More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3722 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3549  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  68.39 
 
 		 604 aa  834    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1038  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  60.64 
 
 		 597 aa  727    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5112  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  70.81 
 
 		 599 aa  880    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06170  acetyl-CoA dehydrogenase  56.28 
 
 		 602 aa  669    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.214158  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4756  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.26 
 
 		 601 aa  679    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.714686  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3589  acyl-CoA dehydrogenase  64.65 
 
 		 597 aa  780    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.239864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3722  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 596 aa  1226    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1596  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.22 
 
 		 593 aa  559  1e-158  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0612446  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3086  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.7 
 
 		 594 aa  543  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2935  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.77 
 
 		 594 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.631694  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2471  butyryl-CoA dehydrogenase  45.62 
 
 		 597 aa  534  1e-150  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3595  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.23 
 
 		 594 aa  531  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0096  acyl-CoA dehydrogenase  47.23 
 
 		 594 aa  529  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4833  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.23 
 
 		 608 aa  529  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5153  acyl-CoA dehydrogenase  47.06 
 
 		 594 aa  528  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.649564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5142  acyl-CoA dehydrogenase  47.06 
 
 		 594 aa  528  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4875  acyl-CoA dehydrogenase  47.06 
 
 		 594 aa  528  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4717  acyl-CoA dehydrogenase  47.06 
 
 		 594 aa  528  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4732  acyl-CoA dehydrogenase  47.06 
 
 		 594 aa  528  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5246  acyl-CoA dehydrogenase  47.06 
 
 		 594 aa  528  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0390  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.55 
 
 		 591 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.40764  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5147  acyl-CoA dehydrogenase  47.06 
 
 		 594 aa  528  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1593  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.05 
 
 		 592 aa  527  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.310867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5115  acyl-CoA dehydrogenase  47.06 
 
 		 594 aa  528  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0360  butyryl-CoA dehydrogenase  47.72 
 
 		 591 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0388  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.55 
 
 		 591 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2128  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.7 
 
 		 592 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.23514  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2875  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.36 
 
 		 592 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109563  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2089  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.53 
 
 		 592 aa  513  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000228924 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1807  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.28 
 
 		 578 aa  502  1e-141  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9558  normal  0.985453 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0351  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.26 
 
 		 586 aa  490  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4530  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.54 
 
 		 591 aa  482  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1094  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.53 
 
 		 581 aa  470  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0303784  normal  0.0187892 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3652  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.54 
 
 		 584 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2795  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.81 
 
 		 585 aa  427  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.596008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3006  acyl-CoA dehydrogenase  40.21 
 
 		 569 aa  403  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.659019 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2318  acyl-CoA dehydrogenase  40.03 
 
 		 569 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2380  acyl-CoA dehydrogenase  39.51 
 
 		 569 aa  396  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0460378  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2128  acyl-CoA dehydrogenase  39.51 
 
 		 569 aa  395  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.422532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2114  acyl-CoA dehydrogenase  39.51 
 
 		 569 aa  395  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.575523  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2159  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.69 
 
 		 569 aa  395  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.235512  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2453  acyl-CoA dehydrogenase  39.34 
 
 		 569 aa  395  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2371  acyl-CoA dehydrogenase  39.34 
 
 		 569 aa  395  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2191  acyl-CoA dehydrogenase  39.34 
 
 		 569 aa  392  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2352  acyl-CoA dehydrogenase  39.34 
 
 		 569 aa  392  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1727  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.98 
 
 		 569 aa  389  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1452  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.99 
 
 		 582 aa  317  5e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.71 
 
 		 379 aa  297  4e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.69 
 
 		 376 aa  295  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  40.66 
 
 		 376 aa  295  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  40.66 
 
 		 376 aa  295  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4391  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.9 
 
 		 386 aa  294  3e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  40.66 
 
 		 381 aa  293  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  40.66 
 
 		 376 aa  293  5e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.56 
 
 		 376 aa  293  5e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  40.66 
 
 		 376 aa  293  6e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  40.66 
 
 		 376 aa  293  6e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  40.66 
 
 		 381 aa  293  6e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  40.66 
 
 		 381 aa  293  8e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  40.41 
 
 		 376 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3775  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.2 
 
 		 388 aa  287  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0119178  unclonable  0.00000752707 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1109  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40 
 
 		 388 aa  286  5.999999999999999e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3451  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.73 
 
 		 377 aa  280  4e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0155  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.9 
 
 		 388 aa  280  5e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000954759  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.95 
 
 		 379 aa  280  5e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2382  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.75 
 
 		 389 aa  278  2e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4277  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.01 
 
 		 579 aa  278  3e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.943677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  38.85 
 
 		 379 aa  276  6e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  39.7 
 
 		 379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  39.7 
 
 		 379 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  39.45 
 
 		 379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  39.45 
 
 		 379 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  39.7 
 
 		 379 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  39.45 
 
 		 379 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.74 
 
 		 389 aa  274  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  39.45 
 
 		 379 aa  274  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  39.45 
 
 		 379 aa  274  3e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000286159 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  39.2 
 
 		 379 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3862  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.09 
 
 		 379 aa  269  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.44 
 
 		 379 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.78 
 
 		 380 aa  267  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.28 
 
 		 381 aa  263  6e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4272  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.41 
 
 		 580 aa  263  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4249  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.66 
 
 		 580 aa  263  8e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.808927  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1381  Butyryl-CoA dehydrogenase  37.59 
 
 		 379 aa  263  8e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.59 
 
 		 379 aa  263  8.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4118  Acyl-CoA dehydrogenase  40.62 
 
 		 580 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.846783  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0585  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.72 
 
 		 379 aa  257  4e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4086  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.24 
 
 		 377 aa  256  9e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303595  normal  0.349393 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3973  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.24 
 
 		 377 aa  256  9e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.78306  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_002950  PG1076  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  37.19 
 
 		 379 aa  254  3e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.228764 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1697  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.85 
 
 		 386 aa  254  3e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0868604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3040  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.84 
 
 		 402 aa  254  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0629704  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  36.84 
 
 		 379 aa  253  6e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0364  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.83 
 
 		 386 aa  252  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1052  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.87 
 
 		 386 aa  253  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5650  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.44 
 
 		 377 aa  249  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0656  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.11 
 
 		 380 aa  248  2e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1288  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.66 
 
 		 379 aa  247  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.751821 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.04 
 
 		 379 aa  246  6.999999999999999e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>