More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1529 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1645  isovaleryl-CoA dehydrogenase  86.3 
 
 		 387 aa  683    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1529  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  100 
 
 		 389 aa  795    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.845789  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2161  isovaleryl-CoA dehydrogenase  84.03 
 
 		 381 aa  627  1e-179  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0871014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3157  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  77.72 
 
 		 388 aa  583  1.0000000000000001e-165  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.535585 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1874  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  74.55 
 
 		 387 aa  580  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.33835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4378  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  75.07 
 
 		 381 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6510  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  75.07 
 
 		 381 aa  569  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.41485  normal  0.721434 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4272  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.39 
 
 		 390 aa  536  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0196507 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3933  Acyl-CoA dehydrogenase-like  69.19 
 
 		 390 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4263  acyl-CoA dehydrogenase-like  69.66 
 
 		 390 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.662141  normal  0.561312 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3693  isovaleryl-CoA dehydrogenase  70.18 
 
 		 390 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1804  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  69.66 
 
 		 390 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392184  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1739  isovaleryl-CoA dehydrogenase  68.5 
 
 		 390 aa  529  1e-149  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3387  isovaleryl-CoA dehydrogenase  68.07 
 
 		 391 aa  525  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197098  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2780  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  68.57 
 
 		 390 aa  525  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0393743 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03805  acyl-CoA dehydrogenase  67.28 
 
 		 387 aa  522  1e-147  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3018  Acyl-CoA dehydrogenase  67.55 
 
 		 407 aa  523  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6658  isovaleryl-CoA dehydrogenase  70.18 
 
 		 390 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1142  isovaleryl-CoA dehydrogenase  66.32 
 
 		 386 aa  517  1.0000000000000001e-145  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.268805  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3633  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  66.05 
 
 		 386 aa  512  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0817586  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1168  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  67.37 
 
 		 385 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2506  isovaleryl-CoA dehydrogenase  67.11 
 
 		 385 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.791052  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3289  isovaleryl-CoA dehydrogenase  64.94 
 
 		 390 aa  508  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  66.84 
 
 		 385 aa  508  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2318  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  68.67 
 
 		 390 aa  508  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.759089  normal  0.0223321 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0289  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  68.15 
 
 		 391 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0226098  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02412  isovaleryl-CoA dehydrogenase  63.25 
 
 		 389 aa  504  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.719746  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1297  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  65.09 
 
 		 387 aa  504  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.329164  normal  0.246274 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1458  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  64.38 
 
 		 389 aa  504  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.499178 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3223  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.59 
 
 		 389 aa  503  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0153994 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0037  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  65.44 
 
 		 387 aa  503  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119681  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0732  isovaleryl-CoA dehydrogenase  65.61 
 
 		 387 aa  503  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2570  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  64.64 
 
 		 389 aa  504  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2797  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.85 
 
 		 389 aa  503  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4724  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  65.1 
 
 		 390 aa  502  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2973  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.59 
 
 		 389 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.698816  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1603  isovaleryl-CoA dehydrogenase  63.06 
 
 		 389 aa  496  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2033  isovaleryl-CoA dehydrogenase  62.47 
 
 		 387 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0666462  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2846  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.32 
 
 		 389 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2245  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  63.32 
 
 		 389 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2322  isovaleryl-CoA dehydrogenase  62.8 
 
 		 389 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2394  isovaleryl-CoA dehydrogenase  62.8 
 
 		 389 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.869835 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2828  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.06 
 
 		 389 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1672  isovaleryl-CoA dehydrogenase  62.8 
 
 		 389 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1362  isovaleryl-CoA dehydrogenase  63.85 
 
 		 389 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.431847 
 
 
-
 
NC_004310  BR0020  isovaleryl-CoA dehydrogenase  65.96 
 
 		 382 aa  489  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1897  isovaleryl-CoA dehydrogenase  62.7 
 
 		 389 aa  489  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1787  hypothetical protein  62.27 
 
 		 389 aa  488  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1788  hypothetical protein  62.27 
 
 		 389 aa  489  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1530  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  62.8 
 
 		 389 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.295941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0471  isovaleryl-CoA dehydrogenase  62.31 
 
 		 393 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3656  isovaleryl-CoA dehydrogenase  62.73 
 
