More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2013 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3633  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  84.86 
 
 		 386 aa  687    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0817586  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2506  isovaleryl-CoA dehydrogenase  96.36 
 
 		 385 aa  772    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.791052  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1297  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  78.12 
 
 		 387 aa  636    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.329164  normal  0.246274 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1142  isovaleryl-CoA dehydrogenase  77.81 
 
 		 386 aa  644    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.268805  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 		 385 aa  792    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0732  isovaleryl-CoA dehydrogenase  80.42 
 
 		 387 aa  655    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1168  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  96.1 
 
 		 385 aa  771    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0037  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  70.23 
 
 		 387 aa  564  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119681  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0020  isovaleryl-CoA dehydrogenase  70.9 
 
 		 382 aa  541  1e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0017  isovaleryl-CoA dehydrogenase  70.63 
 
 		 382 aa  539  9.999999999999999e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03805  acyl-CoA dehydrogenase  66.84 
 
 		 387 aa  532  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2119  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  67.18 
 
 		 390 aa  531  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148025 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0931  isovaleryl-CoA dehydrogenase  68.23 
 
 		 386 aa  525  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4532  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  70.31 
 
 		 387 aa  525  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.181691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4272  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  64.83 
 
 		 390 aa  523  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0196507 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1948  isovaleryl-CoA dehydrogenase  65.27 
 
 		 387 aa  521  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113187  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3933  Acyl-CoA dehydrogenase-like  65.96 
 
 		 390 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02412  isovaleryl-CoA dehydrogenase  64.83 
 
 		 389 aa  523  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.719746  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4724  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  65.54 
 
 		 390 aa  520  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1788  hypothetical protein  62.92 
 
 		 389 aa  519  1e-146  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1804  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  65.61 
 
 		 390 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392184  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2570  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.09 
 
 		 389 aa  520  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2033  isovaleryl-CoA dehydrogenase  64.4 
 
 		 387 aa  520  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0666462  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4263  acyl-CoA dehydrogenase-like  66.14 
 
 		 390 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.662141  normal  0.561312 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3223  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  62.3 
 
 		 389 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0153994 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3662  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.45 
 
 		 387 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000131881 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1603  isovaleryl-CoA dehydrogenase  62.99 
 
 		 389 aa  514  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2780  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  64.3 
 
 		 390 aa  516  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0393743 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1787  hypothetical protein  62.66 
 
 		 389 aa  516  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3693  isovaleryl-CoA dehydrogenase  65.7 
 
 		 390 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4064  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.45 
 
 		 424 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322511  hitchhiker  0.0046695 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1897  isovaleryl-CoA dehydrogenase  62.47 
 
 		 389 aa  511  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2739  acyl-CoA dehydrogenase, putative  63.45 
 
 		 447 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1812  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.45 
 
 		 387 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0871457  normal  0.415388 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2470  isovaleryl-CoA dehydrogenase  63.71 
 
 		 387 aa  512  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0293728  normal  0.0125727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3656  isovaleryl-CoA dehydrogenase  63.45 
 
 		 387 aa  513  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.179163  normal  0.0293073 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2245  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  63.09 
 
 		 389 aa  512  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2322  isovaleryl-CoA dehydrogenase  62.3 
 
 		 389 aa  512  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1777  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.45 
 
 		 387 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186488 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0100  isovaleryl-CoA dehydrogenase  64.92 
 
 		 390 aa  510  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3289  isovaleryl-CoA dehydrogenase  64.3 
 
 		 390 aa  510  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2797  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  61.78 
 
 		 389 aa  509  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1672  isovaleryl-CoA dehydrogenase  62.3 
 
 		 389 aa  510  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1529  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  66.84 
 
 		 389 aa  508  1e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.845789  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1458  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  61.52 
 
 		 389 aa  510  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.499178 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2394  isovaleryl-CoA dehydrogenase  62.3 
 
 		 389 aa  510  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.869835 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1739  isovaleryl-CoA dehydrogenase  62.89 
 
 		 390 aa  509  1e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1362  isovaleryl-CoA dehydrogenase  62.57 
 
 		 389 aa  510  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.431847 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0654  isovaleryl-CoA dehydrogenase  63.28 
 
