More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1665 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1665  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  100 
 
 
467 aa  953    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2820  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  49.56 
 
 
452 aa  425  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.287176  hitchhiker  0.0000171057 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0682  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  52.05 
 
 
441 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2020  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  49.55 
 
 
466 aa  415  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29433  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5349  transcriptional regulator  50 
 
 
441 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.982253  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3590  helix-turn-helix, Fis-type  51.04 
 
 
436 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5042  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  47.95 
 
 
460 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0870  putative PAS/PAC sensor protein  46.6 
 
 
469 aa  389  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.252306 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2356  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  50.47 
 
 
436 aa  388  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3553  putative sigma54 specific transcriptional regulator  48.62 
 
 
441 aa  387  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.149056 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1668  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  49.2 
 
 
465 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.126097  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1665  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  49.2 
 
 
465 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0164  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  50.47 
 
 
450 aa  382  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.342124  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1760  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  49.77 
 
 
460 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6335  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  49.77 
 
 
460 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2043  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  50.24 
 
 
439 aa  384  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.339367  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1744  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  49.77 
 
 
460 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0682  helix-turn-helix, Fis-type  48.14 
 
 
454 aa  381  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0146  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  50.24 
 
 
459 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.742059 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2171  putative sensory box sigma-54 dependent transcriptional regulator  49.66 
 
 
469 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0077  helix-turn-helix, Fis-type  48.7 
 
 
439 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2283  sigma-54 dependent transcriptional regulator  50 
 
 
451 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.884804  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0676  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  48.16 
 
 
456 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0051  sigma-54 dependent transcriptional regulator  49.53 
 
 
430 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000634616 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0067  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  49.53 
 
 
430 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0067  putative sigma54 specific transcriptional regulator  49.76 
 
 
430 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.485042  hitchhiker  0.00677229 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0070  putative sigma54 specific transcriptional regulator  49.06 
 
 
434 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.364137  hitchhiker  0.000000158676 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03806  sigma-54 dependent transcriptional regulator  44.96 
 
 
440 aa  371  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1516  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  46.64 
 
 
462 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.265556 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2115  putative sensory box sigma-54 dependent transcriptional regulator  49.31 
 
 
467 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0111  sigma-54 dependent transcriptional regulator  46.4 
 
 
439 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2302  sigma-54 dependent transcriptional regulator  48.84 
 
 
449 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1072  putative sigma54 specific transcriptional regulator  47.11 
 
 
451 aa  354  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0957  sigma-54 dependent transcriptional regulator  47.11 
 
 
451 aa  354  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1976  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family protein  42.79 
 
 
438 aa  343  4e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1875  sigma-54 dependent transcriptional regulator  41.77 
 
 
434 aa  337  2.9999999999999997e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2226  putative sigma54 specific transcriptional regulator  41.01 
 
 
439 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2597  sigma-54 dependent transcriptional regulator, putative  41.01 
 
 
439 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2100  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.59 
 
 
466 aa  260  3e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2227  Fis family transcriptional regulator  39.01 
 
 
430 aa  259  6e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.494043  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0976  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.48 
 
 
442 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00434157  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2001  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.37 
 
 
454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1510  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.95 
 
 
448 aa  250  5e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4396  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.03 
 
 
469 aa  249  8e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4373  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.03 
 
 
469 aa  249  8e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1495  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  44.55 
 
 
458 aa  249  9e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.301103  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4674  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  45.19 
 
 
463 aa  248  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0358  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.73 
 
 
446 aa  248  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1377  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.99 
 
 
473 aa  246  6e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.490125  normal  0.921369 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2549  sigma-54 dependent transcriptional regulator  42.68 
 
 
509 aa  246  8e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0908365  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1397  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.55 
 
 
458 aa  246  9e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2510  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  43.75 
 
 
448 aa  246  9e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1635  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.03 
 
 
457 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5614  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.73 
 
 
457 aa  245  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5933  NifA subfamily transcriptional regulator  51.65 
 
 
580 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0827  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.21 
 
 
447 aa  245  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0433  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.78 
 
 
472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5460  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  43.47 
 
 
650 aa  244  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.665291  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5187  two-component response regulator PilR  41.64 
 
 
445 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60260  two-component response regulator PilR  41.43 
 
 
445 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000831057 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2402  transcriptional regulator, Fis family  44.24 
 
 
641 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4153  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.14 
 
 
466 aa  242  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2298  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.69 
 
 
452 aa  242  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2053  Fis family transcriptional regulator  51.02 
 
 
664 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2347  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.12 
 
 
456 aa  242  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229216  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0917  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  42.94 
 
 
568 aa  241  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1901  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.55 
 
 
473 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0172472 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0516  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.01 
 
 
468 aa  241  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000971097  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2401  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.72 
 
 
449 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1977  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.97 
 
 
447 aa  240  4e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0508  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  44.62 
 
 
495 aa  240  4e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2065  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.16 
 
 
557 aa  240  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461266  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2825  Fis family transcriptional regulator  36.29 
 
 
589 aa  240  4e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208492  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2145  two component signal transduction response regulator  39.88 
 
 
492 aa  239  5e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3589  two-component response regulator CbrB  42.33 
 
 
477 aa  240  5e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0789  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.29 
 
 
448 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2554  type 4 fimbriae expression regulatory protein PilR  43.51 
 
 
452 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0732  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.45 
 
 
471 aa  239  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121473  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2741  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  46.56 
 
 
474 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0363909  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4696  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.26 
 
 
480 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.511164  decreased coverage  0.00000622606 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2591  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.4 
 
 
457 aa  239  9e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313706  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0570  NifA subfamily transcriptional regulator  37.47 
 
 
508 aa  239  9e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.106051  normal  0.50757 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0059  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.55 
 
 
446 aa  239  9e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.447453 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2092  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.23 
 
 
462 aa  239  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0662  helix-turn-helix, Fis-type  42.12 
 
 
451 aa  238  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0109  two component Fis family transcriptional regulator  44.92 
 
 
466 aa  238  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1555  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.19 
 
 
467 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1711  NifA subfamily transcriptional regulator  41.21 
 
 
608 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.478536  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4240  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.16 
 
 
469 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2555  two-component response regulator PilR  40.31 
 
 
459 aa  238  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822177  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1748  transcriptional regulator, NifA, Fis Family  37.5 
 
 
542 aa  238  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4505  transcriptional regulatory protein ZraR  42.5 
 
 
441 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.11324 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1430  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  41.1 
 
 
461 aa  238  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.324678  hitchhiker  0.00137179 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0792  hypothetical protein  40.6 
 
 
662 aa  238  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1843  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.69 
 
 
465 aa  238  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.798265  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4561  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.39 
 
 
480 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.601271  hitchhiker  0.000975449 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0659  Fis family transcriptional regulator  43.67 
 
 
476 aa  238  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2340  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  39.3 
 
 
476 aa  238  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1010  NifA subfamily transcriptional regulator  39.61 
 
 
510 aa  238  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.502201  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3191  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  41.34 
 
 
553 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>