245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1725 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1725  class I peptide chain release factor  100 
 
 
140 aa  275  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208717  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0430  class I peptide chain release factor  57.66 
 
 
141 aa  155  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1523  hypothetical protein  55 
 
 
141 aa  153  7e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.331021  normal  0.193244 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0332  class I peptide chain release factor  55.64 
 
 
140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3102  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.48 
 
 
144 aa  140  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0634  class I peptide chain release factor  52.63 
 
 
140 aa  140  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0179  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  55.22 
 
 
143 aa  138  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0097  class I peptide chain release factor  54.14 
 
 
140 aa  138  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2547  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.14 
 
 
139 aa  135  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.256849  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4177  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.08 
 
 
139 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.378927  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3201  hypothetical protein  54.41 
 
 
137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0245  class I peptide chain release factor  56.82 
 
 
140 aa  134  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84131  normal  0.608303 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4033  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.62 
 
 
139 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.471406  normal  0.87398 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0636  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.43 
 
 
143 aa  134  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00765778  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3713  Class I peptide chain release factor  53.54 
 
 
140 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116579 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2666  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.64 
 
 
139 aa  133  7.000000000000001e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1684  Class I peptide chain release factor  52.21 
 
 
138 aa  132  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270418  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2737  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.76 
 
 
169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3428  Class I peptide chain release factor  61.21 
 
 
141 aa  131  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4258  class I peptide chain release factor  57.89 
 
 
141 aa  130  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3557  Class I peptide chain release factor  60.15 
 
 
140 aa  130  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.411853 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3233  class I peptide chain release factor  60.15 
 
 
140 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.521154 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2216  Class I peptide chain release factor  48.15 
 
 
136 aa  130  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3167  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.49 
 
 
139 aa  130  9e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000501  class I peptide chain release factor  50 
 
 
137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00818872  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1242  class I peptide chain release factor  50 
 
 
139 aa  128  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00357715 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0024  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.14 
 
 
141 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0012  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.53 
 
 
137 aa  127  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02765  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50 
 
 
143 aa  127  6e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.489905  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1390  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.37 
 
 
140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4768  Class I peptide chain release factor  56.12 
 
 
141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.561656  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2541  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.94 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1709  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.49 
 
 
139 aa  125  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1366  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.71 
 
 
141 aa  124  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05388  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.53 
 
 
137 aa  124  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0034  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.71 
 
 
141 aa  123  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2919  class I peptide chain release factor  47.45 
 
 
137 aa  123  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0177067  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1494  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.79 
 
 
137 aa  122  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.129787  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3071  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.43 
 
 
140 aa  122  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4856  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.23 
 
 
139 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1045  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.79 
 
 
137 aa  122  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3760  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.26 
 
 
137 aa  121  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000181211  normal  0.0838449 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0867  class I peptide chain release factor  44.85 
 
 
137 aa  121  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.485704  normal  0.838908 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53030  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.53 
 
 
137 aa  120  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4649  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.53 
 
 
137 aa  120  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0890  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.67 
 
 
138 aa  119  9e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.245575  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1373  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.79 
 
 
140 aa  120  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0536  class I peptide chain release factor  48.84 
 
 
133 aa  119  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1970  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.85 
 
 
137 aa  119  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0828493  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1147  Class I peptide chain release factor  45.59 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0838  class I peptide chain release factor  45.59 
 
 
137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.329463 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0026  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.89 
 
 
139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03821  hypothetical protein  46.67 
 
 
138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0173  class I peptide chain release factor  48.53 
 
 
137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.221041  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0875  class I peptide chain release factor  45.99 
 
 
138 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.174449  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3695  class I peptide chain release factor  47.14 
 
 
143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.681232 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1036  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.6 
 
 
146 aa  117  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.501059  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1089  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.6 
 
 
146 aa  117  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.900586  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3412  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.6 
 
 
146 aa  117  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.44659  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2164  Class I peptide chain release factor  46.32 
 
 
137 aa  117  6e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34690  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.53 
 
 
137 aa  117  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.370131  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3254  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.96 
 
 
144 aa  116  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1377  class I peptide chain release factor  44.6 
 
 
138 aa  117  7.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189898 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1842  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.46 
 
 
135 aa  116  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3342  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.43 
 
 
140 aa  116  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3579  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.32 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440076  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2442  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.79 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0215  Class I peptide chain release factor  48.46 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4041  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.06 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.733627 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2409  class I peptide chain release factor  47.97 
 
 
140 aa  115  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0842293  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0262  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.53 
 
 
140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.430585  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0278  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.53 
 
 
140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292576  normal  0.437885 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0281  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.53 
 
 
140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0262  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.53 
 
 
140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.232254  normal  0.925704 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4298  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  55.8 
 
 
147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0267  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.53 
 
 
140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.122717 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2836  class I peptide chain release factor  46.32 
 
 
137 aa  114  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1100  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.03 
 
 
134 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1858  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.61 
 
 
135 aa  113  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102554  normal  0.117146 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2102  Class I peptide chain release factor  50.38 
 
 
141 aa  113  6.9999999999999995e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1612  class I peptide chain release factor  50.38 
 
 
141 aa  113  6.9999999999999995e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.554845  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3411  Class I peptide chain release factor  44.93 
 
 
140 aa  113  7.999999999999999e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1818  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.59 
 
 
137 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1981  Class I peptide chain release factor  45.93 
 
 
136 aa  113  7.999999999999999e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000274722  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2126  Class I peptide chain release factor  51.59 
 
 
134 aa  113  8.999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.44766  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3229  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.06 
 
 
137 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168853  normal  0.123551 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2946  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.06 
 
 
137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.661173  normal  0.230853 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0128  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.19 
 
 
139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0203  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.2 
 
 
140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1309  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.06 
 
 
137 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.892435  normal  0.470671 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1767  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.85 
 
 
134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4325  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.24 
 
 
134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0375174  normal 
 
 
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NC_009800  EcHS_A0194  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.93 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2849  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.37 
 
 
134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.10078  n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_1386  class I peptide chain release factor  48.48 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402498  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_0474  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.85 
 
 
134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.578239  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A1191  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.85 
 
 
134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273593  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A0678  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.85 
 
 
134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.283064  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_1388  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.85 
 
 
134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_1392  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.85 
 
 
134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.367103  n/a   
 
 
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