More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3291 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3291  acyl-CoA dehydrogenase-like  100 
 
 
388 aa  796    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6843  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  61.08 
 
 
393 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.52 
 
 
379 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1029  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.73 
 
 
387 aa  302  8.000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239684  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.01 
 
 
380 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  42.08 
 
 
379 aa  296  4e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  41.82 
 
 
379 aa  295  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.82 
 
 
379 aa  293  3e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  42.34 
 
 
379 aa  292  8e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  42.34 
 
 
379 aa  292  8e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1232  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.15 
 
 
381 aa  292  8e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1526  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.95 
 
 
404 aa  291  1e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.84855  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  42.08 
 
 
379 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  42.08 
 
 
379 aa  291  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  42.08 
 
 
379 aa  290  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4743  butyryl-CoA dehydrogenase  42.52 
 
 
417 aa  291  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  42.08 
 
 
379 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000286159 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0402  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.71 
 
 
380 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1719  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.73 
 
 
389 aa  288  9e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  41.82 
 
 
379 aa  288  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1336  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.78 
 
 
388 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11867  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1300  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  42.78 
 
 
388 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1317  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.78 
 
 
388 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.247959 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13303  acyl-CoA dehydrogenase fadE25  41.05 
 
 
389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0409  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.24 
 
 
406 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4115  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.62 
 
 
390 aa  281  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2589  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.62 
 
 
390 aa  281  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000683478  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1058  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.68 
 
 
386 aa  279  7e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.405365  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0714  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.67 
 
 
388 aa  278  8e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.0860013 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0585  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.27 
 
 
379 aa  278  1e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2353  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  39.74 
 
 
378 aa  277  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663187  normal  0.71414 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3862  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.78 
 
 
379 aa  277  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1471  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.38 
 
 
401 aa  277  2e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.129109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1697  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.37 
 
 
386 aa  276  3e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0868604  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6366  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.37 
 
 
387 aa  273  6e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.58 
 
 
389 aa  272  7e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4353  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.9 
 
 
385 aa  272  9e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1782  butyryl-CoA dehydrogenase  40.41 
 
 
379 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.257154  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28760  acyl-CoA dehydrogenase  38.9 
 
 
382 aa  268  8.999999999999999e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12851  normal  0.0971486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4530  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.63 
 
 
389 aa  268  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.335652  normal  0.412983 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2188  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.05 
 
 
387 aa  267  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1549  butyryl-CoA dehydrogenase  40.47 
 
 
387 aa  267  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.431805  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6030  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.58 
 
 
391 aa  266  5.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0249  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.21 
 
 
383 aa  265  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.538468  normal  0.417839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1345  acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain protein  39.58 
 
 
387 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0934  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.9 
 
 
387 aa  265  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.496704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4413  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.63 
 
 
384 aa  264  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0319  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.21 
 
 
383 aa  263  3e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.339666  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0876  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.11 
 
 
387 aa  263  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.189497  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4700  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.74 
 
 
384 aa  263  4e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.201387  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3575  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.68 
 
 
380 aa  262  6e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1647  acyl-CoA dehydrogenase  39.63 
 
 
385 aa  262  6e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.658516  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2695  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.82 
 
 
382 aa  262  6e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3576  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.89 
 
 
380 aa  262  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3306  Acyl-CoA dehydrogenase-like  40.37 
 
 
380 aa  261  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1490  butyryl-CoA dehydrogenase  39.9 
 
 
378 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08440  acyl-CoA dehydrogenase  39.73 
 
 
389 aa  259  7e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.231358  normal  0.194083 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  37.31 
 
 
379 aa  259  7e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.48 
 
 
379 aa  258  8e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4214  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.58 
 
 
386 aa  258  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.234142  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2584  butyryl-CoA dehydrogenase  38.22 
 
 
379 aa  257  2e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2286  butyryl-CoA dehydrogenase  38.22 
 
 
379 aa  257  2e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1076  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  37.17 
 
 
379 aa  256  3e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.228764 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.9 
 
 
380 aa  255  8e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0408  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.58 
 
 
378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0081  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.23 
 
 
642 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0656  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.5 
 
 
380 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.89 
 
 
381 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.89 
 
 
381 aa  250  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1483  butyryl-CoA dehydrogenase  39.53 
 
 
382 aa  250  3e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.96 
 
 
376 aa  249  8e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  37.96 
 
 
381 aa  248  9e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1390  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.53 
 
 
390 aa  248  9e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  37.96 
 
 
376 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  37.96 
 
 
376 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0966  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.16 
 
 
390 aa  248  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5850  acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain protein  40.58 
 
 
380 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.856697 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  37.96 
 
 
376 aa  247  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  37.96 
 
 
376 aa  248  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  37.96 
 
 
381 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2163  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.74 
 
 
389 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820192  normal  0.287496 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  37.96 
 
 
376 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  37.96 
 
 
381 aa  247  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  37.11 
 
 
381 aa  246  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  37.96 
 
 
376 aa  247  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0882  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.6 
 
 
381 aa  247  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000390729  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  37.11 
 
 
381 aa  246  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  37.11 
 
 
381 aa  246  4e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  37.11 
 
 
381 aa  246  4e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  37.11 
 
 
381 aa  246  4e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.84 
 
 
380 aa  246  4e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  37.11 
 
 
381 aa  246  4e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  37.11 
 
 
381 aa  246  4e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  37.11 
 
 
381 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3307  Acyl-CoA dehydrogenase-like  38.61 
 
 
380 aa  246  6e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6335  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.82 
 
 
386 aa  246  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.6 
 
 
381 aa  246  6e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3108  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.18 
 
 
383 aa  246  6.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4179  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.17 
 
 
381 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.011291  hitchhiker  0.000381045 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.7 
 
 
376 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>