234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0556 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0556  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  100 
 
 		 140 aa  283  5e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.908284  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13231  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  92.14 
 
 		 140 aa  265  2e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.107731 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0357  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.86 
 
 		 142 aa  154  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.197907  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.43 
 
 		 145 aa  147  5e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.472509  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29401  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.63 
 
 		 143 aa  142  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.59 
 
 		 138 aa  137  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.78098  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2589  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.19 
 
 		 143 aa  137  7e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.139809 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14431  aminoacyl-tRNA hydrolase  48.15 
 
 		 142 aa  136  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134449 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2228  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.04 
 
 		 146 aa  130  5e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03841  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.11 
 
 		 142 aa  120  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.300299  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3224  hypothetical protein  45.11 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0828  class I peptide chain release factor  40.15 
 
 		 143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.084227  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6400  Class I peptide chain release factor  39.39 
 
 		 140 aa  107  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1977  hypothetical protein  39.55 
 
 		 147 aa  103  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0582  Class I peptide chain release factor  40.58 
 
 		 143 aa  97.8  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0598  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.3 
 
 		 147 aa  95.9  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104756  normal  0.0423062 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0140  Class I peptide chain release factor  44.7 
 
 		 133 aa  95.5  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.69 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3519  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.69 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.69 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1190  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.3 
 
 		 142 aa  93.6  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0102787  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1495  class I peptide chain release factor  40.15 
 
 		 137 aa  93.6  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011773 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0513  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.57 
 
 		 137 aa  92.8  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4649  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.57 
 
 		 137 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53030  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.57 
 
 		 137 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3284  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.96 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3362  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.84 
 
 		 136 aa  90.9  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3979  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.88 
 
 		 143 aa  90.5  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2137  Class I peptide chain release factor  42.75 
 
 		 145 aa  90.5  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3797  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.88 
 
 		 143 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0177584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0471  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.88 
 
 		 143 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00322425  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6855  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.52 
 
 		 137 aa  90.1  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000218203  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2919  class I peptide chain release factor  42.31 
 
 		 137 aa  90.1  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0177067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34690  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.68 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.370131  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1045  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.13 
 
 		 137 aa  89.4  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37860  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.02 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.259651 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1970  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.57 
 
 		 137 aa  88.6  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1494  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.41 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.129787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3347  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.17 
 
 		 143 aa  88.6  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3102  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.55 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3853  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.17 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4087  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.51 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0179  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.6 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3695  class I peptide chain release factor  37.23 
 
 		 143 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.681232 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3592  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.96 
 
 		 138 aa  87.4  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3579  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.29 
 
 		 137 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28300  protein chain release factor B  43.07 
 
 		 146 aa  86.7  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1818  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.29 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2311  class I peptide chain release factor  36.09 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0960  Class I peptide chain release factor  34.92 
 
 		 145 aa  86.7  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0535  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.34 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000252738  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0097  class I peptide chain release factor  38.41 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0550  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.23 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15800  hypothetical protein  37.5 
 
 		 151 aa  84.3  5e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.25035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4033  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.85 
 
 		 139 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.471406  normal  0.87398 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0636  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.85 
 
 		 143 aa  84.3  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00765778  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0024  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.71 
 
 		 141 aa  84  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1309  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.13 
 
 		 137 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.892435  normal  0.470671 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14580  protein chain release factor B  40.48 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.024949  normal  0.100234 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0245  class I peptide chain release factor  39.86 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84131  normal  0.608303 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2493  class I peptide chain release factor  39.83 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201964  normal  0.890427 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0875  class I peptide chain release factor  39.1 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.174449  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1368  Class I peptide chain release factor  39.1 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.422423  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3059  Class I peptide chain release factor  45.93 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0504323  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2737  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.16 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4177  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.1 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.378927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1772  Class I peptide chain release factor  39.06 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0992468  normal  0.67648 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0012  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.85 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2829  Class I peptide chain release factor  40 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3468  class I peptide chain release factor  35.71 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3167  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.44 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1523  hypothetical protein  36.3 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.331021  normal  0.193244 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1366  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.1 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02765  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.76 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.489905  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0034  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.1 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0736  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.89 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.564723  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1725  class I peptide chain release factor  36.84 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208717  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1217  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.89 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1190  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.89 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285712  normal  0.465318 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2102  Class I peptide chain release factor  36.51 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3760  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  31.78 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000181211  normal  0.0838449 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0672  Class I peptide chain release factor  40.77 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1612  class I peptide chain release factor  36.51 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.554845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4041  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  34.78 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1709  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.64 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2409  class I peptide chain release factor  34.96 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0842293  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2836  class I peptide chain release factor  34.78 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3193  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  34.09 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3557  hypothetical protein  41.18 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2086  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.51 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0202  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  33.85 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3468  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  33.85 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.437856 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0194  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  33.85 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0890  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.77 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.245575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0185  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  33.85 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0196  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  33.85 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1390  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.86 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00190  hypothetical protein  33.86 
 
 		 140 aa  76.6  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.40568  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3713  Class I peptide chain release factor  34.59 
 
 		 140 aa  76.6  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116579 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00189  hypothetical protein  33.86 
 
 		 140 aa  76.6  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.420944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>