 		 387 aa  489  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.179163  normal  0.0293073 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0947  isovaleryl-CoA dehydrogenase  62.31 
 
 		 393 aa  489  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818935  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2056  putative isovaleryl-CoA dehydrogenase  62.31 
 
 		 393 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108299  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2727  isovaleryl-CoA dehydrogenase  62.53 
 
 		 389 aa  490  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38440  citronelloyl-CoA dehydrogenase, GnyD  61.94 
 
 		 387 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3274  citronelloyl-CoA dehydrogenase, GnyD  61.94 
 
 		 387 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1812  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  61.94 
 
 		 387 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0871457  normal  0.415388 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2119  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.87 
 
 		 390 aa  486  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148025 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0802  isovaleryl-CoA dehydrogenase  62.05 
 
 		 393 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0542  isovaleryl-CoA dehydrogenase  62.05 
 
 		 393 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470015  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0654  isovaleryl-CoA dehydrogenase  62.05 
 
 		 393 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.548122  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0017  isovaleryl-CoA dehydrogenase  65.7 
 
 		 382 aa  486  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3466  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  62.31 
 
 		 393 aa  485  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1959  putative isovaleryl-CoA dehydrogenase  62.92 
 
 		 393 aa  484  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1608  isovaleryl-CoA dehydrogenase  62.05 
 
 		 393 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2121  isovaleryl-CoA dehydrogenase  62.11 
 
 		 388 aa  482  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.274166  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2739  acyl-CoA dehydrogenase, putative  61.68 
 
 		 447 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3662  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  61.42 
 
 		 387 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000131881 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0198  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  65.18 
 
 		 387 aa  483  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140883  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5121  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  62.05 
 
 		 393 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.975401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2470  isovaleryl-CoA dehydrogenase  62.2 
 
 		 387 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0293728  normal  0.0125727 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0100  isovaleryl-CoA dehydrogenase  62.76 
 
 		 390 aa  484  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1948  isovaleryl-CoA dehydrogenase  63.35 
 
 		 387 aa  481  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113187  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4190  isovaleryl-CoA dehydrogenase  61.54 
 
 		 393 aa  483  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49560  Acyl-CoA dehydrogenase  62.31 
 
 		 393 aa  483  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.531636  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05480  acyl-CoA dehydrogenase  62.01 
 
 		 389 aa  482  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2925  isovaleryl-CoA dehydrogenase  61.04 
 
 		 389 aa  483  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  62.05 
 
 		 393 aa  484  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2062  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  60.87 
 
 		 395 aa  478  1e-134  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4064  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  61.42 
 
 		 424 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322511  hitchhiker  0.0046695 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0423  isovaleryl-CoA dehydrogenase  61.54 
 
 		 414 aa  478  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.733872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0960  isovaleryl-CoA dehydrogenase  61.79 
 
 		 393 aa  481  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.433991  normal  0.388602 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0356  isovaleryl-CoA dehydrogenase  60.98 
 
 		 392 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.969667  decreased coverage  0.00000934354 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0103  isovaleryl-CoA dehydrogenase  61.54 
 
 		 393 aa  478  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1074  isovaleryl-CoA dehydrogenase  61.72 
 
 		 387 aa  479  1e-134  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.490532  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1777  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  61.42 
 
 		 387 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186488 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3127  acyl-CoA dehydrogenase-like  61.54 
 
 		 393 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.105998  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0931  isovaleryl-CoA dehydrogenase  63.61 
 
 		 386 aa  479  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0966  acyl-CoA dehydrogenase  61.72 
 
 		 387 aa  479  1e-134  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4532  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  67.02 
 
 		 387 aa  479  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.181691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4588  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  61.79 
 
 		 393 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5240  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  61.54 
 
 		 393 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5032  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  61.28 
 
 		 393 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4371  isovaleryl-CoA dehydrogenase  61.28 
 
 		 395 aa  477  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4686  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  61.54 
 
 		 393 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5991  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  61.4 
 
 		 395 aa  473  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000302563 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3360  isovaleryl-CoA dehydrogenase  60.05 
 
 		 410 aa  473  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3562  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  61.03 
 
 		 393 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.364762 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1719  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.32 
 
 		 389 aa  474  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>