227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2311 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2311  class I peptide chain release factor  100 
 
 		 144 aa  285  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29401  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.86 
 
 		 143 aa  107  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0430  class I peptide chain release factor  47.45 
 
 		 141 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0332  class I peptide chain release factor  45 
 
 		 140 aa  106  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0634  class I peptide chain release factor  42.54 
 
 		 140 aa  106  9.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01530  peptidyl-tRNA hydrolase  42.52 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2541  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.61 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1366  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.44 
 
 		 141 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0097  class I peptide chain release factor  42.86 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0034  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.44 
 
 		 141 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3071  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.36 
 
 		 140 aa  103  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0245  class I peptide chain release factor  45.8 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84131  normal  0.608303 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0024  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.96 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0636  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.19 
 
 		 143 aa  100  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00765778  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2228  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.04 
 
 		 146 aa  100  6e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1190  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.69 
 
 		 142 aa  99.4  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0102787  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2589  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.86 
 
 		 143 aa  98.6  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.139809 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1772  Class I peptide chain release factor  43.88 
 
 		 139 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0992468  normal  0.67648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3224  hypothetical protein  44.36 
 
 		 139 aa  97.1  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14431  aminoacyl-tRNA hydrolase  45.45 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134449 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3713  Class I peptide chain release factor  42.86 
 
 		 140 aa  95.9  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116579 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1147  Class I peptide chain release factor  40.43 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1725  class I peptide chain release factor  41.48 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208717  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4033  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.13 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.471406  normal  0.87398 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1587  protein chain release factor B-like protein  43.44 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4177  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.72 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.378927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3167  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40 
 
 		 139 aa  94  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4856  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.84 
 
 		 139 aa  93.6  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02765  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.03 
 
 		 143 aa  93.6  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.489905  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0026  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.96 
 
 		 139 aa  93.2  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53030  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.26 
 
 		 137 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1523  hypothetical protein  39.55 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.331021  normal  0.193244 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0357  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.26 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.197907  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1709  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.84 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2666  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.29 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3102  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.35 
 
 		 144 aa  92  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2547  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.57 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.256849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0149  Class I peptide chain release factor  39.16 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1390  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.25 
 
 		 140 aa  91.3  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4649  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.52 
 
 		 137 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1368  Class I peptide chain release factor  37.59 
 
 		 151 aa  90.5  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.422423  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6400  Class I peptide chain release factor  42.11 
 
 		 140 aa  90.5  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0202  hypothetical protein  47.62 
 
 		 143 aa  90.5  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3695  class I peptide chain release factor  38.06 
 
 		 143 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.681232 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3342  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.12 
 
 		 140 aa  90.5  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0140  Class I peptide chain release factor  41.61 
 
 		 133 aa  90.1  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3579  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40 
 
 		 137 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0890  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.88 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.245575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1684  Class I peptide chain release factor  39.26 
 
 		 138 aa  88.6  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270418  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2829  Class I peptide chain release factor  40 
 
 		 137 aa  88.6  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4614  Class I peptide chain release factor  42.06 
 
 		 135 aa  88.6  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6283  class I peptide chain release factor  38.52 
 
 		 133 aa  89.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.426377 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.35 
 
 		 138 aa  88.6  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.78098  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1818  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.26 
 
 		 137 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1494  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40 
 
 		 137 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.129787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.1 
 
 		 137 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3519  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.1 
 
 		 137 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.1 
 
 		 137 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4298  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.93 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3971  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.19 
 
 		 146 aa  87.8  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3468  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.44 
 
 		 140 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.437856 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1191  Class I peptide chain release factor  41.44 
 
 		 136 aa  87.8  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0513  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.1 
 
 		 137 aa  87.8  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1981  Class I peptide chain release factor  40.3 
 
 		 136 aa  87.8  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000274722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2164  Class I peptide chain release factor  42.96 
 
 		 137 aa  87.8  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0875  class I peptide chain release factor  39.57 
 
 		 138 aa  86.7  9e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.174449  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3411  Class I peptide chain release factor  39.71 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1309  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.52 
 
 		 137 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.892435  normal  0.470671 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0416  Class I peptide chain release factor  43.09 
 
 		 132 aa  86.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2946  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.65 
 
 		 137 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.661173  normal  0.230853 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0556  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.09 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.908284  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0194  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.71 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0185  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.71 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3468  class I peptide chain release factor  38.52 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1151  peptide chain release factor  35.43 
 
 		 145 aa  86.7  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0196  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.71 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0203  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.71 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0202  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869706  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00190  hypothetical protein  39.71 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.40568  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4041  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.26 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733627 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00189  hypothetical protein  39.71 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.420944  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0960  Class I peptide chain release factor  44.44 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3428  Class I peptide chain release factor  48.74 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.3 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.472509  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13231  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.25 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.107731 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0179  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.1 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0730  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.44 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1373  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.78 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2352  class I peptide chain release factor  41.98 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0012  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.56 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4768  Class I peptide chain release factor  44.78 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.561656  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4258  class I peptide chain release factor  45.65 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2737  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.75 
 
 		 169 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3201  hypothetical protein  38.52 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0736  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.09 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.564723  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1190  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.09 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285712  normal  0.465318 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1217  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.09 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29015  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3853  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.04 
 
 		 143 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0828  class I peptide chain release factor  42.52 
 
 		 143 aa  83.6  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.084227  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1045  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.34 
 
 		 137 aa  83.6  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>