231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3713 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3713  Class I peptide chain release factor  100 
 
 		 140 aa  274  4e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116579 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0245  class I peptide chain release factor  60.71 
 
 		 140 aa  169  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84131  normal  0.608303 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0634  class I peptide chain release factor  63.16 
 
 		 140 aa  160  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0332  class I peptide chain release factor  53.38 
 
 		 140 aa  134  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0430  class I peptide chain release factor  51.49 
 
 		 141 aa  133  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1725  class I peptide chain release factor  53.54 
 
 		 140 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208717  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1523  hypothetical protein  53.03 
 
 		 141 aa  132  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.331021  normal  0.193244 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2541  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  56.25 
 
 		 140 aa  131  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0097  class I peptide chain release factor  51.49 
 
 		 140 aa  127  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3071  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.26 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3428  Class I peptide chain release factor  56.2 
 
 		 141 aa  124  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3233  class I peptide chain release factor  54.01 
 
 		 140 aa  124  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.521154 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3557  Class I peptide chain release factor  54.55 
 
 		 140 aa  120  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.411853 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3695  class I peptide chain release factor  51.16 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.681232 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2742  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.21 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464887 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1390  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.68 
 
 		 140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3468  class I peptide chain release factor  50.39 
 
 		 138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1612  class I peptide chain release factor  49.22 
 
 		 141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.554845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2102  Class I peptide chain release factor  49.22 
 
 		 141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000501  class I peptide chain release factor  50 
 
 		 137 aa  117  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00818872  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0012  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.19 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4177  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.61 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.378927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1386  class I peptide chain release factor  51.11 
 
 		 141 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402498  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4033  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.23 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.471406  normal  0.87398 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1684  Class I peptide chain release factor  51.52 
 
 		 138 aa  115  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270418  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1495  class I peptide chain release factor  50.39 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011773 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3167  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.42 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0636  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.61 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00765778  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0026  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.39 
 
 		 139 aa  114  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4768  Class I peptide chain release factor  54.55 
 
 		 141 aa  114  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.561656  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2216  Class I peptide chain release factor  48.85 
 
 		 136 aa  114  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1842  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.31 
 
 		 135 aa  113  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1242  class I peptide chain release factor  50.39 
 
 		 139 aa  113  8.999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357715 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2547  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.59 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.256849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2409  class I peptide chain release factor  45.11 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0842293  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1373  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50 
 
 		 140 aa  111  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02765  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.51 
 
 		 143 aa  111  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.489905  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1045  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.61 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2919  class I peptide chain release factor  49.17 
 
 		 137 aa  110  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0177067  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2298  class I peptide chain release factor  49.21 
 
 		 146 aa  110  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0024  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.28 
 
 		 141 aa  110  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05388  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.59 
 
 		 137 aa  110  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4258  class I peptide chain release factor  53.85 
 
 		 141 aa  110  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2164  Class I peptide chain release factor  48.12 
 
 		 137 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1494  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.58 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.129787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2072  class I peptide chain release factor  48.06 
 
 		 138 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0774225  normal  0.971682 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3501  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.39 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3102  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.66 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0890  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.14 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.245575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1858  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.03 
 
 		 135 aa  108  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102554  normal  0.117146 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.71 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3519  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.71 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.71 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0179  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.1 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0128  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.14 
 
 		 139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3579  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.58 
 
 		 137 aa  107  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440076  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2829  Class I peptide chain release factor  50 
 
 		 137 aa  107  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1366  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.57 
 
 		 141 aa  107  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2352  class I peptide chain release factor  49.59 
 
 		 138 aa  107  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0034  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.57 
 
 		 141 aa  107  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1818  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.58 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0536  class I peptide chain release factor  46.62 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1147  Class I peptide chain release factor  47.62 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4325  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.11 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0375174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2737  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.76 
 
 		 169 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1100  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.93 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3201  hypothetical protein  45.45 
 
 		 137 aa  104  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0838  class I peptide chain release factor  46.88 
 
 		 137 aa  104  5e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.329463 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1100  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.11 
 
 		 134 aa  103  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.910918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4856  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.97 
 
 		 139 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4649  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.78 
 
 		 137 aa  103  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1309  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50 
 
 		 137 aa  103  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.892435  normal  0.470671 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2666  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.67 
 
 		 139 aa  103  9e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1377  class I peptide chain release factor  43.94 
 
 		 138 aa  102  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189898 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03821  hypothetical protein  44.8 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0513  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.85 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4087  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.43 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0875  class I peptide chain release factor  48 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.174449  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3284  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.14 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0867  class I peptide chain release factor  45.16 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.485704  normal  0.838908 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53030  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.78 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1709  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2304  class I peptide chain release factor  53.97 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.47623  hitchhiker  0.00332943 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1970  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.27 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0550  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.73 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1190  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.45 
 
 		 134 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285712  normal  0.465318 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0173  class I peptide chain release factor  48.33 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.221041  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0736  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.45 
 
 		 134 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.564723  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1217  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.45 
 
 		 134 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29015  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3342  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.79 
 
 		 140 aa  100  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2493  class I peptide chain release factor  44.96 
 
 		 132 aa  99.4  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201964  normal  0.890427 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2442  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.16 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1981  Class I peptide chain release factor  43.85 
 
 		 136 aa  98.6  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000274722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4041  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.16 
 
 		 137 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733627 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2946  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.16 
 
 		 137 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.661173  normal  0.230853 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0535  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.44 
 
 		 140 aa  98.2  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000252738  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2126  Class I peptide chain release factor  46.03 
 
 		 134 aa  98.2  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.44766  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1617  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.29 
 
 		 134 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.599417 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2086  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.63 
 
 		 133 aa  98.2  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3557  hypothetical protein  47.46 
 
 		 136 aa  97.8  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>