266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1242 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1242  class I peptide chain release factor  100 
 
 		 139 aa  272  9e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357715 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2547  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.08 
 
 		 139 aa  130  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.256849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1725  class I peptide chain release factor  50 
 
 		 140 aa  128  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208717  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1390  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.17 
 
 		 140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4856  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.91 
 
 		 139 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3233  class I peptide chain release factor  54.55 
 
 		 140 aa  127  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.521154 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3167  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.09 
 
 		 139 aa  127  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1523  hypothetical protein  51.13 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.331021  normal  0.193244 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0332  class I peptide chain release factor  53.44 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3428  Class I peptide chain release factor  52.89 
 
 		 141 aa  124  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3557  Class I peptide chain release factor  56.1 
 
 		 140 aa  124  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.411853 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0097  class I peptide chain release factor  51.49 
 
 		 140 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4768  Class I peptide chain release factor  53.73 
 
 		 141 aa  120  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.561656  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1858  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.22 
 
 		 135 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102554  normal  0.117146 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3071  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.83 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1386  class I peptide chain release factor  50 
 
 		 141 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402498  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4033  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.72 
 
 		 139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.471406  normal  0.87398 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0636  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.46 
 
 		 143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00765778  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0245  class I peptide chain release factor  48.89 
 
 		 140 aa  117  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84131  normal  0.608303 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4177  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.26 
 
 		 139 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.378927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1373  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.48 
 
 		 140 aa  116  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2742  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464887 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4258  class I peptide chain release factor  51.49 
 
 		 141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0024  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.99 
 
 		 141 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3713  Class I peptide chain release factor  50.39 
 
 		 140 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116579 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2216  Class I peptide chain release factor  44.03 
 
 		 136 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0179  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.29 
 
 		 143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3342  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.03 
 
 		 140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2666  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.92 
 
 		 139 aa  111  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1366  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.53 
 
 		 141 aa  110  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0034  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.53 
 
 		 141 aa  110  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0026  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.92 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0430  class I peptide chain release factor  44.36 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1494  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.03 
 
 		 137 aa  107  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.129787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1970  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.67 
 
 		 137 aa  107  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1495  class I peptide chain release factor  47.33 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011773 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2864  Class I peptide chain release factor  45.86 
 
 		 137 aa  104  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.10878  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1709  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.92 
 
 		 139 aa  103  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1842  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.44 
 
 		 135 aa  103  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3695  class I peptide chain release factor  48.03 
 
 		 143 aa  103  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.681232 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3579  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.78 
 
 		 137 aa  103  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2541  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.74 
 
 		 140 aa  103  8e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2164  Class I peptide chain release factor  41.79 
 
 		 137 aa  103  9e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0890  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.18 
 
 		 138 aa  102  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.245575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3229  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.03 
 
 		 137 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168853  normal  0.123551 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2946  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.78 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.661173  normal  0.230853 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3201  hypothetical protein  44.03 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1818  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.03 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0875  class I peptide chain release factor  43.28 
 
 		 138 aa  101  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.174449  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1612  class I peptide chain release factor  44.88 
 
 		 141 aa  100  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.554845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2102  Class I peptide chain release factor  44.88 
 
 		 141 aa  100  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4041  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.28 
 
 		 137 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733627 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4298  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.65 
 
 		 147 aa  100  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0634  class I peptide chain release factor  49.11 
 
 		 140 aa  100  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02765  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.31 
 
 		 143 aa  100  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.489905  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1981  Class I peptide chain release factor  42.54 
 
 		 136 aa  100  7e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000274722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2409  class I peptide chain release factor  41.3 
 
 		 140 aa  100  8e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0842293  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3254  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.45 
 
 		 144 aa  100  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3501  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.26 
 
 		 143 aa  100  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0012  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.79 
 
 		 137 aa  100  9e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000501  class I peptide chain release factor  43.18 
 
 		 137 aa  99.8  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00818872  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2737  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.98 
 
 		 169 aa  99.4  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0128  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.65 
 
 		 139 aa  99  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0215  Class I peptide chain release factor  45.6 
 
 		 132 aa  99.4  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2442  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.18 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3971  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.93 
 
 		 146 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0041  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.12 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3102  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.52 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1617  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.67 
 
 		 134 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.599417 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1045  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.31 
 
 		 137 aa  99.4  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2835  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.67 
 
 		 134 aa  98.2  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3411  Class I peptide chain release factor  42.54 
 
 		 140 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2126  Class I peptide chain release factor  42.97 
 
 		 134 aa  97.4  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.44766  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2836  class I peptide chain release factor  41.79 
 
 		 137 aa  97.8  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0203  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.54 
 
 		 140 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0536  class I peptide chain release factor  43.9 
 
 		 133 aa  97.1  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4400  peptidyl-tRNA hydrolase domain-containing protein  40.15 
 
 		 137 aa  96.7  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.485154  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05388  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.67 
 
 		 137 aa  96.7  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0194  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.54 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0730  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.42 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0185  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.54 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3468  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.54 
 
 		 140 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.437856 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0196  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.54 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00190  hypothetical protein  42.54 
 
 		 140 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.40568  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1036  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.57 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.501059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3412  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.57 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.44659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0202  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.42 
 
 		 136 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1089  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.57 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.900586  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00189  hypothetical protein  42.54 
 
 		 140 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.420944  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1309  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.54 
 
 		 137 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.892435  normal  0.470671 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4325  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.28 
 
 		 134 aa  94.7  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0375174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1190  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.28 
 
 		 134 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285712  normal  0.465318 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3468  class I peptide chain release factor  43.18 
 
 		 138 aa  95.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0736  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.28 
 
 		 134 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.564723  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1100  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.28 
 
 		 134 aa  94.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1217  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.28 
 
 		 134 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29015  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2088  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.87 
 
 		 178 aa  94.4  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.273821  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03821  hypothetical protein  43.94 
 
 		 138 aa  94.4  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1100  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.28 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.910918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0830  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.87 
 
 		 157 aa  94.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.367677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>