrogenase  36.44 
 
 
382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4820  putative acyl-CoA dehydrogenase  44.38 
 
 
375 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0038  putative acyl-CoA dehydrogenase  34.37 
 
 
360 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0970  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.77 
 
 
379 aa  213  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4852  acyl-CoA dehydrogenase-like  39 
 
 
395 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.150232 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4667  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  43.24 
 
 
396 aa  208  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0171462  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0622  acyl-CoA dehydrogenase  35.52 
 
 
354 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00205931  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0160  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  29.79 
 
 
344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0165  hypothetical protein  29.79 
 
 
344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2627  hypothetical protein  31.09 
 
 
353 aa  127  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0414836  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0459  hypothetical protein  31.9 
 
 
367 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0700  acyl-CoA dehydrogenase family protein  28.8 
 
 
354 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.564675  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1538  putative acyl-CoA dehydrogenase  33.24 
 
 
367 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6334  putative acyl-CoA dehydrogenase  35.01 
 
 
371 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2274  acyl-CoA dehydrogenase  30.89 
 
 
354 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.921595  normal  0.572718 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3638  acyl-CoA dehydrogenase, putative  31.66 
 
 
354 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0587866  normal  0.442088 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6511  hypothetical protein  34.64 
 
 
371 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6745  hypothetical protein  34.64 
 
 
371 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.839762  normal  0.367272 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2095  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  30.82 
 
 
354 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.528653 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3928  acyl-CoA dehydrogenase, putative  32.41 
 
 
366 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.438549  normal  0.0461862 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34490  hypothetical protein  33.44 
 
 
355 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000897326  normal  0.153318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2929  hypothetical protein  31.25 
 
 
355 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5825  putative acyl-CoA dehydrogenase  32.68 
 
 
365 aa  107  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.803301 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0102  putative acyl-CoA dehydrogenase  33.62 
 
 
367 aa  94  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988493  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1452  acyl-CoA dehydrogenase  28.99 
 
 
350 aa  86.7  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00428618  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6291  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.64 
 
 
379 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0100  isovaleryl-CoA dehydrogenase  26.32 
 
 
390 aa  61.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3827  bytyryl-CoA dehydrogenase (short-chain-acyl-CoA dehydrogenase)  22.63 
 
 
379 aa  60.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0748  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.34 
 
 
393 aa  60.8  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.239157  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3360  isovaleryl-CoA dehydrogenase  26.17 
 
 
410 aa  59.3  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3289  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.96 
 
 
390 aa  58.5  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06620  butyryl-CoA dehydrogenase  21.89 
 
 
380 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3693  isovaleryl-CoA dehydrogenase  27.15 
 
 
390 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0714  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.72 
 
 
388 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.0860013 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38440  citronelloyl-CoA dehydrogenase, GnyD  25.94 
 
 
387 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2780  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.59 
 
 
390 aa  57.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0393743 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4686  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25 
 
 
393 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162224  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.28 
 
 
379 aa  56.2  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4263  acyl-CoA dehydrogenase-like  26.24 
 
 
390 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.662141  normal  0.561312 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1371  butyryl-CoA dehydrogenase  26.27 
 
 
389 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.183303  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2033  isovaleryl-CoA dehydrogenase  26.47 
 
 
387 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0666462  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6658  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25 
 
 
390 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2119  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.07 
 
 
390 aa  55.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148025 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3274  citronelloyl-CoA dehydrogenase, GnyD  25.47 
 
 
387 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2589  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.5 
 
 
390 aa  54.7  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000683478  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4115  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.5 
 
 
390 aa  54.7  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0502  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.75 
 
 
387 aa  54.3  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3933  Acyl-CoA dehydrogenase-like  26.24 
 
 
390 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1804  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.24 
 
 
390 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1345  acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain protein  26.79 
 
 
387 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1739  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25.33 
 
 
390 aa  53.1  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3127  acyl-CoA dehydrogenase-like  24.06 
 
 
393 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.105998  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5240  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.06 
 
 
393 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288959  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1466  isovaleryl-CoA dehydrogenase  26.47 
 
 
393 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429983  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.66 
 
 
389 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5641  Butyryl-CoA dehydrogenase  22.7 
 
 
379 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5121  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.58 
 
 
393 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.975401  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1603  isovaleryl-CoA dehydrogenase  27.81 
 
 
389 aa  51.6  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.69 
 
 
379 aa  51.6  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0356  isovaleryl-CoA dehydrogenase  29.53 
 
 
392 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.969667  decreased coverage  0.00000934354 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4588  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.58 
 
 
393 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.54 
 
 
380 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0919  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.25 
 
 
383 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5032  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.06 
 
 
393 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0289  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25 
 
 
391 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0226098  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3387  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.09 
 
 
391 aa  50.4  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197098  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2727  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.08 
 
 
389 aa  50.4  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2739  acyl-CoA dehydrogenase, putative  29.29 
 
 
447 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2905  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.08 
 
 
387 aa  50.1  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0136  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.58 
 
 
379 aa  50.1  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4413  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.02 
 
 
384 aa  50.1  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0423  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.11 
 
 
414 aa  49.7  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.733872  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3562  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.06 
 
 
393 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.364762 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0137  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.6 
 
 
393 aa  49.3  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4987  acyl-CoA dehydrogenase family protein-like  22.07 
 
 
367 aa  49.7  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.432457  normal  0.841072 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0407  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25 
 
 
378 aa  49.3  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2470  isovaleryl-CoA dehydrogenase  30 
 
 
387 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0293728  normal  0.0125727 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0129  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.6 
 
 
393 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3466  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.58 
 
 
393 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360992  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3018  Acyl-CoA dehydrogenase  25.34 
 
 
407 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0103  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25.81 
 
 
393 aa  48.9  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2121  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.76 
 
 
388 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.274166  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4371  isovaleryl-CoA dehydrogenase  29.71 
 
 
395 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6030  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.56 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0802  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.53 
 
 
393 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3662  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.87 
 
 
387 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000131881 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0542  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.53 
 
 
393 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470015  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0654  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.53 
 
 
393 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.548122  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1959  putative isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.53 
 
 
393 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>