281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0598 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0598  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  100 
 
 		 147 aa  282  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104756  normal  0.0423062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3224  hypothetical protein  61.31 
 
 		 139 aa  158  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0828  class I peptide chain release factor  65.69 
 
 		 143 aa  159  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.084227  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6400  Class I peptide chain release factor  60.29 
 
 		 140 aa  151  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6855  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  62.12 
 
 		 137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000218203  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1249  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  72.97 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2589  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.33 
 
 		 143 aa  129  9e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.139809 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37860  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  70.09 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.259651 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1139  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  70.09 
 
 		 135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.668699  hitchhiker  0.0000255513 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0672  Class I peptide chain release factor  62.02 
 
 		 164 aa  127  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0582  Class I peptide chain release factor  59.38 
 
 		 143 aa  125  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3059  Class I peptide chain release factor  63.5 
 
 		 146 aa  123  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0504323  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1977  hypothetical protein  56.72 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22660  protein chain release factor B  57.86 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2228  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.04 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0960  Class I peptide chain release factor  54.76 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29401  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.19 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2137  Class I peptide chain release factor  57.66 
 
 		 145 aa  114  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15800  hypothetical protein  61.6 
 
 		 151 aa  114  6e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.25035  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14580  protein chain release factor B  62.81 
 
 		 149 aa  114  6e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.024949  normal  0.100234 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28300  protein chain release factor B  61.24 
 
 		 146 aa  111  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1190  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.18 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0102787  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13231  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.3 
 
 		 140 aa  107  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.107731 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2426  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  60.61 
 
 		 138 aa  107  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2471  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  60.61 
 
 		 138 aa  107  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.496568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3102  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.24 
 
 		 144 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0556  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.3 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.908284  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0179  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.76 
 
 		 143 aa  103  9e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1523  hypothetical protein  47.73 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.331021  normal  0.193244 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14431  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.98 
 
 		 142 aa  100  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134449 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02765  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.78 
 
 		 143 aa  99.4  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.489905  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0357  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.26 
 
 		 142 aa  99.4  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.197907  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0636  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.09 
 
 		 143 aa  98.2  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00765778  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1366  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.85 
 
 		 141 aa  97.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.26 
 
 		 145 aa  97.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.472509  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0034  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.85 
 
 		 141 aa  97.4  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2737  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.24 
 
 		 169 aa  97.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1387  class I peptide chain release factor  56.92 
 
 		 150 aa  97.1  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443355  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0430  class I peptide chain release factor  43.38 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03841  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.59 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.300299  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0332  class I peptide chain release factor  45.86 
 
 		 140 aa  94.7  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3557  Class I peptide chain release factor  50.38 
 
 		 140 aa  94  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.411853 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1373  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.03 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1970  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.86 
 
 		 137 aa  92.8  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1494  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.88 
 
 		 137 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.129787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3071  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.45 
 
 		 140 aa  93.2  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3233  class I peptide chain release factor  51.56 
 
 		 140 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.521154 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0097  class I peptide chain release factor  48.8 
 
 		 140 aa  92.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3428  Class I peptide chain release factor  52.14 
 
 		 141 aa  92  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0024  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.33 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3695  class I peptide chain release factor  42.45 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.681232 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1368  Class I peptide chain release factor  39.42 
 
 		 151 aa  92  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.422423  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3229  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.61 
 
 		 137 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168853  normal  0.123551 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2164  Class I peptide chain release factor  41.98 
 
 		 137 aa  90.5  8e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3254  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.76 
 
 		 144 aa  90.1  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2666  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.48 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  32.58 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.78098  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0245  class I peptide chain release factor  41.79 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84131  normal  0.608303 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4041  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.61 
 
 		 137 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733627 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1725  class I peptide chain release factor  42.54 
 
 		 140 aa  88.2  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208717  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4768  Class I peptide chain release factor  50.36 
 
 		 141 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.561656  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3342  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.65 
 
 		 140 aa  87.8  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3411  Class I peptide chain release factor  41.79 
 
 		 140 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1147  Class I peptide chain release factor  42.34 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3592  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.03 
 
 		 138 aa  87.4  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1242  class I peptide chain release factor  42.96 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357715 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0041  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.2 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00190  hypothetical protein  42.54 
 
 		 140 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.40568  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00189  hypothetical protein  42.54 
 
 		 140 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.420944  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0026  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.04 
 
 		 139 aa  87  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3468  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.79 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.437856 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0185  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.79 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0140  Class I peptide chain release factor  43.85 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0203  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.79 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0202  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.79 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.76 
 
 		 137 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3519  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.76 
 
 		 137 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2311  class I peptide chain release factor  45.52 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.76 
 
 		 137 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4258  class I peptide chain release factor  52.34 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0196  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.79 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2493  class I peptide chain release factor  46.15 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201964  normal  0.890427 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0194  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.79 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0875  class I peptide chain release factor  40.3 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.174449  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3347  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.76 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4856  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.55 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3579  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.88 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3853  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.03 
 
 		 143 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53030  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.57 
 
 		 137 aa  84  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1495  class I peptide chain release factor  39.13 
 
 		 137 aa  83.6  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011773 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3797  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.03 
 
 		 143 aa  83.6  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0177584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2102  Class I peptide chain release factor  44.88 
 
 		 141 aa  83.6  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1612  class I peptide chain release factor  44.88 
 
 		 141 aa  83.6  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.554845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0471  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.03 
 
 		 143 aa  83.6  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00322425  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1818  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.15 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1709  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.54 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2864  Class I peptide chain release factor  43.88 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.10878  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3193  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.34 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0890  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.51 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.245575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2742  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.61 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>