More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8490 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011892  Mnod_8490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
273 aa  523  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.668545  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.03 
 
 
268 aa  271  9e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475602  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2708  ABC transporter membrane spanning protein (polyamine)  37.55 
 
 
264 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319241  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1834  ABC transporter, permease protein  38.96 
 
 
269 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.632575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2420  putative ABC spermidine/putrescine transporter permease protein  39.42 
 
 
281 aa  171  9e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2705  spermidine/putrescine ABC transporter inner membrane protein  38.37 
 
 
265 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628706  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8304  ABC transporter  36.95 
 
 
265 aa  170  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0178234  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 
265 aa  168  7e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.973641  normal  0.52762 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3639  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 
268 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.344703 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.4 
 
 
264 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381273  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2522  ABC transporter, permease protein  39.2 
 
 
264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.6 
 
 
264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.6 
 
 
264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
265 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00977235  normal  0.387076 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.35 
 
 
264 aa  165  9e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.8 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.8 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.332864 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.8 
 
 
264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.183233 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2333  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.11 
 
 
264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.161709  normal  0.782854 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0748  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter inner membrane protein  38.55 
 
 
264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.467059  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 
264 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.676109 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
270 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3945  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.15 
 
 
264 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334886  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1479  ABC transporter, permease protein  31.37 
 
 
260 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0195961  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7195  ABC transporter permease  38.4 
 
 
271 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.6 
 
 
264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8149  ABC transporter  39.15 
 
 
266 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.828592  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 
263 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.829399  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.25 
 
 
262 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0387101  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1236  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  34.85 
 
 
267 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362839  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.6 
 
 
264 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4045  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
274 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.75 
 
 
265 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.34418 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4377  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.63 
 
 
265 aa  149  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 
268 aa  149  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.303148  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.62 
 
 
262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0887  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3109  spermidine/putrescine ABC transporter permease  37.79 
 
 
282 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1221  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  37.79 
 
 
282 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1338  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
282 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0756  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 
264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.533361  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6002  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 
265 aa  145  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176391  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1105  polyamine ABC transporter, permease protein  31.89 
 
 
267 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1465  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  34.16 
 
 
262 aa  142  5e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6500  ABC transporter permease  39.67 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537768  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4322  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.8 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.102499  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.01 
 
 
597 aa  139  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3393  ABC opine/polyamine transporter, inner membrane subunit  32.79 
 
 
264 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3039  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.79 
 
 
264 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.645477  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
279 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0828593 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4679  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
287 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.43 
 
 
268 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
272 aa  136  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.48 
 
 
275 aa  135  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.360042  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.75 
 
 
267 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.673957  normal  0.0589597 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1250  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
272 aa  135  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
272 aa  135  8e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1647  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.38 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29435 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.96 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.438917 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3185  ABC transporter permease  35.02 
 
 
271 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0498  putative sperimidine/putrescine ABC transporter (permease protein)  37.08 
 
 
265 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7601  ABC transporter membrane spanning protein  32.69 
 
 
273 aa  133  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1871  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.81 
 
 
278 aa  132  6e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3518  ABC polyamine/opine transporter, inner membrane subunit  39.11 
 
 
261 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336262  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.78 
 
 
606 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6578  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.496226  normal  0.414836 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4294  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.77 
 
 
279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144254  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576146  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.47 
 
 
275 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.586316  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.5 
 
 
268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.217099  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5122  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.18 
 
 
274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.026759  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3163  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.11 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610891  normal  0.0260594 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.76 
 
 
275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.08 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0037178  normal  0.4746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.08 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.911704  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  30.67 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.56 
 
 
275 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1400  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  29.44 
 
 
266 aa  126  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1201  spermidine/putrescine ABC transporter permease  29.44 
 
 
266 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1179  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  29.44 
 
 
266 aa  126  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1181  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  29.44 
 
 
266 aa  126  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0752832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1299  spermidine/putrescine ABC transporter permease  29.44 
 
 
266 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.56 
 
 
275 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.355956 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1377  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  29.44 
 
 
266 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000768374 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.75 
 
 
275 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.776443 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5471  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 
588 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
284 aa  125  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4689  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.48 
 
 
276 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3230  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.27 
 
 
272 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 
596 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3243  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.27 
 
 
269 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0750  ABC transporter permease  36.28 
 
 
276 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1507  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  34.19 
 
 
264 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375803  normal  0.0420414 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.8 
 
 
591 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621124  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4005  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  29.44 
 
 
266 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.61 
 
 
269 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0161656 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.45 
 
 
275 aa  123  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0709875  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.47 
 
 
269 aa  123  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1339  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  29.44 
 
 
266 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>