More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1038 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3722  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  60.64 
 
 		 596 aa  727    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1038  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 597 aa  1222    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5112  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  58.52 
 
 		 599 aa  697    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3589  acyl-CoA dehydrogenase  63.71 
 
 		 597 aa  756    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.239864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3549  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  59.44 
 
 		 604 aa  700    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4756  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.01 
 
 		 601 aa  577  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.714686  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3086  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.37 
 
 		 594 aa  570  1e-161  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1596  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.08 
 
 		 593 aa  566  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0612446  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4732  acyl-CoA dehydrogenase  50.42 
 
 		 594 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2471  butyryl-CoA dehydrogenase  48.91 
 
 		 597 aa  563  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2935  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.86 
 
 		 594 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.631694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5115  acyl-CoA dehydrogenase  50.25 
 
 		 594 aa  561  1e-158  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4875  acyl-CoA dehydrogenase  50.25 
 
 		 594 aa  560  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4717  acyl-CoA dehydrogenase  50.25 
 
 		 594 aa  560  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5246  acyl-CoA dehydrogenase  50.25 
 
 		 594 aa  560  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5153  acyl-CoA dehydrogenase  50.08 
 
 		 594 aa  558  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.649564  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5147  acyl-CoA dehydrogenase  50.25 
 
 		 594 aa  558  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3595  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.08 
 
 		 594 aa  561  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0096  acyl-CoA dehydrogenase  50.08 
 
 		 594 aa  556  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5142  acyl-CoA dehydrogenase  50.25 
 
 		 594 aa  558  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4833  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.08 
 
 		 608 aa  558  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06170  acetyl-CoA dehydrogenase  48.92 
 
 		 602 aa  554  1e-156  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.214158  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1593  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.51 
 
 		 592 aa  549  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.310867  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0390  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.68 
 
 		 591 aa  548  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.40764  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0388  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.34 
 
 		 591 aa  542  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0360  butyryl-CoA dehydrogenase  50.51 
 
 		 591 aa  545  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1807  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.51 
 
 		 578 aa  540  9.999999999999999e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9558  normal  0.985453 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2875  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.32 
 
 		 592 aa  537  1e-151  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109563  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0351  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.32 
 
 		 586 aa  533  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2089  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.88 
 
 		 592 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000228924 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2128  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.88 
 
 		 592 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.23514  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3652  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.01 
 
 		 584 aa  509  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1094  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.17 
 
 		 581 aa  503  1e-141  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0303784  normal  0.0187892 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4530  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.42 
 
 		 591 aa  500  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2795  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.88 
 
 		 585 aa  420  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.596008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3006  acyl-CoA dehydrogenase  38.97 
 
 		 569 aa  397  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.659019 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2128  acyl-CoA dehydrogenase  39.14 
 
 		 569 aa  394  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.422532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2114  acyl-CoA dehydrogenase  39.13 
 
 		 569 aa  393  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.575523  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2159  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.04 
 
 		 569 aa  395  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.235512  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2318  acyl-CoA dehydrogenase  38.79 
 
 		 569 aa  395  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2371  acyl-CoA dehydrogenase  38.97 
 
 		 569 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2380  acyl-CoA dehydrogenase  39.17 
 
 		 569 aa  391  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0460378  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2191  acyl-CoA dehydrogenase  39.14 
 
 		 569 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1727  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.79 
 
 		 569 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2352  acyl-CoA dehydrogenase  39.14 
 
 		 569 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2453  acyl-CoA dehydrogenase  39.17 
 
 		 569 aa  391  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1452  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.48 
 
 		 582 aa  339  7e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1109  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.96 
 
 		 388 aa  297  3e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3775  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.21 
 
 		 388 aa  296  6e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0119178  unclonable  0.00000752707 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2382  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.5 
 
 		 389 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4391  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.4 
 
 		 386 aa  286  8e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.09 
 
 		 379 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.97 
 
 		 389 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.9 
 
 		 376 aa  282  1e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0155  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.09 
 
 		 388 aa  282  1e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000954759  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4277  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.13 
 
 		 579 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.943677  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  41.4 
 
 		 376 aa  280  5e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  41.4 
 
 		 376 aa  280  6e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  41.4 
 
 		 376 aa  280  6e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  41.4 
 
 		 376 aa  279  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  41.4 
 
 		 376 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  41.4 
 
 		 376 aa  278  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  41.4 
 
 		 381 aa  279  1e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  41.4 
 
 		 381 aa  278  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.15 
 
 		 376 aa  278  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  40.9 
 
 		 381 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  41.96 
 
 		 379 aa  274  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1052  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.41 
 
 		 386 aa  273  6e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  41.31 
 
 		 379 aa  273  7e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  41.31 
 
 		 379 aa  272  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  41.71 
 
 		 379 aa  272  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  41.06 
 
 		 379 aa  271  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.46 
 
 		 379 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  41.06 
 
 		 379 aa  270  5e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000286159 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3451  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.82 
 
 		 377 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  41.06 
 
 		 379 aa  270  7e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  41.06 
 
 		 379 aa  270  7e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3862  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.46 
 
 		 379 aa  270  8e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40 
 
 		 379 aa  269  8.999999999999999e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  41.06 
 
 		 379 aa  269  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.93 
 
 		 381 aa  266  7e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4118  Acyl-CoA dehydrogenase  35.77 
 
 		 580 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.846783  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4249  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.84 
 
 		 580 aa  266  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.808927  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4272  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.84 
 
 		 580 aa  266  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40 
 
 		 380 aa  265  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.55 
 
 		 380 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1381  Butyryl-CoA dehydrogenase  36.68 
 
 		 379 aa  259  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  37.24 
 
 		 379 aa  259  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.59 
 
 		 380 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0402  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.93 
 
 		 380 aa  257  5e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1232  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.14 
 
 		 381 aa  257  5e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.18 
 
 		 379 aa  256  6e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3040  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.43 
 
 		 402 aa  256  7e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0629704  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.24 
 
 		 379 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0585  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.46 
 
 		 379 aa  254  3e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  38.78 
 
 		 381 aa  252  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  38.78 
 
 		 381 aa  252  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  38.78 
 
 		 381 aa  252  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  38.78 
 
 		 381 aa  252  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.78 
 
 		 381 aa  252  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>