208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5825 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5825  putative acyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
365 aa  708    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.803301 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6334  putative acyl-CoA dehydrogenase  56.82 
 
 
371 aa  346  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6511  hypothetical protein  56.25 
 
 
371 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6745  hypothetical protein  56.25 
 
 
371 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.839762  normal  0.367272 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0459  hypothetical protein  54.39 
 
 
367 aa  341  1e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3928  acyl-CoA dehydrogenase, putative  55.62 
 
 
366 aa  332  9e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.438549  normal  0.0461862 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1538  putative acyl-CoA dehydrogenase  53.67 
 
 
367 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2274  acyl-CoA dehydrogenase  50.56 
 
 
354 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.921595  normal  0.572718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2929  hypothetical protein  52.68 
 
 
355 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34490  hypothetical protein  53.8 
 
 
355 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000897326  normal  0.153318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2095  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  50.14 
 
 
354 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.528653 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3638  acyl-CoA dehydrogenase, putative  50.14 
 
 
354 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0587866  normal  0.442088 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0102  putative acyl-CoA dehydrogenase  51.57 
 
 
367 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988493  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0700  acyl-CoA dehydrogenase family protein  39.66 
 
 
354 aa  266  5e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.564675  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2627  hypothetical protein  39.65 
 
 
353 aa  218  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0414836  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3484  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.16 
 
 
358 aa  119  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3792  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  33.33 
 
 
358 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.267616 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1452  acyl-CoA dehydrogenase  29.21 
 
 
350 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00428618  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0038  putative acyl-CoA dehydrogenase  25 
 
 
360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0160  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  25.93 
 
 
344 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0165  hypothetical protein  25.93 
 
 
344 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2837  putative acyl-CoA dehydrogenase  30.6 
 
 
375 aa  106  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.926618 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0305  putative acyl-CoA dehydrogenase  29.43 
 
 
376 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.1367 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3866  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  32.14 
 
 
362 aa  102  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0222771 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0622  acyl-CoA dehydrogenase  26.63 
 
 
354 aa  101  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00205931  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0970  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.24 
 
 
379 aa  100  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2211  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.25 
 
 
378 aa  96.3  7e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4852  acyl-CoA dehydrogenase-like  27.32 
 
 
395 aa  92.8  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.150232 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2613  putative acyl-CoA dehydrogenase family protein  28.08 
 
 
373 aa  91.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.346291 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2174  putative acyl-CoA dehydrogenase  25.57 
 
 
382 aa  90.9  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5417  putative acyl-CoA dehydrogenase family protein  29.46 
 
 
373 aa  91.3  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1150  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  27.5 
 
 
397 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.428628 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4820  putative acyl-CoA dehydrogenase  29.39 
 
 
375 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1706  putative acyl-CoA dehydrogenase  28.89 
 
 
375 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.087432  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1309  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.4 
 
 
397 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4667  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  27.99 
 
 
396 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0171462  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1131  butyryl-CoA dehydrogenase  26.91 
 
 
392 aa  66.6  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00519609  hitchhiker  0.000110962 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0488  butyryl-CoA dehydrogenase  22.41 
 
 
379 aa  63.5  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00678793  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2576  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.52 
 
 
378 aa  60.1  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1777  putative acyl-CoA dehydrogenase  25.19 
 
 
383 aa  58.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0345355  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0356  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.44 
 
 
392 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.969667  decreased coverage  0.00000934354 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2056  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.55 
 
 
377 aa  56.2  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.232194  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3931  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  21.03 
 
 
400 aa  56.2  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.543045 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4164  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.17 
 
 
380 aa  54.7  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1530  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.19 
 
 
389 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.295941  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2846  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25 
 
 
389 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2973  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.19 
 
 
389 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.698816  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2828  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.19 
 
 
389 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.13 
 
 
380 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1559  acyl-CoA dehydrogenase-like  25.18 
 
 
387 aa  53.9  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.456319 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.75 
 
 
380 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0837  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.3 
 
 
390 aa  53.9  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1948  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25.66 
 
 
387 aa  53.5  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113187  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2500  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.68 
 
 
386 aa  53.5  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0453809  normal  0.399884 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1897  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.52 
 
 
389 aa  53.1  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1570  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.25 
 
 
383 aa  53.1  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4263  acyl-CoA dehydrogenase-like  22.97 
 
 
390 aa  53.1  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.662141  normal  0.561312 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0732  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.16 
 
 
379 aa  52.8  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0550  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.33 
 
 
377 aa  53.1  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193039  decreased coverage  0.00272664 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0727  hypothetical protein  31.69 
 
 
224 aa  52.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0730349 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0730  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  21.31 
 
 
381 aa  52  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00824  acyl-CoA dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14850)  23.04 
 
 
439 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1052  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  21.25 
 
 
386 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2755  hypothetical protein  27.11 
 
 
414 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.66 
 
 
381 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1458  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.55 
 
 
389 aa  51.2  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.499178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2187  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.78 
 
 
385 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3933  Acyl-CoA dehydrogenase-like  22.22 
 
 
390 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3147  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.03 
 
 
382 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.880335  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38440  citronelloyl-CoA dehydrogenase, GnyD  24.56 
 
 
387 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1371  butyryl-CoA dehydrogenase  24.54 
 
 
389 aa  50.4  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.183303  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3274  citronelloyl-CoA dehydrogenase, GnyD  24.56 
 
 
387 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3005  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.35 
 
 
364 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3114  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.35 
 
 
364 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1804  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.71 
 
 
390 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392184  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0838  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.09 
 
 
382 aa  49.3  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.541206 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1603  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.45 
 
 
389 aa  49.3  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01550  acyl-CoA oxidase, putative  21.57 
 
 
429 aa  49.3  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3018  Acyl-CoA dehydrogenase  24.17 
 
 
407 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0847  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.43 
 
 
386 aa  48.9  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3185  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  26.6 
 
 
381 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470854  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4987  acyl-CoA dehydrogenase family protein-like  25.22 
 
 
367 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.432457  normal  0.841072 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2780  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.11 
 
 
390 aa  48.9  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0393743 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0714  butyryl-CoA dehydrogenase  26.67 
 
 
384 aa  49.3  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1853  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.46 
 
 
416 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3247  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.6 
 
 
381 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2121  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.29 
 
 
388 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.274166  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3197  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.6 
 
 
381 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107231  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1981  putative acyl-CoA dehydrogenase  29.91 
 
 
388 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30500  butyryl-CoA dehydrogenase  23.19 
 
 
385 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.262375 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  23.32 
 
 
381 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  23.32 
 
 
381 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3289  isovaleryl-CoA dehydrogenase  22.33 
 
 
390 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3693  isovaleryl-CoA dehydrogenase  22.71 
 
 
390 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3387  isovaleryl-CoA dehydrogenase  21.33 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197098  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  22.73 
 
 
381 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  23.32 
 
 
381 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0459  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.69 
 
 
376 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.672922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3002  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.46 
 
 
388 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  23.32 
 
 
381 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>