64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1359 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1359  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  100 
 
 		 426 aa  872    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3114  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.82 
 
 		 364 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3005  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.82 
 
 		 364 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4987  acyl-CoA dehydrogenase family protein-like  24.41 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.432457  normal  0.841072 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1150  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  24.7 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.428628 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2211  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  20.85 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1309  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.4 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2174  putative acyl-CoA dehydrogenase  23.53 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4667  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  25.24 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0171462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3928  acyl-CoA dehydrogenase, putative  24.54 
 
 		 366 aa  50.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.438549  normal  0.0461862 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2807  hypothetical protein  31.43 
 
 		 333 aa  50.1  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0918  acyl-CoA dehydrogenase  27.64 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2752  acyl-CoA dehydrogenase-like  22.5 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.171242  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0996  acyl-CoA dehydrogenase-like  24.02 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.286949  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2485  acyl-CoA dehydrogenase  26.06 
 
 		 398 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4820  putative acyl-CoA dehydrogenase  25.55 
 
 		 375 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3077  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.81 
 
 		 424 aa  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.765136  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3029  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.83 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318587  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  19.53 
 
 		 379 aa  48.5  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1141  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.08 
 
 		 387 aa  48.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2628  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.36 
 
 		 423 aa  47.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122301  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2898  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  21.84 
 
 		 379 aa  47.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249127 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20310  predicted protein  32.91 
 
 		 434 aa  47.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.130421  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4008  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.37 
 
 		 402 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0826  acyl-CoA dehydrogenase  27.14 
 
 		 377 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2178  acyl-CoA dehydrogenase  27.14 
 
 		 377 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.480909  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2929  hypothetical protein  28.42 
 
 		 355 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0481  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.01 
 
 		 363 aa  47.4  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3222  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.58 
 
 		 386 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1906  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.29 
 
 		 408 aa  47  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1150  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.23 
 
 		 380 aa  47  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0315  acyl-CoA dehydrogenase-like  23.39 
 
 		 391 aa  46.6  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1706  putative acyl-CoA dehydrogenase  25.42 
 
 		 375 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.087432  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1395  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3779  isovaleryl-CoA dehydrogenase  22.05 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2961  acyl-CoA dehydrogenase-like  25.13 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3057  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.05 
 
 		 396 aa  45.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  20.52 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0732  isovaleryl-CoA dehydrogenase  19.59 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2613  putative acyl-CoA dehydrogenase family protein  24.91 
 
 		 373 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.346291 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2090  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.4 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0739056  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4306  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.09 
 
 		 424 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.530471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4102  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.77 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.757866  normal  0.974192 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2439  long-chain-acyl-CoA dehydrogenase  21.11 
 
 		 391 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0991983  normal  0.0569635 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5991  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.31 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000302563 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5417  putative acyl-CoA dehydrogenase family protein  22.15 
 
 		 373 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1850  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.12 
 
 		 385 aa  44.3  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.090649  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4852  acyl-CoA dehydrogenase-like  22.77 
 
 		 395 aa  44.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.150232 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2850  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  19.1 
 
 		 381 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1803  acyl-CoA dehydrogenase  26.63 
 
 		 377 aa  44.7  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545777  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34490  hypothetical protein  29.45 
 
 		 355 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000897326  normal  0.153318 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0144  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.51 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3206  acyl-CoA dehydrogenase-like  19.48 
 
 		 386 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.518782 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.96 
 
 		 381 aa  43.9  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4456  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.3 
 
 		 403 aa  43.9  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1354  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.98 
 
 		 385 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.70275 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0478  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.28 
 
 		 387 aa  43.5  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1953  putative acyl-CoA dehydrogenase family protein  26.36 
 
 		 415 aa  43.5  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.134016 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0344  acyl-CoA dehydrogenase-like  21.13 
 
 		 395 aa  43.5  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04688  Isovaleryl-coenzyme A dehydrogenase (EC 1.3.99.10) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6T5L6]  22.11 
 
 		 431 aa  43.5  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2069  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.81 
 
 		 403 aa  43.5  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0313  isovaleryl-CoA dehydrogenase  21.39 
 
 		 395 aa  43.5  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.740089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0103  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.08 
 
 		 378 aa  43.1  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1559  acyl-CoA dehydrogenase-like  23.12 
 
 		 387 aa  43.1  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.456319 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>