More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3944 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3944  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  100 
 
 
337 aa  693    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2293  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  39.26 
 
 
338 aa  236  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.528549 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5094  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  36.02 
 
 
338 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122319  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4499  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  38.61 
 
 
336 aa  205  9e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.851713  normal  0.398115 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0416  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  41.58 
 
 
331 aa  203  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4715  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  38.94 
 
 
322 aa  203  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.517095  decreased coverage  0.00914415 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1558  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  39.85 
 
 
334 aa  202  6e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.102042  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3326  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  36.89 
 
 
336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3447  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  41.11 
 
 
349 aa  195  7e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.890437  normal  0.0946211 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4429  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  37.5 
 
 
338 aa  194  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5721  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  37.86 
 
 
337 aa  192  9e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1871  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  39.37 
 
 
323 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1747  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  36.36 
 
 
354 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0043  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  36.77 
 
 
318 aa  189  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3319  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  37.54 
 
 
326 aa  188  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0205242  normal  0.450742 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3295  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  38.01 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245111  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0858  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  36.15 
 
 
344 aa  183  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.729135 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5723  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  35.17 
 
 
335 aa  182  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5943  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  38.26 
 
 
328 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3387  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  35.76 
 
 
335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1941  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  39.92 
 
 
323 aa  179  4e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0800788  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2542  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  33.55 
 
 
335 aa  179  4.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00553261  normal  0.0729346 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0405  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  36.59 
 
 
330 aa  178  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.169231 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1744  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  39.53 
 
 
323 aa  178  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3954  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  39.19 
 
 
335 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599308  normal  0.261189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0088  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  34.74 
 
 
331 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4882  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  35.92 
 
 
322 aa  176  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2976  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  33.54 
 
 
322 aa  176  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178108  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2750  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  35.16 
 
 
347 aa  176  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000216568  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0755  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  37.13 
 
 
338 aa  176  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.190213  normal  0.863428 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1548  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  35.64 
 
 
345 aa  176  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0248122  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2952  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  35.05 
 
 
341 aa  176  7e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3588  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  37.36 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.565574  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2567  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  36.86 
 
 
337 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0507413  hitchhiker  0.00000000175996 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0524  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  34.84 
 
 
323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1455  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  34.87 
 
 
330 aa  172  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.534729  normal  0.295585 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0526  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  33.33 
 
 
356 aa  172  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0450  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  38.19 
 
 
323 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.431349  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2838  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  34.92 
 
 
327 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0955544  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3357  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  34.46 
 
 
352 aa  169  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.422667  normal  0.485488 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3398  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  34.75 
 
 
331 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.586433  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5668  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  36.47 
 
 
337 aa  169  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.889087  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2458  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  37.09 
 
 
336 aa  168  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000179067 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3661  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  34.4 
 
 
331 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0326  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  35.27 
 
 
334 aa  168  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1438  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  33.02 
 
 
338 aa  168  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.597094 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4271  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  37.14 
 
 
330 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2135  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  37.33 
 
 
365 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0660  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  33.03 
 
 
345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.255393  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2443  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  36.33 
 
 
323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0731  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  35.93 
 
 
328 aa  166  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0545  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  31.94 
 
 
346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513841  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0043  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  35.34 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1873  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  33.89 
 
 
336 aa  164  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3214  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  34.11 
 
 
324 aa  162  7e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4078  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  33.66 
 
 
342 aa  162  7e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.779727  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0701  TRAP dicarboxylate transporter, periplasmic component  32.54 
 
 
350 aa  162  8.000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000267748  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1266  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  33.81 
 
 
360 aa  162  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.224359  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2147  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  32.01 
 
 
331 aa  162  9e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.226528  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2686  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  36.47 
 
 
339 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3902  TRAP transporter solute receptor DctP family protein  32.19 
 
 
328 aa  161  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1150  TRAP dicarboxylate transporter subunit DctP  33.45 
 
 
343 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.515964  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0762  C4-dicarboxylate transport system, periplasmic component  33.1 
 
 
328 aa  161  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2050  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  35.1 
 
 
336 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.692281  normal  0.771105 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3887  trap transporter solute receptor, dctp family  33.1 
 
 
328 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3871  trap transporter solute receptor, dctp family  33.1 
 
 
328 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3951  trap dicarboxylate transporter subunit DctP  33.1 
 
 
328 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.725737 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4058  trap dicarboxylate transporter DctP subunit  33.1 
 
 
328 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.677544  normal  0.748274 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3996  trap transporter solute receptor  33.1 
 
 
328 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1484  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  32.82 
 
 
348 aa  160  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0875389  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3009  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  33.67 
 
 
344 aa  160  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4076  TRAP transporter solute receptor DctP family protein  31.85 
 
 
328 aa  159  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03431  predicted transporter  30.15 
 
 
328 aa  159  6e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.853726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0131  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  30.15 
 
 
328 aa  159  6e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3783  TRAP transporter solute receptor DctP family protein  30.15 
 
 
328 aa  159  6e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03382  hypothetical protein  30.15 
 
 
328 aa  159  6e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.867398  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1360  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  34.77 
 
 
347 aa  159  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0135  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  30.15 
 
 
328 aa  159  6e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0604  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  33.1 
 
 
343 aa  159  6e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.639711 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0583  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  33.1 
 
 
343 aa  159  9e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2794  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  33.78 
 
 
338 aa  159  9e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.879508 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4041  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  34.8 
 
 
331 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2710  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  35.83 
 
 
339 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3678  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  33.13 
 
 
331 aa  158  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3118  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  32.31 
 
 
326 aa  158  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000342277 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2480  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  31.94 
 
 
334 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4091  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  31.1 
 
 
324 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3764  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  34.21 
 
 
339 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.289423  normal  0.209559 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6105  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  34.23 
 
 
330 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1337  hypothetical protein  36.79 
 
 
346 aa  156  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1735  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  34.63 
 
 
339 aa  156  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3765  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  30.77 
 
 
334 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0440938  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1834  putative sialic acid-binding periplasmic protein  34.1 
 
 
338 aa  155  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.557031 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15200  hypothetical protein  36.79 
 
 
346 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0628298  hitchhiker  0.000000122837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4094  putative TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, periplasmic component  32.67 
 
 
331 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0716973 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4016  TRAP dicarboxylate family transporter DctP subunit  35.22 
 
 
351 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3326  TRAP transporter - DctP subunit  34.12 
 
 
325 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3681  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  32.47 
 
 
331 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126879  normal  0.224439 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0833  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  31.21 
 
 
345 aa  152  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1268  carbon storage regulator  33.65 
 
 
327 aa  152  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0141406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>