More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_20310 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_20310  predicted protein  100 
 
 
434 aa  899    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.130421  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00824  acyl-CoA dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14850)  53.7 
 
 
439 aa  434  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1131  butyryl-CoA dehydrogenase  50.77 
 
 
392 aa  430  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00519609  hitchhiker  0.000110962 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01550  acyl-CoA oxidase, putative  48.95 
 
 
429 aa  427  1e-118  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0364  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.84 
 
 
386 aa  319  6e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3822  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.53 
 
 
379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.962066  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3574  putative acyl-CoA dehydrogenase  41.82 
 
 
377 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.57 
 
 
376 aa  301  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  39.04 
 
 
376 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  39.04 
 
 
376 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.56 
 
 
379 aa  296  4e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  39.04 
 
 
376 aa  296  6e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  39.04 
 
 
376 aa  296  6e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  38.77 
 
 
381 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  38.77 
 
 
376 aa  295  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  39.04 
 
 
376 aa  295  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  38.77 
 
 
381 aa  295  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.04 
 
 
376 aa  294  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  38.5 
 
 
381 aa  293  3e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0247  Acyl-CoA dehydrogenase  40.8 
 
 
378 aa  293  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0714  Acyl-CoA dehydrogenase  39.95 
 
 
377 aa  293  6e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5126  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.89 
 
 
377 aa  293  6e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.393324 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3404  acyl-CoA dehydrogenase-like  39.95 
 
 
377 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4963  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.95 
 
 
377 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5323  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.68 
 
 
377 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00118834  normal  0.0149252 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4385  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.41 
 
 
377 aa  289  8e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351154  normal  0.113053 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3973  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.62 
 
 
377 aa  288  9e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.78306  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4904  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.41 
 
 
377 aa  288  9e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316996  normal  0.149852 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4086  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.62 
 
 
377 aa  288  9e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303595  normal  0.349393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0397  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.98 
 
 
379 aa  288  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3656  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.68 
 
 
377 aa  288  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4257  butyryl-CoA dehydrogenase  40.21 
 
 
377 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.725306  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06620  butyryl-CoA dehydrogenase  38.46 
 
 
380 aa  286  2.9999999999999996e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5650  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.08 
 
 
377 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3451  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40 
 
 
377 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.5 
 
 
379 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05570  acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  40.16 
 
 
377 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.213032 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1084  butyryl-CoA dehydrogenase  39.08 
 
 
377 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0155468 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5641  Butyryl-CoA dehydrogenase  37.7 
 
 
379 aa  282  8.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0505  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.45 
 
 
561 aa  281  1e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0733  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.3 
 
 
377 aa  281  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.7 
 
 
380 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.17 
 
 
381 aa  280  5e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0837  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.83 
 
 
390 aa  279  6e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0136  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.52 
 
 
379 aa  279  8e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.04 
 
 
389 aa  279  8e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  37.74 
 
 
379 aa  278  1e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  37.17 
 
 
379 aa  277  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000286159 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  36.63 
 
 
379 aa  277  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  37.17 
 
 
379 aa  277  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  37.17 
 
 
379 aa  276  4e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  37.17 
 
 
379 aa  276  4e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  36.9 
 
 
379 aa  276  5e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3827  bytyryl-CoA dehydrogenase (short-chain-acyl-CoA dehydrogenase)  38.13 
 
 
379 aa  276  5e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  36.9 
 
 
379 aa  275  9e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2178  acyl-CoA dehydrogenase  40.21 
 
 
377 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.480909  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0826  acyl-CoA dehydrogenase  40.21 
 
 
377 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1555  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.58 
 
 
383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4146  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.53 
 
 
394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.954368  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1932  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.5 
 
 
380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  36.63 
 
 
379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  35.64 
 
 
379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1803  acyl-CoA dehydrogenase  39.95 
 
 
377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545777  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0918  acyl-CoA dehydrogenase  40.21 
 
 
377 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  36.1 
 
 
379 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3862  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.9 
 
 
379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3040  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.37 
 
 
402 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0629704  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.37 
 
 
379 aa  273  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0585  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.66 
 
 
379 aa  273  4.0000000000000004e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1381  Butyryl-CoA dehydrogenase  35.37 
 
 
379 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2684  putative acyl-CoA dehydrogenase  39.25 
 
 
375 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.126402  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2037  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.87 
 
 
375 aa  273  6e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.666233 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.36 
 
 
379 aa  272  7e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3775  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.05 
 
 
386 aa  271  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3635  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.37 
 
 
376 aa  271  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0583  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.27 
 
 
379 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.394739 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2865  Acyl-CoA dehydrogenase-like  37.43 
 
 
383 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0509295  normal  0.212771 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2867  Acyl-CoA dehydrogenase-like  38.07 
 
 
375 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.967944  normal  0.115681 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3778  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.14 
 
 
382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  0.271407 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2369  acyl-CoA dehydrogenase-like  38.4 
 
 
380 aa  270  4e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3492  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.36 
 
 
383 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0096  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  38.71 
 
 
378 aa  268  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0160842  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0402  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.64 
 
 
380 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2885  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.36 
 
 
383 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2436  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.83 
 
 
383 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.5 
 
 
380 aa  268  1e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4115  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.47 
 
 
390 aa  267  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2589  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.47 
 
 
390 aa  267  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000683478  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4730  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.77 
 
 
376 aa  268  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4365  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.04 
 
 
376 aa  268  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0081  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.64 
 
 
642 aa  267  4e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3774  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.5 
 
 
376 aa  266  5e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5985  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.97 
 
 
376 aa  266  7e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00997774 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2279  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.83 
 
 
383 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31540  putative acyl-CoA dehydrogenase  38.71 
 
 
375 aa  266  7e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.430124  hitchhiker  0.000095284 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.8 
 
 
379 aa  265  8e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.97 
 
 
375 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.129524 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4358  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.4 
 
 
381 aa  265  1e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0892384  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3052  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.24 
 
 
376 aa  265  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4610  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.83 
 
 
379 aa  265  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000229425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>