214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1368 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1368  Class I peptide chain release factor  100 
 
 
151 aa  308  2e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.422423  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6400  Class I peptide chain release factor  44.85 
 
 
140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3695  class I peptide chain release factor  39.85 
 
 
143 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.681232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3224  hypothetical protein  40.3 
 
 
139 aa  99.8  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1147  Class I peptide chain release factor  41.61 
 
 
142 aa  95.9  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29401  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.29 
 
 
143 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0430  class I peptide chain release factor  40.3 
 
 
141 aa  94.7  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1970  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.55 
 
 
137 aa  93.6  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0828493  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0149  Class I peptide chain release factor  39.26 
 
 
146 aa  93.6  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2666  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.42 
 
 
139 aa  93.6  9e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0332  class I peptide chain release factor  35.77 
 
 
140 aa  91.3  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2298  class I peptide chain release factor  39.68 
 
 
146 aa  91.3  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2541  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.48 
 
 
140 aa  90.9  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2311  class I peptide chain release factor  37.59 
 
 
144 aa  90.5  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1709  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.13 
 
 
139 aa  90.5  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0024  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.59 
 
 
141 aa  90.1  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3428  Class I peptide chain release factor  39.66 
 
 
141 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3102  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.78 
 
 
144 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1366  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.84 
 
 
141 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4177  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.09 
 
 
139 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.378927  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0634  class I peptide chain release factor  38.81 
 
 
140 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0034  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.84 
 
 
141 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0828  class I peptide chain release factor  39.13 
 
 
143 aa  88.6  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.084227  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1373  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.38 
 
 
140 aa  88.6  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3167  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.09 
 
 
139 aa  88.2  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14431  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.3 
 
 
142 aa  87.4  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134449 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2835  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.55 
 
 
134 aa  87.4  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1617  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.55 
 
 
134 aa  87  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.599417 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0598  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.42 
 
 
147 aa  87  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104756  normal  0.0423062 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2228  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.58 
 
 
146 aa  86.3  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1858  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.21 
 
 
135 aa  86.7  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102554  normal  0.117146 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37860  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.6 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.259651 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02765  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.97 
 
 
143 aa  85.5  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.489905  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4258  class I peptide chain release factor  42.34 
 
 
141 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1842  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.51 
 
 
135 aa  85.5  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2946  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.34 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.661173  normal  0.230853 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2737  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.84 
 
 
169 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3557  Class I peptide chain release factor  37.59 
 
 
140 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.411853 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0582  Class I peptide chain release factor  39.55 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3233  class I peptide chain release factor  37.59 
 
 
140 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.521154 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2126  Class I peptide chain release factor  33.85 
 
 
134 aa  84  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.44766  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6855  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.98 
 
 
137 aa  84.3  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000218203  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3592  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  30.6 
 
 
138 aa  84  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0357  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.31 
 
 
142 aa  84  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.197907  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4033  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  34.59 
 
 
139 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.471406  normal  0.87398 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3229  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.09 
 
 
137 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168853  normal  0.123551 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4856  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  33.83 
 
 
139 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2864  Class I peptide chain release factor  38.17 
 
 
137 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.10878  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0556  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.1 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.908284  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1523  hypothetical protein  35.04 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.331021  normal  0.193244 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1494  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.34 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.129787  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2589  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.41 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.139809 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1390  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.07 
 
 
140 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1772  Class I peptide chain release factor  38.41 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0992468  normal  0.67648 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  31.85 
 
 
137 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3519  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  31.85 
 
 
137 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  31.85 
 
 
137 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1725  class I peptide chain release factor  35.34 
 
 
140 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208717  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0097  class I peptide chain release factor  35.56 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0636  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  33.08 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00765778  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4041  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  34.59 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.733627 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2742  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.8 
 
 
134 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0464887 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13231  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.35 
 
 
140 aa  82  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.107731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2547  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  33.83 
 
 
139 aa  82  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.256849  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34690  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.77 
 
 
137 aa  81.6  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.370131  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2849  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.15 
 
 
134 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.10078  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2442  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.34 
 
 
137 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1767  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.15 
 
 
134 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1191  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.15 
 
 
134 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273593  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0678  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.15 
 
 
134 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.283064  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1388  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.15 
 
 
134 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1392  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.15 
 
 
134 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.367103  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0474  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.15 
 
 
134 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.578239  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3713  Class I peptide chain release factor  35.43 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116579 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2086  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.19 
 
 
133 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1522  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.38 
 
 
134 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876893  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3071  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  33.08 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1045  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  32.33 
 
 
137 aa  80.1  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4768  Class I peptide chain release factor  39.71 
 
 
141 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.561656  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2137  Class I peptide chain release factor  41.04 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157094  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4649  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  34.59 
 
 
137 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1190  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.19 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285712  normal  0.465318 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0736  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.19 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.564723  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53030  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  34.59 
 
 
137 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1217  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.19 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29015  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1587  protein chain release factor B-like protein  35.25 
 
 
133 aa  79.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2102  Class I peptide chain release factor  35.54 
 
 
141 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1100  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.36 
 
 
134 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6283  class I peptide chain release factor  33.88 
 
 
133 aa  77.8  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.426377 
 
 
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NC_008782  Ajs_1612  class I peptide chain release factor  35.54 
 
 
141 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.554845  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1745  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.31 
 
 
135 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.41354  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1100  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.36 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.910918  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0179  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.92 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0513  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  30.37 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_1386  class I peptide chain release factor  36.92 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402498  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2829  Class I peptide chain release factor  35.34 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_1190  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.57 
 
 
142 aa  77  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0102787  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4325  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.36 
 
 
134 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0375174  normal 
 
 
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NC_010002  Daci_2493  class I peptide chain release factor  40 
 
 
132 aa  77  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201964  normal  0.890427 
 
 
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NC_007973  Rmet_3468  class I peptide chain release factor  32.82 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
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