208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_B2627 on replicon NC_007595
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007595  Synpcc7942_B2627  hypothetical protein  100 
 
 
353 aa  707    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0414836  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2274  acyl-CoA dehydrogenase  43.25 
 
 
354 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.921595  normal  0.572718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2929  hypothetical protein  42.14 
 
 
355 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1538  putative acyl-CoA dehydrogenase  42.81 
 
 
367 aa  229  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0459  hypothetical protein  40.4 
 
 
367 aa  223  3e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3638  acyl-CoA dehydrogenase, putative  42.94 
 
 
354 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0587866  normal  0.442088 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2095  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  42.94 
 
 
354 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.528653 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34490  hypothetical protein  42.77 
 
 
355 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000897326  normal  0.153318 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6334  putative acyl-CoA dehydrogenase  41.9 
 
 
371 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6511  hypothetical protein  41.59 
 
 
371 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6745  hypothetical protein  41.59 
 
 
371 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.839762  normal  0.367272 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0102  putative acyl-CoA dehydrogenase  42.38 
 
 
367 aa  203  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988493  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5825  putative acyl-CoA dehydrogenase  39.76 
 
 
365 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.803301 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3928  acyl-CoA dehydrogenase, putative  39.77 
 
 
366 aa  199  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.438549  normal  0.0461862 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0700  acyl-CoA dehydrogenase family protein  33.02 
 
 
354 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.564675  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0038  putative acyl-CoA dehydrogenase  29.51 
 
 
360 aa  157  4e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0305  putative acyl-CoA dehydrogenase  30.94 
 
 
376 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.1367 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2174  putative acyl-CoA dehydrogenase  32.21 
 
 
382 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2837  putative acyl-CoA dehydrogenase  30.63 
 
 
375 aa  143  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.926618 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0970  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.91 
 
 
379 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2211  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.01 
 
 
378 aa  137  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1150  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  29.68 
 
 
397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.428628 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0622  acyl-CoA dehydrogenase  28.4 
 
 
354 aa  135  9e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00205931  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1309  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.76 
 
 
397 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2613  putative acyl-CoA dehydrogenase family protein  29.86 
 
 
373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.346291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5417  putative acyl-CoA dehydrogenase family protein  29.76 
 
 
373 aa  129  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0165  hypothetical protein  27.46 
 
 
344 aa  126  7e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0160  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  27.46 
 
 
344 aa  126  7e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4852  acyl-CoA dehydrogenase-like  30.19 
 
 
395 aa  125  9e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.150232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3484  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.41 
 
 
358 aa  125  9e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3792  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  29.55 
 
 
358 aa  123  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.267616 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4667  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  28.9 
 
 
396 aa  120  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0171462  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1706  putative acyl-CoA dehydrogenase  29.15 
 
 
375 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.087432  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4820  putative acyl-CoA dehydrogenase  29.49 
 
 
375 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3866  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  28.83 
 
 
362 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0222771 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1452  acyl-CoA dehydrogenase  29.48 
 
 
350 aa  113  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00428618  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1297  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.78 
 
 
387 aa  65.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.329164  normal  0.246274 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3656  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.11 
 
 
387 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.179163  normal  0.0293073 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1142  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25.89 
 
 
386 aa  64.3  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.268805  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1948  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.55 
 
 
387 aa  63.5  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113187  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3289  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.78 
 
 
390 aa  62.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3693  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.08 
 
 
390 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4263  acyl-CoA dehydrogenase-like  25.4 
 
 
390 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.662141  normal  0.561312 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4190  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25.16 
 
 
393 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2780  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.24 
 
 
390 aa  61.2  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0393743 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1739  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.02 
 
 
390 aa  60.8  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1603  isovaleryl-CoA dehydrogenase  22.78 
 
 
389 aa  60.8  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02412  isovaleryl-CoA dehydrogenase  22.26 
 
 
389 aa  60.1  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.719746  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5991  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.21 
 
 
395 aa  59.7  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000302563 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3933  Acyl-CoA dehydrogenase-like  22.86 
 
 
390 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4272  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.94 
 
 
390 aa  58.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0196507 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2188  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.71 
 
 
390 aa  58.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0100  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25 
 
 
390 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1804  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.67 
 
 
390 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392184  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0732  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.44 
 
 
387 aa  58.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49560  Acyl-CoA dehydrogenase  23.84 
 
 
393 aa  58.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.531636  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.53 
 
 
393 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2739  acyl-CoA dehydrogenase, putative  21.7 
 
 
447 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1812  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.08 
 
 
387 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0871457  normal  0.415388 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2727  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25.11 
 
 
389 aa  57.8  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38440  citronelloyl-CoA dehydrogenase, GnyD  23.17 
 
 
387 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3274  citronelloyl-CoA dehydrogenase, GnyD  23.79 
 
 
387 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2506  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.77 
 
 
385 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.791052  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6658  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.39 
 
 
390 aa  57  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0356  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.17 
 
 
392 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.969667  decreased coverage  0.00000934354 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3662  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.08 
 
 
387 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000131881 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4724  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.2 
 
 
390 aa  57  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1168  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.77 
 
 
385 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437637  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3779  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.32 
 
 
396 aa  56.6  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2470  isovaleryl-CoA dehydrogenase  21.64 
 
 
387 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0293728  normal  0.0125727 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2925  isovaleryl-CoA dehydrogenase  22.29 
 
 
389 aa  56.6  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4064  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.62 
 
 
424 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322511  hitchhiker  0.0046695 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04688  Isovaleryl-coenzyme A dehydrogenase (EC 1.3.99.10) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6T5L6]  25.5 
 
 
431 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480161  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3018  Acyl-CoA dehydrogenase  24.09 
 
 
407 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1777  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.08 
 
 
387 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0186488 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0947  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25.16 
 
 
393 aa  55.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818935  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1260  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.64 
 
 
394 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.334789  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0289  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.69 
 
 
391 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0226098  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0960  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.51 
 
 
393 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.433991  normal  0.388602 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3057  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.01 
 
 
396 aa  54.7  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3633  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.77 
 
 
386 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0817586  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0344  acyl-CoA dehydrogenase-like  21.83 
 
 
395 aa  54.3  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4371  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.9 
 
 
395 aa  54.3  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2033  isovaleryl-CoA dehydrogenase  21.24 
 
 
387 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0666462  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2692  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.14 
 
 
386 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0824192  normal  0.331355 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0748  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.65 
 
 
393 aa  53.9  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.239157  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5062  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.11 
 
 
387 aa  53.9  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3387  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.67 
 
 
391 aa  53.9  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197098  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2121  isovaleryl-CoA dehydrogenase  22.84 
 
 
388 aa  53.9  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.274166  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0313  isovaleryl-CoA dehydrogenase  21.74 
 
 
395 aa  53.5  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.740089  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1371  butyryl-CoA dehydrogenase  25.78 
 
 
389 aa  53.5  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.183303  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2318  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.23 
 
 
390 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.759089  normal  0.0223321 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3562  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.66 
 
 
393 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.364762 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2265  putative acyl-CoA dehydrogenase  26.63 
 
 
386 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.77 
 
 
385 aa  52.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392534  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0279  acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  23.49 
 
 
393 aa  52.8  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.236676  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0931  isovaleryl-CoA dehydrogenase  27 
 
 
386 aa  52.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2973  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.69 
 
 
389 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.698816  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2828  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.23 
 
 
389 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2846  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.69 
 
 
389 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>