More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3549 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1038  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  59.44 
 
 		 597 aa  718    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4756  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.87 
 
 		 601 aa  668    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.714686  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06170  acetyl-CoA dehydrogenase  54.24 
 
 		 602 aa  660    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.214158  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3589  acyl-CoA dehydrogenase  62.9 
 
 		 597 aa  744    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.239864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3722  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  68.39 
 
 		 596 aa  853    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5112  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  78.57 
 
 		 599 aa  1000    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3549  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 604 aa  1232    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1593  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.64 
 
 		 592 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.310867  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0390  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.98 
 
 		 591 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.40764  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0388  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.15 
 
 		 591 aa  535  1e-150  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0360  butyryl-CoA dehydrogenase  47.81 
 
 		 591 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2471  butyryl-CoA dehydrogenase  44.61 
 
 		 597 aa  532  1e-150  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1596  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.58 
 
 		 593 aa  534  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0612446  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2089  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.89 
 
 		 592 aa  527  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000228924 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1807  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.99 
 
 		 578 aa  525  1e-148  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9558  normal  0.985453 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2128  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.06 
 
 		 592 aa  528  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.23514  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2935  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.85 
 
 		 594 aa  523  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.631694  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2875  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.82 
 
 		 592 aa  518  1e-146  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109563  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3595  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.29 
 
 		 594 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5153  acyl-CoA dehydrogenase  44.78 
 
 		 594 aa  512  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.649564  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3086  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.25 
 
 		 594 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0096  acyl-CoA dehydrogenase  44.86 
 
 		 594 aa  511  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5147  acyl-CoA dehydrogenase  44.86 
 
 		 594 aa  511  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5142  acyl-CoA dehydrogenase  44.86 
 
 		 594 aa  511  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5115  acyl-CoA dehydrogenase  44.86 
 
 		 594 aa  511  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4875  acyl-CoA dehydrogenase  44.86 
 
 		 594 aa  511  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4717  acyl-CoA dehydrogenase  44.86 
 
 		 594 aa  511  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4732  acyl-CoA dehydrogenase  44.69 
 
 		 594 aa  509  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5246  acyl-CoA dehydrogenase  44.86 
 
 		 594 aa  511  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4833  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.86 
 
 		 608 aa  511  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0351  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.3 
 
 		 586 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1094  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.82 
 
 		 581 aa  490  1e-137  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0303784  normal  0.0187892 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4530  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.52 
 
 		 591 aa  490  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2795  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.36 
 
 		 585 aa  443  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.596008  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3652  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.89 
 
 		 584 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2380  acyl-CoA dehydrogenase  40.07 
 
 		 569 aa  413  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0460378  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3006  acyl-CoA dehydrogenase  39.48 
 
 		 569 aa  410  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.659019 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2318  acyl-CoA dehydrogenase  39.62 
 
 		 569 aa  409  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2453  acyl-CoA dehydrogenase  39.9 
 
 		 569 aa  411  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2128  acyl-CoA dehydrogenase  39.97 
 
 		 569 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.422532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2114  acyl-CoA dehydrogenase  40.14 
 
 		 569 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.575523  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2371  acyl-CoA dehydrogenase  39.79 
 
 		 569 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2159  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.45 
 
 		 569 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.235512  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2191  acyl-CoA dehydrogenase  39.79 
 
 		 569 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2352  acyl-CoA dehydrogenase  39.79 
 
 		 569 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1727  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.1 
 
 		 569 aa  398  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1452  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.52 
 
 		 582 aa  335  1e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4391  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.4 
 
 		 386 aa  301  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.96 
 
 		 376 aa  297  5e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  41.62 
 
 		 376 aa  295  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  41.62 
 
 		 376 aa  295  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  41.62 
 
 		 381 aa  294  3e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41 
 
 		 379 aa  294  3e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1109  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40 
 
 		 388 aa  294  3e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  41.62 
 
 		 381 aa  293  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  41.62 
 
 		 376 aa  293  5e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  41.62 
 
 		 376 aa  293  5e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  41.62 
 
 		 376 aa  293  5e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3775  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40 
 
 		 388 aa  292  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0119178  unclonable  0.00000752707 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  40.97 
 
 		 381 aa  291  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  41.37 
 
 		 376 aa  290  4e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2382  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.65 
 
 		 389 aa  289  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0155  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.44 
 
 		 388 aa  286  9e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000954759  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.36 
 
 		 376 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0585  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.25 
 
 		 379 aa  275  2.0000000000000002e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3451  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.06 
 
 		 377 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1052  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.13 
 
 		 386 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4277  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.58 
 
 		 579 aa  274  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.943677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4118  Acyl-CoA dehydrogenase  34.98 
 
 		 580 aa  273  9e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.846783  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.85 
 
 		 389 aa  272  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.31 
 
 		 381 aa  271  2e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.09 
 
 		 379 aa  270  5e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4249  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.79 
 
 		 580 aa  270  8e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.808927  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3040  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.84 
 
 		 402 aa  269  8.999999999999999e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0629704  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  38 
 
 		 379 aa  268  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  38.5 
 
 		 379 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4272  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.6 
 
 		 580 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.25 
 
 		 379 aa  267  5e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1381  Butyryl-CoA dehydrogenase  36.84 
 
 		 379 aa  267  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  38.5 
 
 		 379 aa  267  5e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  36.34 
 
 		 379 aa  265  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3778  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.91 
 
 		 382 aa  264  3e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  0.271407 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.25 
 
 		 379 aa  264  4e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  38.5 
 
 		 379 aa  264  4e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  38.5 
 
 		 379 aa  263  6e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3973  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.48 
 
 		 377 aa  263  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.78306  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4086  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.48 
 
 		 377 aa  263  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303595  normal  0.349393 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  38.5 
 
 		 379 aa  263  8.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  38.25 
 
 		 379 aa  263  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  38.25 
 
 		 379 aa  262  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000286159 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  38.25 
 
 		 379 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  38.25 
 
 		 379 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.65 
 
 		 379 aa  261  3e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0837  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.69 
 
 		 390 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3862  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.84 
 
 		 379 aa  259  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1076  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  38.29 
 
 		 379 aa  257  5e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.228764 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2369  acyl-CoA dehydrogenase-like  37.25 
 
 		 380 aa  256  6e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1932  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38 
 
 		 380 aa  256  9e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.34 
 
 		 380 aa  256  9e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4257  butyryl-CoA dehydrogenase  37.59 
 
 		 377 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.725306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>