More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2229 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2229  ABC transporter related  100 
 
 		 233 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1419  ABC transporter related  37.5 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.441429  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  32.49 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  35.56 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  35.56 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  37.33 
 
 		 293 aa  135  8e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0089  ABC transporter related  35.11 
 
 		 237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.842138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1021  ABC transporter related  35.78 
 
 		 237 aa  132  5e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00128788 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.64 
 
 		 301 aa  132  6.999999999999999e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  31.95 
 
 		 251 aa  131  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  34.36 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  32.59 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  31.97 
 
 		 236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  30.99 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  36.71 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.64 
 
 		 309 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  33.48 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  31.96 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0349  ABC transporter related  31.62 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568927 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  32.3 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0386  ABC transporter related  38.17 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0407  ABC transporter related  29.17 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5657  ABC transporter related protein  42.31 
 
 		 258 aa  126  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.893177  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  34.53 
 
 		 322 aa  126  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.65 
 
 		 368 aa  125  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0699  ATPase  36.4 
 
 		 354 aa  125  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  35.27 
 
 		 315 aa  125  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  36.49 
 
 		 312 aa  125  8.000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2285  ABC transporter related  35.94 
 
 		 296 aa  124  9e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  34.33 
 
 		 311 aa  124  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2623  ABC transporter related  29.68 
 
 		 321 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0346  ABC transporter related  33.05 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  31.67 
 
 		 583 aa  123  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0018  ABC transporter, ATP-binding protein  30.51 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  32.11 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  35.48 
 
 		 306 aa  123  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  31.4 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  36.89 
 
 		 341 aa  123  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1322  ABC transporter related  35.9 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  36.61 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  33.03 
 
 		 332 aa  123  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4245  ABC transporter ATP-binding protein  30.86 
 
 		 303 aa  122  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4257  ABC transporter ATP-binding protein  32.43 
 
 		 303 aa  122  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129746  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  29.34 
 
 		 241 aa  122  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  34.96 
 
 		 593 aa  122  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  32.43 
 
 		 294 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  30.63 
 
 		 308 aa  122  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  35.04 
 
 		 293 aa  122  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  32.6 
 
 		 316 aa  122  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5800  ABC transporter related  29.58 
 
 		 251 aa  122  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527391 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0860  ABC transporter related  36.36 
 
 		 315 aa  121  8e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4638  ABC transporter, ATP-binding protein  32.43 
 
 		 294 aa  121  8e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  29.34 
 
 		 244 aa  121  9e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06310  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.44 
 
 		 323 aa  121  9e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.52931  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  33.78 
 
 		 312 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  29.34 
 
 		 241 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  30.86 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.6 
 
 		 247 aa  120  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  30.86 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  33.63 
 
 		 341 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0694  ABC transporter, ATP-binding protein  32.88 
 
 		 310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  35.98 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2122  ABC transporter-related protein  28.51 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.620855  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  36.63 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1477  ABC transporter related  32.77 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.226927  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  35 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  31.08 
 
 		 369 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0214  ABC transporter related  34.19 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  32.85 
 
 		 299 aa  119  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4636  ABC transporter, ATP-binding protein  31.98 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4405  ABC transporter ATP-binding protein  31.98 
 
 		 303 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  33.9 
 
 		 510 aa  119  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  35.11 
 
 		 295 aa  119  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  32.23 
 
 		 252 aa  119  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4745  ABC transporter ATP-binding protein  31.98 
 
 		 294 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  32.88 
 
 		 306 aa  119  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  29.34 
 
 		 241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0373  ABC transporter, ATP-binding protein  31.25 
 
 		 241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  29.34 
 
 		 241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  29.34 
 
 		 241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  30.29 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2940  ABC transporter related  33.61 
 
 		 249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  31.12 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0225  ABC transporter related  35.04 
 
 		 245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.866351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  33.9 
 
 		 316 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1502  ABC transporter related  36.55 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  32.74 
 
 		 667 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  32.78 
 
 		 240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  30.08 
 
 		 235 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  31.98 
 
 		 298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  29.41 
 
 		 541 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0929  ABC transporter related  35.91 
 
 		 318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.31859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  30.77 
 
 		 336 aa  119  6e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  29.68 
 
 		 303 aa  118  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  35.51 
 
 		 304 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0652  ABC transporter related  36.82 
 
 		 307 aa  118  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.673494  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  33.33 
 
 		 293 aa  118  7e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  33.76 
 
 		 512 aa  118  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  35.51 
 
 		 326 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4338  ABC transporter related  32.43 
 
 		 303 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>