264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4177 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_4177  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  100 
 
 
139 aa  276  8e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.378927  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4033  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  97.12 
 
 
139 aa  268  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.471406  normal  0.87398 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4856  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  85.61 
 
 
139 aa  241  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1390  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  79.29 
 
 
140 aa  221  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1709  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  78.42 
 
 
139 aa  206  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3167  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  71.22 
 
 
139 aa  206  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2547  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  73.72 
 
 
139 aa  204  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.256849  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0332  class I peptide chain release factor  59.57 
 
 
140 aa  158  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3428  Class I peptide chain release factor  66.1 
 
 
141 aa  147  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3233  class I peptide chain release factor  59.42 
 
 
140 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.521154 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3557  Class I peptide chain release factor  59.42 
 
 
140 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.411853 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2541  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  56.72 
 
 
140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1523  hypothetical protein  52.94 
 
 
141 aa  142  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.331021  normal  0.193244 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1494  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.28 
 
 
137 aa  142  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.129787  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4041  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.55 
 
 
137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.733627 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34690  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  55.3 
 
 
137 aa  137  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.370131  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3229  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.55 
 
 
137 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168853  normal  0.123551 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1309  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.28 
 
 
137 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.892435  normal  0.470671 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0097  class I peptide chain release factor  53.57 
 
 
140 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3579  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.28 
 
 
137 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440076  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1725  class I peptide chain release factor  53.08 
 
 
140 aa  135  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208717  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0430  class I peptide chain release factor  50.35 
 
 
141 aa  135  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2442  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.09 
 
 
137 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2946  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.36 
 
 
137 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.661173  normal  0.230853 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1818  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.28 
 
 
137 aa  134  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0830  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  57.55 
 
 
157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.367677  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0179  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.41 
 
 
143 aa  133  7.000000000000001e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3201  hypothetical protein  52.17 
 
 
137 aa  133  7.000000000000001e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0634  class I peptide chain release factor  52.14 
 
 
140 aa  132  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1970  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.48 
 
 
137 aa  130  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0828493  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53030  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.64 
 
 
137 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4649  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.64 
 
 
137 aa  129  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2088  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  56.12 
 
 
178 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.273821  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3695  class I peptide chain release factor  53.38 
 
 
143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.681232 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2126  Class I peptide chain release factor  53.49 
 
 
134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.44766  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0024  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.71 
 
 
141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2849  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.8 
 
 
134 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.10078  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4400  peptidyl-tRNA hydrolase domain-containing protein  50.76 
 
 
137 aa  128  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.485154  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1045  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50 
 
 
137 aa  128  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4258  class I peptide chain release factor  55.4 
 
 
141 aa  128  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1767  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.6 
 
 
134 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0678  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.6 
 
 
134 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.283064  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0474  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.6 
 
 
134 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.578239  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1392  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.6 
 
 
134 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.367103  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3102  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.08 
 
 
144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1191  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.6 
 
 
134 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273593  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1388  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.6 
 
 
134 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2008  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  55.4 
 
 
178 aa  127  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0938485  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1684  Class I peptide chain release factor  51.16 
 
 
138 aa  127  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270418  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1858  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.83 
 
 
135 aa  127  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102554  normal  0.117146 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3760  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50 
 
 
137 aa  127  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000181211  normal  0.0838449 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1522  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.8 
 
 
134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876893  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1366  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50 
 
 
141 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_1842  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.64 
 
 
135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3071  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.71 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0034  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2102  Class I peptide chain release factor  50.78 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4768  Class I peptide chain release factor  56.3 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.561656  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1612  class I peptide chain release factor  50.78 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.554845  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0128  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  55.17 
 
 
139 aa  123  7e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02765  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.28 
 
 
143 aa  123  7e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.489905  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0245  class I peptide chain release factor  50.75 
 
 
140 aa  123  8.000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84131  normal  0.608303 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1772  Class I peptide chain release factor  54.14 
 
 
139 aa  122  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0992468  normal  0.67648 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2742  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.17 
 
 
134 aa  122  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0464887 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0890  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.92 
 
 
138 aa  122  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.245575  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0875  class I peptide chain release factor  45.65 
 
 
138 aa  121  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.174449  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1981  Class I peptide chain release factor  47.33 
 
 
136 aa  120  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000274722  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1617  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.22 
 
 
134 aa  120  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.599417 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000501  class I peptide chain release factor  46.97 
 
 
137 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00818872  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3592  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.38 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0636  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.15 
 
 
143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00765778  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2409  class I peptide chain release factor  47.97 
 
 
140 aa  118  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0842293  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2164  Class I peptide chain release factor  45.45 
 
 
137 aa  118  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3412  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.73 
 
 
146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.44659  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1036  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.73 
 
 
146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.501059  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1089  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.73 
 
 
146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.900586  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1386  class I peptide chain release factor  48.8 
 
 
141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402498  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2835  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.41 
 
 
134 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0867  class I peptide chain release factor  43.8 
 
 
137 aa  117  6e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.485704  normal  0.838908 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0012  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.21 
 
 
137 aa  117  7e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2072  class I peptide chain release factor  52.5 
 
 
138 aa  117  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0774225  normal  0.971682 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1242  class I peptide chain release factor  45.26 
 
 
139 aa  117  7e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00357715 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2298  class I peptide chain release factor  47.2 
 
 
146 aa  117  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0838  class I peptide chain release factor  44.53 
 
 
137 aa  116  9e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.329463 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2493  class I peptide chain release factor  51.54 
 
 
132 aa  116  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201964  normal  0.890427 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1495  class I peptide chain release factor  47.73 
 
 
137 aa  116  9e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000011773 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3468  class I peptide chain release factor  46.38 
 
 
138 aa  116  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05388  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.21 
 
 
137 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_3342  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.08 
 
 
140 aa  115  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013223  Dret_1147  Class I peptide chain release factor  45.39 
 
 
142 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011666  Msil_3713  Class I peptide chain release factor  51.61 
 
 
140 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116579 
 
 
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NC_014248  Aazo_2829  Class I peptide chain release factor  46.21 
 
 
137 aa  116  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_2919  class I peptide chain release factor  46.21 
 
 
137 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0177067  n/a   
 
 
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NC_010831  Cphamn1_2216  Class I peptide chain release factor  46.32 
 
 
136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011353  ECH74115_0202  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.19 
 
 
136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869706  normal 
 
 
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NC_007954  Sden_3284  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.12 
 
 
138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_2086  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.84 
 
 
133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011138  MADE_03821  hypothetical protein  43.38 
 
 
138 aa  115  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_2864  Class I peptide chain release factor  51.18 
 
 
137 aa  114  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.10878  n/a   
 
 
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NC_012856  Rpic12D_2737  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.2 
 
 
169 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
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