18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0727 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0727  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  442  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0730349 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0459  hypothetical protein  33.86 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6511  hypothetical protein  35.23 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6745  hypothetical protein  35.23 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.839762  normal  0.367272 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6334  putative acyl-CoA dehydrogenase  35.23 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2274  acyl-CoA dehydrogenase  36.03 
 
 		 354 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.921595  normal  0.572718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2929  hypothetical protein  38.1 
 
 		 355 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2095  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  34.97 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.528653 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34490  hypothetical protein  33.88 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000897326  normal  0.153318 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3638  acyl-CoA dehydrogenase, putative  34.97 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0587866  normal  0.442088 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0700  acyl-CoA dehydrogenase family protein  27.68 
 
 		 354 aa  55.8  0.0000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.564675  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1538  putative acyl-CoA dehydrogenase  34.68 
 
 		 367 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5825  putative acyl-CoA dehydrogenase  31.69 
 
 		 365 aa  52.4  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.803301 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0102  putative acyl-CoA dehydrogenase  35.71 
 
 		 367 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3928  acyl-CoA dehydrogenase, putative  31.87 
 
 		 366 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.438549  normal  0.0461862 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2627  hypothetical protein  27.48 
 
 		 353 aa  43.5  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0414836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3059  acyl-CoA dehydrogenase-like  27.91 
 
 		 570 aa  42.4  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1260  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25 
 
 		 394 aa  42  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.334789  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>