127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1309 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1150  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  96.98 
 
 
397 aa  776    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.428628 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4667  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  88.41 
 
 
396 aa  676    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0171462  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1309  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  100 
 
 
397 aa  796    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4852  acyl-CoA dehydrogenase-like  61.66 
 
 
395 aa  455  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.150232 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2174  putative acyl-CoA dehydrogenase  52.47 
 
 
382 aa  382  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0970  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.05 
 
 
379 aa  286  4e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2211  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.97 
 
 
378 aa  276  7e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2613  putative acyl-CoA dehydrogenase family protein  42.48 
 
 
373 aa  273  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.346291 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0038  putative acyl-CoA dehydrogenase  39.71 
 
 
360 aa  265  2e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5417  putative acyl-CoA dehydrogenase family protein  42.53 
 
 
373 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2837  putative acyl-CoA dehydrogenase  42.34 
 
 
375 aa  250  4e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.926618 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0305  putative acyl-CoA dehydrogenase  39.94 
 
 
376 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.1367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3484  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.24 
 
 
358 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3792  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  42.34 
 
 
358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.267616 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3866  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  43.24 
 
 
362 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0222771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1706  putative acyl-CoA dehydrogenase  37.84 
 
 
375 aa  192  7e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.087432  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4820  putative acyl-CoA dehydrogenase  38.71 
 
 
375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0622  acyl-CoA dehydrogenase  35.88 
 
 
354 aa  183  5.0000000000000004e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00205931  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0160  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  27.54 
 
 
344 aa  143  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0165  hypothetical protein  27.54 
 
 
344 aa  143  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2627  hypothetical protein  29.39 
 
 
353 aa  136  7.000000000000001e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0414836  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2929  hypothetical protein  33.87 
 
 
355 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0459  hypothetical protein  30.72 
 
 
367 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34490  hypothetical protein  31.73 
 
 
355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000897326  normal  0.153318 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2274  acyl-CoA dehydrogenase  30.42 
 
 
354 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.921595  normal  0.572718 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3928  acyl-CoA dehydrogenase, putative  31.27 
 
 
366 aa  104  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.438549  normal  0.0461862 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2095  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  29.58 
 
 
354 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.528653 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3638  acyl-CoA dehydrogenase, putative  29.58 
 
 
354 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0587866  normal  0.442088 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1538  putative acyl-CoA dehydrogenase  29.36 
 
 
367 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6334  putative acyl-CoA dehydrogenase  29.41 
 
 
371 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6511  hypothetical protein  28.57 
 
 
371 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6745  hypothetical protein  28.57 
 
 
371 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.839762  normal  0.367272 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0102  putative acyl-CoA dehydrogenase  29.61 
 
 
367 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988493  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1452  acyl-CoA dehydrogenase  26.82 
 
 
350 aa  79.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00428618  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0700  acyl-CoA dehydrogenase family protein  23.73 
 
 
354 aa  72.8  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.564675  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5825  putative acyl-CoA dehydrogenase  27.56 
 
 
365 aa  66.6  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.803301 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1359  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  24.4 
 
 
426 aa  60.8  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1645  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.51 
 
 
387 aa  60.1  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4257  butyryl-CoA dehydrogenase  26.48 
 
 
377 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.725306  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4987  acyl-CoA dehydrogenase family protein-like  23.74 
 
 
367 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.432457  normal  0.841072 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0481  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.02 
 
 
363 aa  57.4  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0067  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.2 
 
 
394 aa  56.2  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3778  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.18 
 
 
382 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  0.271407 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04688  Isovaleryl-coenzyme A dehydrogenase (EC 1.3.99.10) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6T5L6]  24.54 
 
 
431 aa  54.3  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480161  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0833  putative acyl-CoA dehydrogenase  24.18 
 
 
385 aa  53.9  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815342 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1126  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.47 
 
 
373 aa  53.5  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1608  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.37 
 
 
388 aa  53.1  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0385936  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0167  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.97 
 
 
376 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0615  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.56 
 
 
387 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.210833  normal  0.0397055 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6366  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.68 
 
 
387 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4085  putative acyl-CoA dehydrogenase  23.26 
 
 
387 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14575  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4358  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.26 
 
 
381 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0892384  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2739  acyl-CoA dehydrogenase, putative  24.17 
 
 
447 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0241  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25 
 
 
389 aa  51.6  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3973  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.87 
 
 
377 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.78306  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4086  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.87 
 
 
377 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303595  normal  0.349393 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1390  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.43 
 
 
390 aa  50.4  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4062  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.43 
 
 
389 aa  50.4  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1458  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.16 
 
 
389 aa  50.1  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.499178 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1281  butyryl-CoA dehydrogenase  23.51 
 
 
387 aa  50.1  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.33384  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1084  butyryl-CoA dehydrogenase  25.26 
 
 
377 aa  50.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0155468 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5650  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.52 
 
 
377 aa  49.7  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3779  isovaleryl-CoA dehydrogenase  27.27 
 
 
396 aa  48.9  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0232  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.45 
 
 
382 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.27 
 
 
379 aa  49.7  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3057  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.27 
 
 
396 aa  49.3  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1498  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.96 
 
 
382 aa  49.3  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1076  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  20.11 
 
 
379 aa  48.9  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.228764 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1897  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.56 
 
 
389 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1288  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.83 
 
 
379 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.751821 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4743  butyryl-CoA dehydrogenase  23.12 
 
 
417 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2846  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.86 
 
 
389 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0666  acyl-CoA dehydrogenase  22.64 
 
 
386 aa  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2470  isovaleryl-CoA dehydrogenase  21.39 
 
 
387 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0293728  normal  0.0125727 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2727  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.38 
 
 
389 aa  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2589  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.86 
 
 
390 aa  47.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000683478  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4115  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.86 
 
 
390 aa  47.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2322  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.29 
 
 
389 aa  47  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0714  butyryl-CoA dehydrogenase  25.65 
 
 
384 aa  47.4  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0684  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.94 
 
 
379 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456474  normal  0.877291 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4214  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.51 
 
 
386 aa  47  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.234142  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2828  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.57 
 
 
389 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2394  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.29 
 
 
389 aa  47  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.869835 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1672  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.29 
 
 
389 aa  46.6  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4272  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.86 
 
 
390 aa  46.6  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0196507 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2973  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.57 
 
 
389 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.698816  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3223  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.11 
 
 
389 aa  46.6  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0153994 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1530  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.57 
 
 
389 aa  47  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.295941  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1335  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.38 
 
 
379 aa  46.6  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.254429  normal  0.854455 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2056  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.14 
 
 
377 aa  46.6  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.232194  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05570  acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  25.97 
 
 
377 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.213032 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0100  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.22 
 
 
390 aa  46.2  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49560  Acyl-CoA dehydrogenase  28.67 
 
 
393 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.531636  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  21.35 
 
 
380 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1381  Butyryl-CoA dehydrogenase  21.79 
 
 
379 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2245  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  23.1 
 
 
389 aa  45.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0407  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.69 
 
 
378 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1029  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  20.37 
 
 
387 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239684  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2377  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.53 
 
 
381 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0847683  hitchhiker  0.00260799 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28760  acyl-CoA dehydrogenase  21.82 
 
 
382 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12851  normal  0.0971486 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>