More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2164 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2164  Class I peptide chain release factor  100 
 
 		 137 aa  272  1.0000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1045  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  61.31 
 
 		 137 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2352  class I peptide chain release factor  63.08 
 
 		 138 aa  160  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3201  hypothetical protein  55.56 
 
 		 137 aa  158  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1684  Class I peptide chain release factor  56.62 
 
 		 138 aa  157  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270418  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1970  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.81 
 
 		 137 aa  156  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2216  Class I peptide chain release factor  58.52 
 
 		 136 aa  155  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53030  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.94 
 
 		 137 aa  155  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4649  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.94 
 
 		 137 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0012  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.41 
 
 		 137 aa  155  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0536  class I peptide chain release factor  58.02 
 
 		 133 aa  154  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0838  class I peptide chain release factor  51.47 
 
 		 137 aa  154  4e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.329463 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2409  class I peptide chain release factor  57.48 
 
 		 140 aa  153  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0842293  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3579  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.94 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3229  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.41 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168853  normal  0.123551 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1494  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.94 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.129787  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1818  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.21 
 
 		 137 aa  150  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4041  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.94 
 
 		 137 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733627 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0867  class I peptide chain release factor  49.26 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.485704  normal  0.838908 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34690  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.47 
 
 		 137 aa  148  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.370131  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1495  class I peptide chain release factor  52.63 
 
 		 137 aa  147  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011773 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2946  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.21 
 
 		 137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.661173  normal  0.230853 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03821  hypothetical protein  50.37 
 
 		 138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1309  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.47 
 
 		 137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.892435  normal  0.470671 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1147  Class I peptide chain release factor  55.15 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2919  class I peptide chain release factor  48.91 
 
 		 137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0177067  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0875  class I peptide chain release factor  50.37 
 
 		 138 aa  144  5e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.174449  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1386  class I peptide chain release factor  50.38 
 
 		 141 aa  144  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402498  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1377  class I peptide chain release factor  49.26 
 
 		 138 aa  144  5e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189898 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0128  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.48 
 
 		 139 aa  142  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2442  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.21 
 
 		 137 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1981  Class I peptide chain release factor  54.14 
 
 		 136 aa  142  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000274722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000501  class I peptide chain release factor  52.59 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00818872  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3411  Class I peptide chain release factor  50.37 
 
 		 140 aa  141  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2829  Class I peptide chain release factor  52.59 
 
 		 137 aa  141  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2126  Class I peptide chain release factor  56.56 
 
 		 134 aa  141  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.44766  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3468  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.37 
 
 		 140 aa  140  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.437856 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2102  Class I peptide chain release factor  52.34 
 
 		 141 aa  140  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0203  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.37 
 
 		 140 aa  140  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1612  class I peptide chain release factor  52.34 
 
 		 141 aa  140  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.554845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0194  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.37 
 
 		 140 aa  140  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0196  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.37 
 
 		 140 aa  140  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0185  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.37 
 
 		 140 aa  140  6e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0202  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.52 
 
 		 136 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869706  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00190  hypothetical protein  49.63 
 
 		 140 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.40568  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1190  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.47 
 
 		 134 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285712  normal  0.465318 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3760  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.91 
 
 		 137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000181211  normal  0.0838449 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2849  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  56.56 
 
 		 134 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.10078  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0890  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.76 
 
 		 138 aa  138  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.245575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0736  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.47 
 
 		 134 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.564723  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00189  hypothetical protein  49.63 
 
 		 140 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.420944  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05388  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.37 
 
 		 137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1217  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.47 
 
 		 134 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29015  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1767  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  55.74 
 
 		 134 aa  137  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0678  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  55.74 
 
 		 134 aa  137  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.283064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1392  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  55.74 
 
 		 134 aa  137  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.367103  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0474  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  55.74 
 
 		 134 aa  137  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.578239  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0730  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.37 
 
 		 140 aa  138  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1858  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.39 
 
 		 135 aa  138  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102554  normal  0.117146 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1191  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  55.74 
 
 		 134 aa  137  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273593  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1388  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  55.74 
 
 		 134 aa  137  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1100  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.85 
 
 		 134 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4400  peptidyl-tRNA hydrolase domain-containing protein  48.15 
 
 		 137 aa  137  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.485154  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2742  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.18 
 
 		 134 aa  137  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464887 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1522  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.92 
 
 		 134 aa  137  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876893  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1617  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  55.38 
 
 		 134 aa  137  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.599417 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1100  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.85 
 
 		 134 aa  137  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.910918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2836  class I peptide chain release factor  47.06 
 
 		 137 aa  137  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0919  class I peptide chain release factor  51.56 
 
 		 136 aa  136  8.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2835  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  55.38 
 
 		 134 aa  136  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0215  Class I peptide chain release factor  51.16 
 
 		 132 aa  136  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0179  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.73 
 
 		 143 aa  136  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4325  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.66 
 
 		 134 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0375174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1036  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.15 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.501059  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1089  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.15 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.900586  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3412  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.15 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.44659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1772  Class I peptide chain release factor  54.41 
 
 		 139 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0992468  normal  0.67648 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2086  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.85 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2072  class I peptide chain release factor  49.23 
 
 		 138 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0774225  normal  0.971682 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1326  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  60.58 
 
 		 137 aa  133  8e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000388083  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0332  class I peptide chain release factor  52.99 
 
 		 140 aa  133  8e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1842  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.61 
 
 		 135 aa  133  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3102  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.27 
 
 		 144 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2298  class I peptide chain release factor  48.8 
 
 		 146 aa  130  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2737  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.63 
 
 		 169 aa  130  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0246  release factors family protein  56.92 
 
 		 134 aa  130  7.999999999999999e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02765  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.08 
 
 		 143 aa  130  9e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.489905  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0173  class I peptide chain release factor  44.53 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.221041  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.88 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3519  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.88 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.88 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1745  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  55.91 
 
 		 135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.41354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0281  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.93 
 
 		 140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0267  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.93 
 
 		 140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.122717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0278  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.93 
 
 		 140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292576  normal  0.437885 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0262  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.93 
 
 		 140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.430585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0262  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.93 
 
 		 140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.232254  normal  0.925704 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3468  class I peptide chain release factor  46.97 
 
 		 138 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0513  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.38 
 
 		 137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1609  class I peptide chain release factor  50.75 
 
 		 139 aa  125  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>