235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1191 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1191  Class I peptide chain release factor  100 
 
 		 136 aa  270  7e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1587  protein chain release factor B-like protein  47.66 
 
 		 133 aa  115  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0416  Class I peptide chain release factor  46.85 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1151  peptide chain release factor  38.76 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4614  Class I peptide chain release factor  45.04 
 
 		 135 aa  94  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6283  class I peptide chain release factor  39.67 
 
 		 133 aa  90.9  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.426377 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2311  class I peptide chain release factor  41.44 
 
 		 144 aa  87.8  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3193  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.13 
 
 		 137 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0357  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.71 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.197907  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01530  peptidyl-tRNA hydrolase  34.88 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0149  Class I peptide chain release factor  40.16 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0024  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.44 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1970  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.74 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1495  class I peptide chain release factor  39.1 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011773 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0097  class I peptide chain release factor  33.57 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1366  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.8 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1977  hypothetical protein  37.5 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0034  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.8 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4649  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.38 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0202  hypothetical protein  36 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0140  Class I peptide chain release factor  33.33 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0634  class I peptide chain release factor  37.1 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0636  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.74 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00765778  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0430  class I peptide chain release factor  35.83 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0332  class I peptide chain release factor  41.74 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29401  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.93 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3071  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.97 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53030  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.52 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1523  hypothetical protein  36.36 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.331021  normal  0.193244 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3284  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  33.33 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1767  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.67 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0474  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.67 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.578239  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1373  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.38 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1191  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.67 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273593  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0678  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.67 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.283064  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1388  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.67 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1392  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.67 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.367103  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0828  class I peptide chain release factor  36.57 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.084227  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03841  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.04 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.300299  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0598  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.59 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104756  normal  0.0423062 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1522  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876893  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2589  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  32.85 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.139809 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.472509  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.75 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.78098  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2849  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.84 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.10078  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2164  Class I peptide chain release factor  40.5 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14431  aminoacyl-tRNA hydrolase  36.23 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134449 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0179  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.22 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0513  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0012  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.14 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0672  Class I peptide chain release factor  38.35 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2666  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.24 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6855  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.64 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000218203  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3519  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0582  Class I peptide chain release factor  42.2 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2737  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.1 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1190  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.14 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0102787  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1725  class I peptide chain release factor  36.94 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208717  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3102  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.4 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3224  hypothetical protein  38.53 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0026  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.23 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05388  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.46 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34690  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.44 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.370131  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0185  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.65 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0196  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.65 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0194  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.65 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00190  hypothetical protein  36.19 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.40568  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0203  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.65 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0202  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.65 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1249  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.21 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00189  hypothetical protein  36.19 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.420944  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3468  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.04 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.437856 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0173  class I peptide chain release factor  36.21 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.221041  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3853  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  32.52 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2919  class I peptide chain release factor  37.07 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0177067  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3411  Class I peptide chain release factor  34.78 
 
 		 140 aa  62  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0838  class I peptide chain release factor  38.05 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.329463 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1377  class I peptide chain release factor  36.22 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189898 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1494  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.79 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.129787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0245  class I peptide chain release factor  35 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84131  normal  0.608303 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3592  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  29.85 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02765  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40 
 
 		 143 aa  62  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.489905  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0919  class I peptide chain release factor  36.52 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0730  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.1 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000501  class I peptide chain release factor  38.46 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00818872  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6400  Class I peptide chain release factor  38.1 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3347  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  32.52 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3201  hypothetical protein  37.5 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0867  class I peptide chain release factor  37.86 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.485704  normal  0.838908 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3797  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  32.52 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0177584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0471  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  32.52 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00322425  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2829  Class I peptide chain release factor  36.36 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3362  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  33.91 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3979  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  32.52 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4087  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  33.33 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1139  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.21 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.668699  hitchhiker  0.0000255513 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03821  hypothetical protein  39.13 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2409  class I peptide chain release factor  36.8 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0842293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>