273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1249 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1249  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  100 
 
 		 129 aa  246  6e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1139  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  93.8 
 
 		 135 aa  176  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.668699  hitchhiker  0.0000255513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3224  hypothetical protein  71.2 
 
 		 139 aa  167  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6400  Class I peptide chain release factor  67.2 
 
 		 140 aa  156  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0598  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  68.99 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104756  normal  0.0423062 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0828  class I peptide chain release factor  64.8 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.084227  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6855  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  61.72 
 
 		 137 aa  139  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000218203  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37860  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  68.14 
 
 		 141 aa  136  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.259651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0672  Class I peptide chain release factor  64 
 
 		 164 aa  132  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0582  Class I peptide chain release factor  63.71 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0960  Class I peptide chain release factor  62.1 
 
 		 145 aa  130  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2589  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.4 
 
 		 143 aa  125  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.139809 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22660  protein chain release factor B  60.94 
 
 		 146 aa  123  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1190  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  58.33 
 
 		 142 aa  120  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0102787  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29401  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.4 
 
 		 143 aa  120  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2137  Class I peptide chain release factor  64 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1977  hypothetical protein  52 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28300  protein chain release factor B  59.84 
 
 		 146 aa  111  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3059  Class I peptide chain release factor  64 
 
 		 146 aa  110  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0504323  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14431  aminoacyl-tRNA hydrolase  46.83 
 
 		 142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134449 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2426  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  69.67 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2471  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  69.67 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.496568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15800  hypothetical protein  61.72 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.25035  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0357  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.2 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.197907  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02765  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.2 
 
 		 143 aa  103  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.489905  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13231  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.76 
 
 		 140 aa  103  7e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.107731 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2228  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.72 
 
 		 146 aa  103  8e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1373  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.58 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14580  protein chain release factor B  58.06 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.024949  normal  0.100234 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3102  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.2 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1368  Class I peptide chain release factor  42.97 
 
 		 151 aa  100  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.422423  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2311  class I peptide chain release factor  52 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0179  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48 
 
 		 143 aa  98.6  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0556  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.76 
 
 		 140 aa  98.6  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.908284  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2737  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.31 
 
 		 169 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.8 
 
 		 138 aa  97.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.78098  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1523  hypothetical protein  48.44 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.331021  normal  0.193244 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2666  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.48 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1387  class I peptide chain release factor  57.02 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443355  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0430  class I peptide chain release factor  48.39 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.2 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.472509  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0097  class I peptide chain release factor  47.24 
 
 		 140 aa  94.4  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0332  class I peptide chain release factor  47.24 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1366  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.97 
 
 		 141 aa  92  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0026  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.97 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0034  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.62 
 
 		 141 aa  92  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0636  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.03 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00765778  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0024  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.83 
 
 		 141 aa  90.5  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2541  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.2 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3428  Class I peptide chain release factor  50.82 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0979  Class I peptide chain release factor  60.8 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000812989 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3071  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.33 
 
 		 140 aa  88.6  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03841  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.25 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.300299  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1147  Class I peptide chain release factor  46.61 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3233  class I peptide chain release factor  51.15 
 
 		 140 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.521154 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3557  Class I peptide chain release factor  51.15 
 
 		 140 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.411853 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0149  Class I peptide chain release factor  44.62 
 
 		 146 aa  87.4  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2164  Class I peptide chain release factor  44.96 
 
 		 137 aa  87  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0245  class I peptide chain release factor  45.24 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84131  normal  0.608303 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1242  class I peptide chain release factor  46.56 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357715 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4768  Class I peptide chain release factor  53.17 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.561656  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.46 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3519  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.46 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.46 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1522  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.49 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876893  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3342  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.62 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1767  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.49 
 
 		 134 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3695  class I peptide chain release factor  41.27 
 
 		 143 aa  84  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.681232 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2849  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.49 
 
 		 134 aa  84.3  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.10078  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1392  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.49 
 
 		 134 aa  84  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.367103  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1388  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.49 
 
 		 134 aa  84  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0474  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.49 
 
 		 134 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.578239  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1191  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.49 
 
 		 134 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273593  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0678  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.49 
 
 		 134 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.283064  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3254  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.64 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4258  class I peptide chain release factor  53.97 
 
 		 141 aa  84  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3411  Class I peptide chain release factor  42.62 
 
 		 140 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00190  hypothetical protein  42.62 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.40568  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0203  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.62 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0185  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.62 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0202  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.62 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00189  hypothetical protein  42.62 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.420944  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1725  class I peptide chain release factor  43.18 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208717  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0196  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.62 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3468  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.62 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.437856 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0194  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.62 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2864  Class I peptide chain release factor  46.09 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.10878  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0634  class I peptide chain release factor  42.74 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4041  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.41 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733627 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1772  Class I peptide chain release factor  47.33 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0992468  normal  0.67648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0140  Class I peptide chain release factor  45.16 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1494  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.09 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.129787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2298  class I peptide chain release factor  41.8 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2946  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.4 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.661173  normal  0.230853 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0278  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.62 
 
 		 140 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292576  normal  0.437885 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0281  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.62 
 
 		 140 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0262  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.62 
 
 		 140 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.232254  normal  0.925704 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0262  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.62 
 
 		 140 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.430585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3229  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.64 
 
 		 137 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168853  normal  0.123551 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0267  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.62 
 
 		 140 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.122717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>