 		 393 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.548122  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0802  isovaleryl-CoA dehydrogenase  63.28 
 
 		 393 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2056  putative isovaleryl-CoA dehydrogenase  63.28 
 
 		 393 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108299  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0471  isovaleryl-CoA dehydrogenase  63.28 
 
 		 393 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3274  citronelloyl-CoA dehydrogenase, GnyD  63.71 
 
 		 387 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0542  isovaleryl-CoA dehydrogenase  63.28 
 
 		 393 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470015  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1959  putative isovaleryl-CoA dehydrogenase  63.28 
 
 		 393 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05480  acyl-CoA dehydrogenase  62.73 
 
 		 389 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2727  isovaleryl-CoA dehydrogenase  62.57 
 
 		 389 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2188  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  67.19 
 
 		 390 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1608  isovaleryl-CoA dehydrogenase  63.28 
 
 		 393 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38440  citronelloyl-CoA dehydrogenase, GnyD  63.71 
 
 		 387 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2973  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  61.52 
 
 		 389 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.698816  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0279  acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  63.85 
 
 		 393 aa  502  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.236676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6510  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  66.05 
 
 		 381 aa  501  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.41485  normal  0.721434 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0129  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  63.33 
 
 		 393 aa  501  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0289  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  67.02 
 
 		 391 aa  501  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0226098  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1466  isovaleryl-CoA dehydrogenase  63.02 
 
 		 393 aa  501  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429983  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0960  isovaleryl-CoA dehydrogenase  63.02 
 
 		 393 aa  502  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.433991  normal  0.388602 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0103  isovaleryl-CoA dehydrogenase  63.02 
 
 		 393 aa  504  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2846  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  61.78 
 
 		 389 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2925  isovaleryl-CoA dehydrogenase  62.2 
 
 		 389 aa  501  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4378  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  65.25 
 
 		 381 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2121  isovaleryl-CoA dehydrogenase  61.68 
 
 		 388 aa  499  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.274166  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2318  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  66.67 
 
 		 390 aa  498  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.759089  normal  0.0223321 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2828  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  61.26 
 
 		 389 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3157  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  67.99 
 
 		 388 aa  500  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.535585 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1645  isovaleryl-CoA dehydrogenase  66.4 
 
 		 387 aa  499  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0137  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  63.08 
 
 		 393 aa  500  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1530  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  60.99 
 
 		 389 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.295941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0356  isovaleryl-CoA dehydrogenase  63.02 
 
 		 392 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.969667  decreased coverage  0.00000934354 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3387  isovaleryl-CoA dehydrogenase  63.19 
 
 		 391 aa  499  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197098  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3127  acyl-CoA dehydrogenase-like  62.05 
 
 		 393 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.105998  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5121  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  61.79 
 
 		 393 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.975401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3360  isovaleryl-CoA dehydrogenase  63.35 
 
 		 410 aa  500  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5240  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  62.05 
 
 		 393 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4686  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  62.76 
 
 		 393 aa  498  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3779  isovaleryl-CoA dehydrogenase  61.72 
 
 		 396 aa  497  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6658  isovaleryl-CoA dehydrogenase  65.08 
 
 		 390 aa  496  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1874  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  64.02 
 
 		 387 aa  495  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.33835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0198  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  65.54 
 
 		 387 aa  495  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140883  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5032  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  62.05 
 
 		 393 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0135  isovaleryl-CoA dehydrogenase  62.5 
 
 		 393 aa  498  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3057  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  61.72 
 
 		 396 aa  495  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3018  Acyl-CoA dehydrogenase  62.43 
 
 		 407 aa  497  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0423  isovaleryl-CoA dehydrogenase  61.79 
 
 		 414 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.733872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3466  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  62.57 
 
 		 393 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0947  isovaleryl-CoA dehydrogenase  61.72 
 
 		 393 aa  497  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818935  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0748  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  62.6 
 
 		 393 aa  497  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.239157  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5991  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  61.98 
 
 		 395 aa  495  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000302563 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4588  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  61.54 
 
 		 393 aa  494  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3842  acyl-CoA dehydrogenase-like  60.94 
 
 		 392 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.990363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>