279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6400 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6400  Class I peptide chain release factor  100 
 
 		 140 aa  274  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3224  hypothetical protein  70.07 
 
 		 139 aa  185  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0828  class I peptide chain release factor  63.2 
 
 		 143 aa  152  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.084227  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0598  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  60.29 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104756  normal  0.0423062 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29401  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.74 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0582  Class I peptide chain release factor  60.29 
 
 		 143 aa  140  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1190  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  60.16 
 
 		 142 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0102787  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0960  Class I peptide chain release factor  61.11 
 
 		 145 aa  136  7.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2589  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.63 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.139809 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1139  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  70.09 
 
 		 135 aa  132  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.668699  hitchhiker  0.0000255513 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0672  Class I peptide chain release factor  62.02 
 
 		 164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2137  Class I peptide chain release factor  57.14 
 
 		 145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28300  protein chain release factor B  55.88 
 
 		 146 aa  124  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1249  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  68.47 
 
 		 129 aa  123  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1977  hypothetical protein  54.89 
 
 		 147 aa  123  9e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3059  Class I peptide chain release factor  60.29 
 
 		 146 aa  121  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0504323  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37860  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  56.91 
 
 		 141 aa  118  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.259651 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6855  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  57.36 
 
 		 137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000218203  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2228  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.8 
 
 		 146 aa  116  9e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0357  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.69 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.197907  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22660  protein chain release factor B  60 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13231  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.91 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.107731 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1368  Class I peptide chain release factor  44.85 
 
 		 151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.422423  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14580  protein chain release factor B  57.25 
 
 		 149 aa  110  8.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.024949  normal  0.100234 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1387  class I peptide chain release factor  59.06 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443355  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15800  hypothetical protein  51.56 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.25035  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14431  aminoacyl-tRNA hydrolase  48.87 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134449 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.77 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.472509  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0026  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.45 
 
 		 139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0556  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.39 
 
 		 140 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.908284  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02765  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.59 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.489905  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.59 
 
 		 138 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.78098  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0636  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.07 
 
 		 143 aa  103  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00765778  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2426  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  59.09 
 
 		 138 aa  100  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2471  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  59.09 
 
 		 138 aa  100  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.496568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03841  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.78 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.300299  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0179  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.14 
 
 		 143 aa  97.1  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0332  class I peptide chain release factor  42.96 
 
 		 140 aa  95.9  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3342  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.36 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3695  class I peptide chain release factor  42.22 
 
 		 143 aa  95.9  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.681232 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.81 
 
 		 137 aa  95.1  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3519  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.81 
 
 		 137 aa  95.1  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.81 
 
 		 137 aa  95.1  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1373  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.98 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0535  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.97 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000252738  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1523  hypothetical protein  42.54 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.331021  normal  0.193244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3102  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.48 
 
 		 144 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1772  Class I peptide chain release factor  45.86 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0992468  normal  0.67648 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0430  class I peptide chain release factor  43.18 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0024  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.04 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2541  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.91 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0550  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.96 
 
 		 137 aa  90.9  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2311  class I peptide chain release factor  42.11 
 
 		 144 aa  90.5  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2666  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.28 
 
 		 139 aa  90.5  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4258  class I peptide chain release factor  48.12 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1970  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.3 
 
 		 137 aa  90.1  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1366  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.04 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2409  class I peptide chain release factor  37.69 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0842293  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0034  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.04 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3592  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  33.09 
 
 		 138 aa  89.4  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0513  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.31 
 
 		 137 aa  89.4  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4087  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.77 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1147  Class I peptide chain release factor  43.61 
 
 		 142 aa  88.6  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1495  class I peptide chain release factor  40.3 
 
 		 137 aa  89.4  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011773 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2164  Class I peptide chain release factor  40.15 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1045  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.59 
 
 		 137 aa  88.6  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2829  Class I peptide chain release factor  37.59 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1494  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40 
 
 		 137 aa  87  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.129787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4177  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.44 
 
 		 139 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.378927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3713  Class I peptide chain release factor  38.93 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116579 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2547  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.84 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.256849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0245  class I peptide chain release factor  39.26 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84131  normal  0.608303 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4856  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.44 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1725  class I peptide chain release factor  37.59 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208717  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1709  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.54 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0634  class I peptide chain release factor  40.91 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1981  Class I peptide chain release factor  35.46 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000274722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3167  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.34 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2737  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.27 
 
 		 169 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53030  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.23 
 
 		 137 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3760  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.04 
 
 		 137 aa  84.7  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000181211  normal  0.0838449 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0149  Class I peptide chain release factor  41.91 
 
 		 146 aa  84.3  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4649  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.17 
 
 		 137 aa  84  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4768  Class I peptide chain release factor  45.86 
 
 		 141 aa  84  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.561656  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3411  Class I peptide chain release factor  38.64 
 
 		 140 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0202  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.5 
 
 		 136 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3362  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.57 
 
 		 136 aa  83.6  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0203  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.64 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3201  hypothetical protein  37.4 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1242  class I peptide chain release factor  37.88 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357715 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00190  hypothetical protein  38.64 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.40568  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00189  hypothetical protein  38.64 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.420944  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4033  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.71 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.471406  normal  0.87398 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3071  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.72 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1089  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.3 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.900586  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1036  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.3 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.501059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3412  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.3 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.44659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3468  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.88 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.437856 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0185  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.88 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3468  class I peptide chain release factor  36.36 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>