230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2471 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2426  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  100 
 
 		 138 aa  269  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2471  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  100 
 
 		 138 aa  269  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.496568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6855  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  66.42 
 
 		 137 aa  153  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000218203  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6400  Class I peptide chain release factor  59.09 
 
 		 140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0828  class I peptide chain release factor  58.7 
 
 		 143 aa  142  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.084227  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0598  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  60.61 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104756  normal  0.0423062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3224  hypothetical protein  54.96 
 
 		 139 aa  134  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37860  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  63.87 
 
 		 141 aa  128  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.259651 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1139  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  71.05 
 
 		 135 aa  127  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.668699  hitchhiker  0.0000255513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1249  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  70.91 
 
 		 129 aa  123  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2589  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.15 
 
 		 143 aa  120  7e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.139809 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22660  protein chain release factor B  61.11 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28300  protein chain release factor B  57.89 
 
 		 146 aa  113  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1977  hypothetical protein  51.15 
 
 		 147 aa  113  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29401  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.04 
 
 		 143 aa  113  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2137  Class I peptide chain release factor  62.6 
 
 		 145 aa  113  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0672  Class I peptide chain release factor  55.56 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2228  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.11 
 
 		 146 aa  110  6e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0960  Class I peptide chain release factor  52.38 
 
 		 145 aa  110  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0357  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.17 
 
 		 142 aa  107  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.197907  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0556  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.6 
 
 		 140 aa  107  6e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.908284  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3059  Class I peptide chain release factor  60.31 
 
 		 146 aa  105  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0504323  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.88 
 
 		 145 aa  104  3e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.472509  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1190  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.6 
 
 		 142 aa  104  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0102787  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15800  hypothetical protein  59.06 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.25035  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14580  protein chain release factor B  57.14 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.024949  normal  0.100234 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0582  Class I peptide chain release factor  50 
 
 		 143 aa  100  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3428  Class I peptide chain release factor  50.41 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13231  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.59 
 
 		 140 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.107731 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0097  class I peptide chain release factor  43.94 
 
 		 140 aa  98.2  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3102  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.11 
 
 		 144 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3695  class I peptide chain release factor  42.75 
 
 		 143 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.681232 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0332  class I peptide chain release factor  42.22 
 
 		 140 aa  96.7  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1523  hypothetical protein  44.27 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.331021  normal  0.193244 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1368  Class I peptide chain release factor  40.91 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.422423  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0179  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.51 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02765  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.04 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.489905  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14431  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.69 
 
 		 142 aa  94.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3557  Class I peptide chain release factor  48.51 
 
 		 140 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.411853 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4856  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.86 
 
 		 139 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3233  class I peptide chain release factor  49.24 
 
 		 140 aa  93.6  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.521154 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34690  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.27 
 
 		 137 aa  93.6  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.370131  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4768  Class I peptide chain release factor  44.78 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.561656  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1373  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.93 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03841  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.4 
 
 		 142 aa  90.5  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.300299  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2737  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.22 
 
 		 169 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1970  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.12 
 
 		 137 aa  89.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1494  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.15 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.129787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4258  class I peptide chain release factor  46.67 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0636  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.75 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00765778  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  32.59 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.78098  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3342  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.19 
 
 		 140 aa  87.8  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4033  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.35 
 
 		 139 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.471406  normal  0.87398 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0024  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.98 
 
 		 141 aa  87.8  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4041  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.22 
 
 		 137 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733627 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1387  class I peptide chain release factor  54.47 
 
 		 150 aa  87.4  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443355  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0430  class I peptide chain release factor  40.44 
 
 		 141 aa  87  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2849  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.86 
 
 		 134 aa  87  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.10078  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1767  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.86 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1522  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.86 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876893  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4177  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.6 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.378927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53030  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.88 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1191  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.86 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273593  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0678  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.86 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.283064  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0034  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.22 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1388  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.86 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1392  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.86 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.367103  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0474  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.86 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.578239  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1366  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.22 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3254  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.99 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0026  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.3 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1309  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.15 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.892435  normal  0.470671 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3579  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.39 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3229  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.39 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168853  normal  0.123551 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3071  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.28 
 
 		 140 aa  84  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4649  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.12 
 
 		 137 aa  84  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0149  Class I peptide chain release factor  41.61 
 
 		 146 aa  84  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1818  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.64 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2547  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.91 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.256849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2666  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.41 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2164  Class I peptide chain release factor  39.1 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3167  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.18 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2836  class I peptide chain release factor  39.13 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1725  class I peptide chain release factor  39.1 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208717  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1709  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.69 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1495  class I peptide chain release factor  36.69 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011773 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2541  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.44 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1147  Class I peptide chain release factor  41.79 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2442  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.93 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1045  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.64 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2946  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.93 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.661173  normal  0.230853 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0041  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.7 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1242  class I peptide chain release factor  36.09 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357715 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2086  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.91 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1842  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.39 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0634  class I peptide chain release factor  38.93 
 
 		 140 aa  80.1  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0736  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.11 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.564723  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1190  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.11 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285712  normal  0.465318 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1217  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.11 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29015  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1612  class I peptide chain release factor  43.24 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.554845  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>