More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0870 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0870  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
469 aa  968    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.252306 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2043  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  51.84 
 
 
439 aa  457  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.339367  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0682  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  50.78 
 
 
441 aa  444  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2820  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  47.18 
 
 
452 aa  432  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.287176  hitchhiker  0.0000171057 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2020  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  46.33 
 
 
466 aa  430  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29433  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3553  putative sigma54 specific transcriptional regulator  45.93 
 
 
441 aa  412  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.149056 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0682  helix-turn-helix, Fis-type  46.64 
 
 
454 aa  412  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0070  putative sigma54 specific transcriptional regulator  48.3 
 
 
434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.364137  hitchhiker  0.000000158676 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2356  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  47.27 
 
 
436 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0067  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  48.86 
 
 
430 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197727 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0164  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  45.87 
 
 
450 aa  403  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.342124  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03806  sigma-54 dependent transcriptional regulator  45.98 
 
 
440 aa  402  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0051  sigma-54 dependent transcriptional regulator  48.86 
 
 
430 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000634616 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0146  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  45.85 
 
 
459 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.742059 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3590  helix-turn-helix, Fis-type  47.3 
 
 
436 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0067  putative sigma54 specific transcriptional regulator  54.72 
 
 
430 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.485042  hitchhiker  0.00677229 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0077  helix-turn-helix, Fis-type  46.36 
 
 
439 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5349  transcriptional regulator  46.43 
 
 
441 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.982253  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0111  sigma-54 dependent transcriptional regulator  45.35 
 
 
439 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0676  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  46.41 
 
 
456 aa  391  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1665  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  46.6 
 
 
467 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1760  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  52.86 
 
 
460 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5042  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  46.46 
 
 
460 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6335  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  53.13 
 
 
460 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1744  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  53.13 
 
 
460 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1665  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  51.88 
 
 
465 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1976  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family protein  44.95 
 
 
438 aa  383  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1668  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  51.74 
 
 
465 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.126097  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1516  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  52.32 
 
 
462 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.265556 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1875  sigma-54 dependent transcriptional regulator  43.71 
 
 
434 aa  377  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2283  sigma-54 dependent transcriptional regulator  45.27 
 
 
451 aa  378  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.884804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2115  putative sensory box sigma-54 dependent transcriptional regulator  44.13 
 
 
467 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2302  sigma-54 dependent transcriptional regulator  43.91 
 
 
449 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2171  putative sensory box sigma-54 dependent transcriptional regulator  48.56 
 
 
469 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1072  putative sigma54 specific transcriptional regulator  42.79 
 
 
451 aa  355  6.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0957  sigma-54 dependent transcriptional regulator  42.79 
 
 
451 aa  355  6.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2597  sigma-54 dependent transcriptional regulator, putative  38.65 
 
 
439 aa  297  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2226  putative sigma54 specific transcriptional regulator  38.65 
 
 
439 aa  297  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2227  Fis family transcriptional regulator  34.77 
 
 
430 aa  268  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.494043  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0874  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.07 
 
 
464 aa  256  5e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2555  two-component response regulator PilR  41.8 
 
 
459 aa  252  8.000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822177  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1977  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.8 
 
 
447 aa  249  6e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0109  two component Fis family transcriptional regulator  41.84 
 
 
466 aa  246  4e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0198  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.13 
 
 
461 aa  246  4e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2239  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.43 
 
 
457 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4696  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.3 
 
 
480 aa  246  9e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.511164  decreased coverage  0.00000622606 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2347  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.01 
 
 
456 aa  245  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229216  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2084  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  40.56 
 
 
477 aa  245  9.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.327808  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1986  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.12 
 
 
457 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.546437 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2618  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.25 
 
 
453 aa  244  3e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153552  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4561  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40 
 
 
480 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.601271  hitchhiker  0.000975449 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3077  sigma54 specific transcriptional regulator  36.93 
 
 
475 aa  243  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4389  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.12 
 
 
495 aa  243  5e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205713  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0846  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  40.43 
 
 
518 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.615084  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3194  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  38.81 
 
 
592 aa  243  7e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2741  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  45.49 
 
 
474 aa  242  9e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0363909  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0538  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.56 
 
 
473 aa  242  9e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0102949  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0823  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  38.81 
 
 
592 aa  241  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3029  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  38.81 
 
 
592 aa  241  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2362  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  45.32 
 
 
479 aa  242  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0839  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  38.81 
 
 
592 aa  241  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1042  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.8 
 
 
465 aa  241  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000166307  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0197  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  46.12 
 
 
1098 aa  241  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.793641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3823  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  46.4 
 
 
517 aa  241  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172283 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0433  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.67 
 
 
472 aa  241  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3002  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  37.99 
 
 
592 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2826  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.13 
 
 
461 aa  240  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.244879  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4159  sigma-54 dependent transcriptional regulator, Fis family  38.53 
 
 
592 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.778459 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2979  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  32.53 
 
 
491 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0670  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  46.69 
 
 
464 aa  241  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3389  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.32 
 
 
462 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4327  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  46.32 
 
 
875 aa  239  8e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4779  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.98 
 
 
494 aa  239  9e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02702  predicted DNA-binding transcriptional regulator  38.53 
 
 
592 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5614  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.13 
 
 
457 aa  238  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0915  transcriptional regulator FleQ  48.56 
 
 
471 aa  239  1e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0884  transcriptional regulator FleQ  48.56 
 
 
471 aa  239  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2149  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.03 
 
 
477 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3263  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.65 
 
 
464 aa  238  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000257125 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02664  hypothetical protein  38.53 
 
 
592 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1407  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  37.58 
 
 
456 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4454  transcriptional regulatory protein ZraR  46.21 
 
 
441 aa  239  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.209341  hitchhiker  0.000519331 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3989  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.21 
 
 
441 aa  238  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.716922  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3940  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  47.68 
 
 
467 aa  238  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000637809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4581  transcriptional regulatory protein ZraR  43.67 
 
 
441 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0374  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.25 
 
 
471 aa  238  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.774685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0831  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  40.73 
 
 
518 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4024  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  47.68 
 
 
467 aa  238  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42797e-16 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3555  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.21 
 
 
489 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4385  transcriptional regulatory protein ZraR  43.67 
 
 
441 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.712665 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3623  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.21 
 
 
489 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.568637  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4418  transcriptional regulatory protein ZraR  43.35 
 
 
441 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298897  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0965  two-component response regulator PilR  40.56 
 
 
446 aa  238  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.25964  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2716  putative sigma54 specific transcriptional regulator  33.56 
 
 
460 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0740444  normal  0.0319328 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3750  Fis family transcriptional regulator  48.31 
 
 
379 aa  236  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634996  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3727  helix-turn-helix, Fis-type  32.65 
 
 
503 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4549  transcriptional regulatory protein ZraR  43.21 
 
 
441 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000369022  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0621  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.23 
 
 
472 aa  236  5.0000000000000005e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03881  fused DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with ZraS: response regulator/sigma54 interaction protein  43.21 
 
 
441 aa  236  6e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0124745  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4021  transcriptional regulatory protein ZraR  43.21 
 
 
441 aa  236  6e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0128092  normal  0.0227655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>