268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3233 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3233  class I peptide chain release factor  100 
 
 
140 aa  272  9e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.521154 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3557  Class I peptide chain release factor  98.57 
 
 
140 aa  269  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.411853 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3428  Class I peptide chain release factor  95 
 
 
141 aa  239  9e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4768  Class I peptide chain release factor  78.42 
 
 
141 aa  187  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.561656  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4258  class I peptide chain release factor  77.3 
 
 
141 aa  187  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3167  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  66.18 
 
 
139 aa  169  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2547  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  61.59 
 
 
139 aa  161  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.256849  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1390  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  64.23 
 
 
140 aa  157  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1523  hypothetical protein  61.15 
 
 
141 aa  157  6e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.331021  normal  0.193244 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4033  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  61.59 
 
 
139 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.471406  normal  0.87398 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4177  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  59.42 
 
 
139 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.378927  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3102  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  62.69 
 
 
144 aa  154  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0332  class I peptide chain release factor  61.36 
 
 
140 aa  152  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4856  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  57.25 
 
 
139 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0179  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  60.61 
 
 
143 aa  147  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0430  class I peptide chain release factor  59.09 
 
 
141 aa  146  9e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0245  class I peptide chain release factor  56.2 
 
 
140 aa  146  9e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84131  normal  0.608303 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2541  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  56.43 
 
 
140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1725  class I peptide chain release factor  60.15 
 
 
140 aa  144  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208717  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2737  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  63.11 
 
 
169 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0097  class I peptide chain release factor  59.09 
 
 
140 aa  144  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3071  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.68 
 
 
140 aa  141  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02765  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  57.46 
 
 
143 aa  140  8e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.489905  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3695  class I peptide chain release factor  56.62 
 
 
143 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.681232 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1242  class I peptide chain release factor  54.55 
 
 
139 aa  137  6e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00357715 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0034  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  56.52 
 
 
141 aa  135  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1366  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  56.52 
 
 
141 aa  135  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2742  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.62 
 
 
134 aa  135  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0464887 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3713  Class I peptide chain release factor  54.01 
 
 
140 aa  135  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116579 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1858  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  55.38 
 
 
135 aa  135  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102554  normal  0.117146 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1709  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  60.15 
 
 
139 aa  134  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2102  Class I peptide chain release factor  58.91 
 
 
141 aa  134  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1612  class I peptide chain release factor  58.91 
 
 
141 aa  134  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.554845  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0890  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.38 
 
 
138 aa  134  6.0000000000000005e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.245575  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0128  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.2 
 
 
139 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1494  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.88 
 
 
137 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.129787  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0024  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  55.07 
 
 
141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2442  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.88 
 
 
137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0634  class I peptide chain release factor  51.8 
 
 
140 aa  131  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1373  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.63 
 
 
140 aa  131  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0026  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.41 
 
 
139 aa  131  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3254  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  60.43 
 
 
144 aa  130  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1684  Class I peptide chain release factor  51.88 
 
 
138 aa  130  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270418  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3229  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.63 
 
 
137 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168853  normal  0.123551 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4041  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.88 
 
 
137 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.733627 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2946  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.13 
 
 
137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.661173  normal  0.230853 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1100  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  55.04 
 
 
134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1842  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  55.04 
 
 
135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1100  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.26 
 
 
134 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.910918  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2493  class I peptide chain release factor  56.92 
 
 
132 aa  127  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201964  normal  0.890427 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2849  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  60.33 
 
 
134 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.10078  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0636  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.14 
 
 
143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00765778  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34690  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.63 
 
 
137 aa  127  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.370131  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4325  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.26 
 
 
134 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0375174  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2864  Class I peptide chain release factor  54.81 
 
 
137 aa  126  9.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.10878  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1767  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  60.33 
 
 
134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3579  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.13 
 
 
137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440076  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1388  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  60.33 
 
 
134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0678  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  60.33 
 
 
134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.283064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1392  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  60.33 
 
 
134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.367103  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1386  class I peptide chain release factor  52.67 
 
 
141 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402498  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0474  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  60.33 
 
 
134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.578239  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3501  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  55.56 
 
 
143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3971  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  57.97 
 
 
146 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4298  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  58.7 
 
 
147 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1191  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  60.33 
 
 
134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273593  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1190  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.4 
 
 
134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285712  normal  0.465318 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0736  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.4 
 
 
134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.564723  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2126  Class I peptide chain release factor  54.4 
 
 
134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.44766  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1217  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.4 
 
 
134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29015  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1522  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  59.68 
 
 
134 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876893  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2666  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.13 
 
 
139 aa  124  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1045  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.62 
 
 
137 aa  124  5e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1818  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.38 
 
 
137 aa  123  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0830  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  58.21 
 
 
157 aa  123  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.367677  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1970  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.21 
 
 
137 aa  123  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0828493  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3201  hypothetical protein  48.89 
 
 
137 aa  123  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000501  class I peptide chain release factor  46.97 
 
 
137 aa  122  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00818872  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1309  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  56.2 
 
 
137 aa  122  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.892435  normal  0.470671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2298  class I peptide chain release factor  51.97 
 
 
146 aa  122  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2086  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.71 
 
 
133 aa  121  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2919  class I peptide chain release factor  45.86 
 
 
137 aa  120  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0177067  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0730  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.37 
 
 
140 aa  119  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2835  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.67 
 
 
134 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0012  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.45 
 
 
137 aa  119  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53030  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.62 
 
 
137 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2352  class I peptide chain release factor  48.51 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2088  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  55.97 
 
 
178 aa  118  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.273821  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4649  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.87 
 
 
137 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05388  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.45 
 
 
137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007969  Pcryo_0867  class I peptide chain release factor  44.27 
 
 
137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.485704  normal  0.838908 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0041  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  56.12 
 
 
144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010681  Bphyt_1617  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.91 
 
 
134 aa  117  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.599417 
 
 
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NC_013223  Dret_1147  Class I peptide chain release factor  49.62 
 
 
142 aa  117  6e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0536  class I peptide chain release factor  47.29 
 
 
133 aa  117  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010803  Clim_2164  Class I peptide chain release factor  48.48 
 
 
137 aa  117  6e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007614  Nmul_A2409  class I peptide chain release factor  48.03 
 
 
140 aa  116  7.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0842293  n/a   
 
 
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NC_009505  BOV_2008  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  55.22 
 
 
178 aa  115  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0938485  n/a   
 
 
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NC_013422  Hneap_0215  Class I peptide chain release factor  48.03 
 
 
132 aa  115  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_2836  class I peptide chain release factor  48.41 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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