More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_34490 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_34490  hypothetical protein  100 
 
 
355 aa  682    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000897326  normal  0.153318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2929  hypothetical protein  94.37 
 
 
355 aa  622  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2274  acyl-CoA dehydrogenase  65.44 
 
 
354 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.921595  normal  0.572718 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3638  acyl-CoA dehydrogenase, putative  66.38 
 
 
354 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0587866  normal  0.442088 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2095  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  66.38 
 
 
354 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.528653 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6334  putative acyl-CoA dehydrogenase  57.59 
 
 
371 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6745  hypothetical protein  56.73 
 
 
371 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.839762  normal  0.367272 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6511  hypothetical protein  56.73 
 
 
371 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0459  hypothetical protein  52.17 
 
 
367 aa  329  4e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1538  putative acyl-CoA dehydrogenase  51.26 
 
 
367 aa  324  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5825  putative acyl-CoA dehydrogenase  53.87 
 
 
365 aa  318  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.803301 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3928  acyl-CoA dehydrogenase, putative  51.9 
 
 
366 aa  303  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.438549  normal  0.0461862 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0102  putative acyl-CoA dehydrogenase  51.53 
 
 
367 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988493  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0700  acyl-CoA dehydrogenase family protein  44.25 
 
 
354 aa  276  3e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.564675  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2627  hypothetical protein  42.64 
 
 
353 aa  239  5e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0414836  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0038  putative acyl-CoA dehydrogenase  30.89 
 
 
360 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4852  acyl-CoA dehydrogenase-like  33.52 
 
 
395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.150232 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2613  putative acyl-CoA dehydrogenase family protein  31.62 
 
 
373 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.346291 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2837  putative acyl-CoA dehydrogenase  31.21 
 
 
375 aa  126  7e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.926618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1309  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.23 
 
 
397 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1150  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  33.33 
 
 
397 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.428628 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0305  putative acyl-CoA dehydrogenase  31.09 
 
 
376 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.1367 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2174  putative acyl-CoA dehydrogenase  28.45 
 
 
382 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0970  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.21 
 
 
379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2211  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.41 
 
 
378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1452  acyl-CoA dehydrogenase  31.7 
 
 
350 aa  113  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00428618  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5417  putative acyl-CoA dehydrogenase family protein  31.12 
 
 
373 aa  113  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3484  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.33 
 
 
358 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0622  acyl-CoA dehydrogenase  28.19 
 
 
354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00205931  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1706  putative acyl-CoA dehydrogenase  33.22 
 
 
375 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.087432  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3792  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  33.52 
 
 
358 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.267616 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4820  putative acyl-CoA dehydrogenase  34.63 
 
 
375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0165  hypothetical protein  25.49 
 
 
344 aa  109  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0160  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  25.49 
 
 
344 aa  109  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4667  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  33.33 
 
 
396 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0171462  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3866  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  33.52 
 
 
362 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0222771 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1297  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.27 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.329164  normal  0.246274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0550  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.06 
 
 
377 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193039  decreased coverage  0.00272664 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0732  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.06 
 
 
387 aa  65.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.5 
 
 
393 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1787  hypothetical protein  25.43 
 
 
389 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1788  hypothetical protein  25.14 
 
 
389 aa  64.3  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4190  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25.07 
 
 
393 aa  63.9  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0232  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.8 
 
 
382 aa  63.5  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04688  Isovaleryl-coenzyme A dehydrogenase (EC 1.3.99.10) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6T5L6]  27.61 
 
 
431 aa  63.2  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480161  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2082  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.79 
 
 
376 aa  62.8  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3842  acyl-CoA dehydrogenase-like  25 
 
 
392 aa  63.2  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.990363  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2780  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.89 
 
 
390 aa  62.4  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0393743 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05480  acyl-CoA dehydrogenase  26.41 
 
 
389 aa  62  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0198  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.25 
 
 
387 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140883  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1948  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25.45 
 
 
387 aa  61.2  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113187  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3779  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.21 
 
 
396 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0727  hypothetical protein  35.88 
 
 
224 aa  61.2  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0730349 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2827  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.3 
 
 
391 aa  60.8  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.226434  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1288  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.1 
 
 
379 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.751821 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3057  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.21 
 
 
396 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4371  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.51 
 
 
395 aa  59.7  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4257  butyryl-CoA dehydrogenase  31.69 
 
 
377 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.725306  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4263  acyl-CoA dehydrogenase-like  26.09 
 
 
390 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.662141  normal  0.561312 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6510  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.39 
 
 
381 aa  59.3  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.41485  normal  0.721434 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4233  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.8 
 
 
394 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0274104  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1333  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.64 
 
 
396 aa  58.9  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0832215  hitchhiker  0.00420458 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2357  acyl-CoA dehydrogenase  28.95 
 
 
406 aa  59.3  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3693  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.68 
 
 
390 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4378  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.28 
 
 
381 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4014  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.99 
 
 
386 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1168  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.36 
 
 
385 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437637  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0488  butyryl-CoA dehydrogenase  21.41 
 
 
379 aa  58.9  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00678793  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2506  isovaleryl-CoA dehydrogenase  28.03 
 
 
385 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.791052  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26310  acyl-CoA dehydrogenase  27.75 
 
 
394 aa  58.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.953761 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3289  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.56 
 
 
390 aa  58.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2121  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.75 
 
 
388 aa  58.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.274166  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3069  acyl-CoA dehydrogenase-like  27.05 
 
 
404 aa  58.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66075  normal  0.0926601 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4612  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.55 
 
 
392 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0319  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.98 
 
 
383 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.339666  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5991  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.58 
 
 
395 aa  58.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000302563 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1804  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.6 
 
 
390 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392184  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0505  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.69 
 
 
561 aa  57.8  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.32 
 
 
381 aa  57.4  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08210  butyryl-CoA dehydrogenase  25.48 
 
 
394 aa  57  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.249284 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4391  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25 
 
 
386 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3775  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.73 
 
 
386 aa  56.6  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0264  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.99 
 
 
394 aa  56.6  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0644181  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  24.32 
 
 
381 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  24.32 
 
 
381 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0539  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.32 
 
 
388 aa  56.2  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191308  normal  0.162597 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  23.94 
 
 
381 aa  56.2  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3633  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.91 
 
 
386 aa  56.2  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0817586  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  23.94 
 
 
381 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3858  putative acyl-CoA dehydrogenase  27.11 
 
 
451 aa  56.2  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99682 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1559  acyl-CoA dehydrogenase-like  26.09 
 
 
387 aa  56.2  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.456319 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1168  putative acyl-coa dehydrogenase  21.74 
 
 
372 aa  56.2  0.0000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1707  butyryl-CoA dehydrogenase  27.89 
 
 
388 aa  56.2  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000836039  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2062  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  20.79 
 
 
395 aa  56.2  0.0000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  23.94 
 
 
381 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  23.94 
 
 
381 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1281  butyryl-CoA dehydrogenase  26.46 
 
 
387 aa  55.8  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.33384  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1466  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.66 
 
 
393 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429983  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0960  isovaleryl-CoA dehydrogenase  22.74 
 
 
393 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.433991  normal  0.388602 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4686  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.87 
 
 
393 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162224  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>