30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1215 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1215  acyl-CoA dehydrogenase family protein-like  100 
 
 		 335 aa  664    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4987  acyl-CoA dehydrogenase family protein-like  36.68 
 
 		 367 aa  208  8e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.432457  normal  0.841072 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3005  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.37 
 
 		 364 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3114  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.37 
 
 		 364 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3656  isovaleryl-CoA dehydrogenase  22.22 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.179163  normal  0.0293073 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2807  hypothetical protein  24.92 
 
 		 333 aa  57  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5261  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.61 
 
 		 338 aa  54.3  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11696  acyl-CoA dehydrogenase fadE16  25.26 
 
 		 373 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.392207 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4064  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.7 
 
 		 424 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322511  hitchhiker  0.0046695 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1777  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.7 
 
 		 387 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186488 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0459  hypothetical protein  27.62 
 
 		 367 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3662  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.7 
 
 		 387 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000131881 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3970  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.26 
 
 		 376 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493916  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1812  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  22.01 
 
 		 387 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0871457  normal  0.415388 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1739  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25.68 
 
 		 390 aa  46.6  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3722  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  21.71 
 
 		 596 aa  46.6  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38440  citronelloyl-CoA dehydrogenase, GnyD  27.03 
 
 		 387 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2470  isovaleryl-CoA dehydrogenase  21.68 
 
 		 387 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0293728  normal  0.0125727 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4073  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.88 
 
 		 386 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2739  acyl-CoA dehydrogenase, putative  21.68 
 
 		 447 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5102  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.1 
 
 		 380 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3792  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  26.07 
 
 		 358 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.267616 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06170  acetyl-CoA dehydrogenase  19.67 
 
 		 602 aa  44.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.214158  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1109  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.68 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.39 
 
 		 385 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5062  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  21.38 
 
 		 387 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1179  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  23.34 
 
 		 392 aa  43.5  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3484  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.38 
 
 		 358 aa  43.5  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0481  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.26 
 
 		 363 aa  42.7  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1603  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.78 
 
 		 389 aa  42.7  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>