216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2807 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2807  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  660    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5261  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.94 
 
 
338 aa  238  8e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0481  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.74 
 
 
363 aa  161  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4987  acyl-CoA dehydrogenase family protein-like  27.64 
 
 
367 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.432457  normal  0.841072 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3114  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.64 
 
 
364 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3005  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.64 
 
 
364 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1126  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.18 
 
 
373 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2062  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.55 
 
 
395 aa  67.4  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0402  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.85 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1085  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.43 
 
 
373 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.863384  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0313  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25.45 
 
 
395 aa  62  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.740089  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0344  acyl-CoA dehydrogenase-like  23.87 
 
 
395 aa  60.5  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2211  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.41 
 
 
378 aa  59.7  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3291  acyl-CoA dehydrogenase-like  27.85 
 
 
388 aa  59.3  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1456  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.01 
 
 
398 aa  59.3  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2948  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.4 
 
 
416 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0471344  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1215  acyl-CoA dehydrogenase family protein-like  25.08 
 
 
335 aa  55.8  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3413  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.37 
 
 
385 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.926635  normal  0.183052 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0319  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.29 
 
 
383 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.339666  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03805  acyl-CoA dehydrogenase  25.12 
 
 
387 aa  55.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7011  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.55 
 
 
382 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655237 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1359  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  25.83 
 
 
426 aa  54.3  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1645  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.31 
 
 
387 aa  53.9  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1787  hypothetical protein  22.77 
 
 
389 aa  53.5  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08440  acyl-CoA dehydrogenase  23.11 
 
 
389 aa  53.1  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.231358  normal  0.194083 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0970  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.25 
 
 
379 aa  53.1  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1183  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  25.33 
 
 
390 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1788  hypothetical protein  23.01 
 
 
389 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2506  isovaleryl-CoA dehydrogenase  26.19 
 
 
385 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.791052  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1803  acyl-CoA dehydrogenase  26.13 
 
 
377 aa  52.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545777  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2482  butyryl-CoA dehydrogenase  26.42 
 
 
395 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1168  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.19 
 
 
385 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437637  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0821  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.77 
 
 
409 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384147  normal  0.990129 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2093  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.64 
 
 
398 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0300334  normal  0.0497691 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2476  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.77 
 
 
380 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.185436 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01905  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  25.93 
 
 
397 aa  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1529  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  25.82 
 
 
389 aa  51.2  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.845789  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2837  putative acyl-CoA dehydrogenase  24.44 
 
 
375 aa  50.8  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.926618 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1179  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  27.54 
 
 
392 aa  51.2  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4358  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.38 
 
 
381 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0892384  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1333  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.17 
 
 
396 aa  50.8  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0832215  hitchhiker  0.00420458 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0857  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.39 
 
 
408 aa  50.8  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00258655  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4197  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.53 
 
 
386 aa  50.4  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.142048  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4588  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.04 
 
 
393 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1498  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.82 
 
 
382 aa  50.4  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0140  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  31.36 
 
 
376 aa  50.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2603  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.49 
 
 
633 aa  50.1  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.197382  normal  0.147654 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.07 
 
 
381 aa  49.7  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1759  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  21.07 
 
 
397 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218239  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1806  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  21.07 
 
 
397 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1977  butyryl-CoA dehydrogenase  21.22 
 
 
397 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6843  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.19 
 
 
393 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1740  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  21.07 
 
 
397 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0177648  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1139  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.98 
 
 
399 aa  49.7  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2136  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.98 
 
 
380 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.281355 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0100  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.87 
 
 
390 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3466  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  21.76 
 
 
393 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360992  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0117  Acyl-CoA dehydrogenase-like  26.29 
 
 
393 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0899419  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5121  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.31 
 
 
393 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.975401  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5538  putative acyl-CoA dehydrogenase  23.87 
 
 
384 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4532  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.61 
 
 
387 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.181691  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6742  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.09 
 
 
395 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224399  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.71 
 
 
385 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392534  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0276  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.28 
 
 
398 aa  48.9  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0872822 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  23.61 
 
 
381 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6416  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.17 
 
 
381 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.372827 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  23.61 
 
 
381 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.58 
 
 
389 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  23.61 
 
 
381 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2178  acyl-CoA dehydrogenase  25.68 
 
 
377 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.480909  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0423  isovaleryl-CoA dehydrogenase  21.76 
 
 
414 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.733872  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  23.61 
 
 
381 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1804  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25 
 
 
390 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392184  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0249  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.94 
 
 
383 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.538468  normal  0.417839 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2174  putative acyl-CoA dehydrogenase  26.21 
 
 
382 aa  48.5  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  23.61 
 
 
381 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  23.61 
 
 
381 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05840  glutaryl-CoA dehydrogenase  26.54 
 
 
393 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  23.61 
 
 
381 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0502  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.44 
 
 
387 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5829  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.5 
 
 
395 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.628432  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2176  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.25 
 
 
380 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0826  acyl-CoA dehydrogenase  25.68 
 
 
377 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0658  acyl-CoA dehydrogenase  25.26 
 
 
388 aa  47.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3127  acyl-CoA dehydrogenase-like  21.49 
 
 
393 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.105998  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5240  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  21.49 
 
 
393 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288959  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1268  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.98 
 
 
413 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.831834  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0918  acyl-CoA dehydrogenase  25.68 
 
 
377 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4367  butyryl-CoA dehydrogenase  20.53 
 
 
397 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2576  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.27 
 
 
378 aa  47.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4686  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  21.25 
 
 
393 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162224  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2318  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.41 
 
 
390 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.759089  normal  0.0223321 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4224  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.53 
 
 
400 aa  47.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0700017  normal  0.0824066 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0931  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.64 
 
 
386 aa  47.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0550  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.26 
 
 
377 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193039  decreased coverage  0.00272664 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3313  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.56 
 
 
384 aa  47  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01235  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  23.65 
 
 
382 aa  47  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29441  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3108  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  23.43 
 
 
383 aa  47  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0960  isovaleryl-CoA dehydrogenase  21.25 
 
 
393 aa  47  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.433991  normal  0.388602 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5417  putative acyl-CoA dehydrogenase family protein  22.56 
 
 
373 aa  46.6  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>