More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3118 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3118  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  100 
 
 
326 aa  676    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000342277 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3447  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  42.81 
 
 
349 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.890437  normal  0.0946211 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0088  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  42.57 
 
 
331 aa  245  8e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3319  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  40.27 
 
 
326 aa  235  7e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0205242  normal  0.450742 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1871  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  40.2 
 
 
323 aa  226  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5943  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  41.03 
 
 
328 aa  225  8e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4715  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  41.04 
 
 
322 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.517095  decreased coverage  0.00914415 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4882  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  39.22 
 
 
322 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3295  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  38.93 
 
 
323 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245111  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1941  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  40.07 
 
 
323 aa  221  9e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0800788  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1744  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  40.07 
 
 
323 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3954  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  39.37 
 
 
335 aa  216  5.9999999999999996e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599308  normal  0.261189 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0450  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  41.91 
 
 
323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.431349  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2567  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  36.04 
 
 
337 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0507413  hitchhiker  0.00000000175996 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0545  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  42.17 
 
 
346 aa  204  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513841  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2293  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  40.57 
 
 
338 aa  202  9e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.528549 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0858  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  38.18 
 
 
344 aa  197  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.729135 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1747  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  40.65 
 
 
354 aa  197  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0524  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  33.02 
 
 
323 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4429  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  34.62 
 
 
338 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2443  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  33.33 
 
 
323 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0043  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  36.11 
 
 
339 aa  186  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2952  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  34.75 
 
 
341 aa  182  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3326  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  34.13 
 
 
336 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0755  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  37.45 
 
 
338 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.190213  normal  0.863428 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3764  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  33.99 
 
 
339 aa  179  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.289423  normal  0.209559 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0932  ribosomal protein L22  34.52 
 
 
331 aa  178  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00199483  hitchhiker  0.00633944 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1873  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  34.27 
 
 
336 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2050  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  34.27 
 
 
336 aa  176  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.692281  normal  0.771105 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4499  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  35.69 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.851713  normal  0.398115 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2794  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  33.7 
 
 
338 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.879508 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2135  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  33.55 
 
 
365 aa  172  5e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2458  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  35.51 
 
 
336 aa  173  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000179067 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0762  C4-dicarboxylate transport system, periplasmic component  32.96 
 
 
328 aa  172  6.999999999999999e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1438  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  32.21 
 
 
338 aa  172  7.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.597094 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3876  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  34.66 
 
 
327 aa  171  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0954315 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5094  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  33.44 
 
 
338 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122319  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1558  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  36.72 
 
 
334 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.102042  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0407  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  38.56 
 
 
346 aa  169  7e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0326  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  32.11 
 
 
334 aa  168  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3387  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  33.72 
 
 
335 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5723  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  35.37 
 
 
335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2411  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  30.84 
 
 
325 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal  0.377072 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0416  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  36.86 
 
 
331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3902  TRAP transporter solute receptor DctP family protein  31.94 
 
 
328 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6105  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  33.44 
 
 
330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03431  predicted transporter  31.94 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.853726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0131  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  31.94 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03382  hypothetical protein  31.94 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.867398  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0135  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  31.94 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1268  carbon storage regulator  33.45 
 
 
327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0141406 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4076  TRAP transporter solute receptor DctP family protein  32.28 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3783  TRAP transporter solute receptor DctP family protein  31.94 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3220  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  38.46 
 
 
324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3661  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  30.71 
 
 
331 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3398  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  30.71 
 
 
331 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.586433  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1187  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  33.68 
 
 
323 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0246361  normal  0.126569 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5721  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  32.21 
 
 
337 aa  162  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3996  trap transporter solute receptor  32.5 
 
 
328 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3887  trap transporter solute receptor, dctp family  32.5 
 
 
328 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3871  trap transporter solute receptor, dctp family  32.5 
 
 
328 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3951  trap dicarboxylate transporter subunit DctP  32.5 
 
 
328 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.725737 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1114  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  32.93 
 
 
328 aa  161  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.347843 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4058  trap dicarboxylate transporter DctP subunit  32.5 
 
 
328 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.677544  normal  0.748274 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3301  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  34.89 
 
 
324 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2280  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  33.33 
 
 
325 aa  160  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4271  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  31.99 
 
 
330 aa  160  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0344  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  30.89 
 
 
325 aa  159  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1455  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  34.48 
 
 
330 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.534729  normal  0.295585 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0487  TRAP dicarboxylate family transporter DctP subunit  31.32 
 
 
325 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281139  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0910  TRAP dicarboxylate family transporter DctP subunit  34.39 
 
 
334 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4043  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  33.66 
 
 
327 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.187299  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2569  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  34.39 
 
 
334 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.282286  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2138  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  31.32 
 
 
325 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231468  normal  0.866818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1169  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  32.67 
 
 
323 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.061723 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3368  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  30.38 
 
 
324 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0243  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  33.33 
 
 
334 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.68062  normal  0.883791 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3944  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  33.99 
 
 
337 aa  156  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1203  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  32.67 
 
 
323 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2993  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  32.18 
 
 
334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00571621  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4042  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  33.55 
 
 
330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0043  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  34.26 
 
 
318 aa  155  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4242  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  32.67 
 
 
323 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.271244  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0387  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  30.28 
 
 
325 aa  155  7e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3454  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  37.65 
 
 
323 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2592  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  30.1 
 
 
322 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00256887  normal  0.0517613 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4091  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  33.11 
 
 
324 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0405  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  34.1 
 
 
330 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.169231 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0447  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  31.7 
 
 
329 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000633962  n/a   
 
 
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NC_008254  Meso_0789  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  34.62 
 
 
328 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5742  putative TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, binding periplasmic protein (DctP subunit)  32.63 
 
 
332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.551503  normal 
 
 
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NC_009485  BBta_7507  putative TRAP-dicarboxylate transporter, periplasmic component (DctP subunit)  32.32 
 
 
297 aa  153  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84783  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3681  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  31.06 
 
 
331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126879  normal  0.224439 
 
 
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NC_007948  Bpro_2838  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  30.72 
 
 
327 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0955544  normal  0.310006 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_2784  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  32.35 
 
 
330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0226757  normal 
 
 
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NC_008042  TM1040_3870  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  31.01 
 
 
324 aa  152  7e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.427037 
 
 
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NC_008554  Sfum_3588  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  36.07 
 
 
336 aa  152  8e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.565574  normal  0.470316 
 
 
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NC_008688  Pden_5066  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  31.43 
 
 
326 aa  152  8e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008781  Pnap_4041  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  34.73 
 
 
331 aa  152  8.999999999999999e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2399  TRAP transporter solute receptor DctP family protein  29.9 
 
 
330 aa  152  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000284649  n/a   
 
 
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